Protein–RNA interactions for Protein: O35245

Pkd2, Polycystin-2, mousemouse

Predictions only

Length 966 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkd2O35245 Dnaic2-202ENSMUST00000092469 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pkd2O35245 Acsl6-202ENSMUST00000064690 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pkd2O35245 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pkd2O35245 Sh3kbp1-201ENSMUST00000073094 2280 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pkd2O35245 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pkd2O35245 Matn2-203ENSMUST00000226766 3252 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Pkd2O35245 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pkd2O35245 H2-M3-201ENSMUST00000038580 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pkd2O35245 Ifi47-202ENSMUST00000109202 1773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pkd2O35245 Slc35b3-202ENSMUST00000167513 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pkd2O35245 Grpel1-201ENSMUST00000031099 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pkd2O35245 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pkd2O35245 Thy1-201ENSMUST00000114840 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pkd2O35245 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pkd2O35245 Sidt1-205ENSMUST00000136381 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pkd2O35245 Myocd-201ENSMUST00000101042 2585 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pkd2O35245 Gm4409-201ENSMUST00000130734 1919 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pkd2O35245 Rps10-202ENSMUST00000114881 604 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pkd2O35245 Gm11244-201ENSMUST00000121243 237 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Pkd2O35245 Gm26047-201ENSMUST00000157308 113 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Pkd2O35245 Mir7076-201ENSMUST00000183519 74 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Pkd2O35245 Gm37981-201ENSMUST00000194280 535 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Pkd2O35245 Gm26047-202ENSMUST00000198840 115 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Pkd2O35245 Gm43852-201ENSMUST00000202098 917 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Pkd2O35245 Gm45338-206ENSMUST00000211460 1155 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pkd2O35245 Myl6-211ENSMUST00000219236 692 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pkd2O35245 AC155712.2-201ENSMUST00000220398 643 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pkd2O35245 AC115122.1-201ENSMUST00000224850 1040 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Pkd2O35245 AC134869.3-201ENSMUST00000225581 343 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pkd2O35245 Nmur1-201ENSMUST00000027440 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pkd2O35245 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pkd2O35245 Lig1-210ENSMUST00000165964 3166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pkd2O35245 Slc44a2-201ENSMUST00000034697 3456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pkd2O35245 Ralbp1-202ENSMUST00000166543 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pkd2O35245 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pkd2O35245 Gm38089-201ENSMUST00000193585 1514 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Pkd2O35245 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pkd2O35245 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pkd2O35245 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pkd2O35245 1700047I17Rik2-201ENSMUST00000177978 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pkd2O35245 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pkd2O35245 Kcnab2-201ENSMUST00000030768 3533 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pkd2O35245 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pkd2O35245 4930486L24Rik-201ENSMUST00000091569 1432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pkd2O35245 6820426E19Rik-201ENSMUST00000204274 1970 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pkd2O35245 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pkd2O35245 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pkd2O35245 Bbip1-201ENSMUST00000135402 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pkd2O35245 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Pkd2O35245 Dusp6-204ENSMUST00000220291 2359 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pkd2O35245 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pkd2O35245 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pkd2O35245 Arhgap20-204ENSMUST00000130405 3881 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pkd2O35245 Rps9-204ENSMUST00000108625 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pkd2O35245 Rpsa-ps4-201ENSMUST00000121691 888 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Pkd2O35245 Gzmc-201ENSMUST00000015585 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pkd2O35245 Prss36-208ENSMUST00000156152 1132 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pkd2O35245 Gm44329-201ENSMUST00000197469 112 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Pkd2O35245 Pgpep1l-202ENSMUST00000207874 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pkd2O35245 Folr2-203ENSMUST00000210598 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pkd2O35245 CT485606.1-201ENSMUST00000213187 878 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Pkd2O35245 AC027700.1-201ENSMUST00000213965 370 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pkd2O35245 AC122350.1-201ENSMUST00000228135 533 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Pkd2O35245 Lst1-201ENSMUST00000097336 415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pkd2O35245 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pkd2O35245 Gm13553-201ENSMUST00000133025 1970 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pkd2O35245 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pkd2O35245 Osbp2-201ENSMUST00000070552 4097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pkd2O35245 AC122018.1-201ENSMUST00000217769 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pkd2O35245 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pkd2O35245 Ccndbp1-203ENSMUST00000099489 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pkd2O35245 Ubxn10-201ENSMUST00000105809 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pkd2O35245 Ttc8-201ENSMUST00000079146 2270 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pkd2O35245 Esco2-201ENSMUST00000022613 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pkd2O35245 Slc7a4-207ENSMUST00000172164 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pkd2O35245 Slc9a3-204ENSMUST00000225423 2589 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pkd2O35245 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pkd2O35245 Gm23272-201ENSMUST00000104053 129 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Pkd2O35245 Gm10961-201ENSMUST00000106703 144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pkd2O35245 Gm14071-201ENSMUST00000117817 509 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Pkd2O35245 Adap2os-201ENSMUST00000140556 984 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pkd2O35245 Ppp3cb-202ENSMUST00000159027 3831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pkd2O35245 Siglech-205ENSMUST00000165045 1062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pkd2O35245 Stx5a-219ENSMUST00000177373 995 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pkd2O35245 Plac9a-202ENSMUST00000183431 536 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pkd2O35245 Plac9b-204ENSMUST00000184675 536 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pkd2O35245 Gm3551-201ENSMUST00000190750 664 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Pkd2O35245 Gm44421-201ENSMUST00000205064 1221 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Pkd2O35245 Gm4657-201ENSMUST00000213839 787 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pkd2O35245 Rpp38-201ENSMUST00000062672 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pkd2O35245 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pkd2O35245 Prkag3-201ENSMUST00000081636 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pkd2O35245 Katnal2-207ENSMUST00000137354 1482 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pkd2O35245 Gm11413-201ENSMUST00000155822 1461 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pkd2O35245 Alox5-202ENSMUST00000164547 1854 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Pkd2O35245 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Pkd2O35245 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Pkd2O35245 4931406C07Rik-202ENSMUST00000178977 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Pkd2O35245 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Pkd2O35245 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.5 ms