Protein–RNA interactions for Protein: O08856

Ell, RNA polymerase II elongation factor ELL, mousemouse

Predictions only

Length 602 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EllO08856 Med1-202ENSMUST00000092735 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
EllO08856 Fbxo39-201ENSMUST00000108504 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
EllO08856 Vrk1-201ENSMUST00000021539 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
EllO08856 Apon-202ENSMUST00000218722 1747 ntAPPRIS P1 BASIC11.21□□□□□ -0.62
EllO08856 Nbeal2-211ENSMUST00000196488 8599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
EllO08856 Lgi4-201ENSMUST00000039775 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
EllO08856 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
EllO08856 Herc4-208ENSMUST00000219577 3914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
EllO08856 Sgk1-204ENSMUST00000120509 3096 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
EllO08856 Wnt3-201ENSMUST00000000127 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
EllO08856 Gm33831-201ENSMUST00000211696 1542 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
EllO08856 Fmo2-202ENSMUST00000111510 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
EllO08856 Mroh5-202ENSMUST00000110021 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
EllO08856 Got1l1-201ENSMUST00000038174 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
EllO08856 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
EllO08856 Gfap-201ENSMUST00000067444 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
EllO08856 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
EllO08856 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
EllO08856 Eno1-201ENSMUST00000080149 1902 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
EllO08856 Gm1667-201ENSMUST00000151651 558 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
EllO08856 Gm13523-201ENSMUST00000151820 488 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
EllO08856 Arid3b-204ENSMUST00000164010 1259 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
EllO08856 Ly6g5b-202ENSMUST00000172854 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
EllO08856 Rpl36-ps9-201ENSMUST00000196458 277 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
EllO08856 Gm18753-201ENSMUST00000201000 566 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
EllO08856 Olfr1380-201ENSMUST00000204300 938 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
EllO08856 Gm6108-201ENSMUST00000208365 367 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
EllO08856 AC099934.4-201ENSMUST00000220745 523 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
EllO08856 Olfr686-201ENSMUST00000050157 1018 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
EllO08856 Lrmda-201ENSMUST00000075639 908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
EllO08856 Rpl34-202ENSMUST00000079085 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
EllO08856 Akt2-201ENSMUST00000051356 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
EllO08856 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
EllO08856 Yaf2-201ENSMUST00000080299 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
EllO08856 Ugt1a8-201ENSMUST00000113139 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
EllO08856 Rbm10-207ENSMUST00000177738 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
EllO08856 Flywch1-201ENSMUST00000045517 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
EllO08856 Rbm10-201ENSMUST00000064911 2793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
EllO08856 Map7-202ENSMUST00000116259 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
EllO08856 Plrg1-202ENSMUST00000122128 1608 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
EllO08856 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
EllO08856 Gm43051-201ENSMUST00000201096 2678 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
EllO08856 2310043M15Rik-201ENSMUST00000180967 1580 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
EllO08856 Rapgef3-204ENSMUST00000128775 3586 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
EllO08856 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
EllO08856 Klhdc7b-202ENSMUST00000225666 3951 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
EllO08856 Fxyd5-212ENSMUST00000162733 2998 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
EllO08856 Gm15997-201ENSMUST00000202188 1491 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
EllO08856 4930588G17Rik-201ENSMUST00000208075 1474 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
EllO08856 Fndc3b-201ENSMUST00000046157 6875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
EllO08856 Prc1-206ENSMUST00000173824 2912 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
EllO08856 Axl-202ENSMUST00000085948 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
EllO08856 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
EllO08856 9330111N05Rik-203ENSMUST00000181508 1848 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
EllO08856 Trim46-202ENSMUST00000090924 2721 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
EllO08856 Kdm2b-203ENSMUST00000086200 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
EllO08856 Dis3l-208ENSMUST00000168844 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
EllO08856 Plcd1-201ENSMUST00000010804 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
EllO08856 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
EllO08856 AC122860.2-201ENSMUST00000217967 2671 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
EllO08856 Zeb2-201ENSMUST00000028229 5335 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
EllO08856 Uba6-202ENSMUST00000113373 3504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
EllO08856 Stim1-209ENSMUST00000211457 2183 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
EllO08856 Mdh1b-201ENSMUST00000114094 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
EllO08856 Rbm47-204ENSMUST00000113726 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
EllO08856 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
EllO08856 Snap29-201ENSMUST00000023449 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
EllO08856 Gltp-202ENSMUST00000112212 799 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
EllO08856 Clps-202ENSMUST00000114785 369 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
EllO08856 Gm13916-201ENSMUST00000117368 628 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
EllO08856 Hspb9-202ENSMUST00000169833 726 ntAPPRIS P2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
EllO08856 1110038B12Rik-208ENSMUST00000174714 520 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
EllO08856 Mir5132-201ENSMUST00000175166 71 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
EllO08856 Hcfc1r1-203ENSMUST00000180140 693 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
EllO08856 Gm37634-201ENSMUST00000195700 650 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
EllO08856 4930477O15Rik-201ENSMUST00000196484 1089 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
EllO08856 4930479H17Rik-201ENSMUST00000208824 292 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
EllO08856 AC167229.2-201ENSMUST00000218902 675 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
EllO08856 Lect2-202ENSMUST00000225183 823 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
EllO08856 CT009713.8-201ENSMUST00000225448 560 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
EllO08856 Immp1l-201ENSMUST00000037499 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
EllO08856 Lcn8-201ENSMUST00000038482 651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
EllO08856 Lect2-201ENSMUST00000062806 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
EllO08856 H3f3a-201ENSMUST00000081026 888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
EllO08856 Krtap19-1-201ENSMUST00000081334 493 ntAPPRIS P1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
EllO08856 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
EllO08856 Paqr5-201ENSMUST00000034817 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
EllO08856 Fam198a-203ENSMUST00000214536 2789 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
EllO08856 Tapbpl-201ENSMUST00000043422 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
EllO08856 Awat2-202ENSMUST00000147103 1984 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
EllO08856 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
EllO08856 Rin3-201ENSMUST00000056950 3892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
EllO08856 Gm38089-201ENSMUST00000193585 1514 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
EllO08856 Ddx46-201ENSMUST00000099479 5664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
EllO08856 Coro6-202ENSMUST00000052515 1476 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
EllO08856 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
EllO08856 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
EllO08856 Ppp3r1-201ENSMUST00000102880 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
EllO08856 Cd72-205ENSMUST00000107926 1419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
EllO08856 Cd72-203ENSMUST00000098105 1420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms