Protein–RNA interactions for Protein: J3QM54

Gm3727, Predicted gene 3727, mousemouse

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Length 205 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3727J3QM54 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm3727J3QM54 Scyl2-204ENSMUST00000174252 4817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm3727J3QM54 0610038B21Rik-201ENSMUST00000181420 1687 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm3727J3QM54 Asb1-201ENSMUST00000027538 5826 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm3727J3QM54 Olfr239-202ENSMUST00000213731 3690 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm3727J3QM54 Nrap-204ENSMUST00000166203 5079 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm3727J3QM54 Gm29895-201ENSMUST00000209933 5652 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm3727J3QM54 Rpap1-201ENSMUST00000048493 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm3727J3QM54 Asb6-201ENSMUST00000041726 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm3727J3QM54 Slc19a1-209ENSMUST00000144234 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm3727J3QM54 Zfp93-201ENSMUST00000032696 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm3727J3QM54 Bcl9l-203ENSMUST00000218183 6771 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm3727J3QM54 Tom1l2-206ENSMUST00000102683 4999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm3727J3QM54 Tardbp-206ENSMUST00000105702 6425 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm3727J3QM54 Src-204ENSMUST00000109531 3586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm3727J3QM54 Gaa-201ENSMUST00000026666 3363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm3727J3QM54 Ddx55-201ENSMUST00000071057 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm3727J3QM54 Gm29358-202ENSMUST00000187941 3227 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm3727J3QM54 Myo15b-201ENSMUST00000040703 2825 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm3727J3QM54 Ak8-201ENSMUST00000074156 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm3727J3QM54 Rps6ka1-209ENSMUST00000174481 2228 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm3727J3QM54 Tacr1-201ENSMUST00000032122 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm3727J3QM54 Pisd-203ENSMUST00000120591 2491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Gm3727J3QM54 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm3727J3QM54 4933440M02Rik-202ENSMUST00000205794 1601 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm3727J3QM54 Gphb5-201ENSMUST00000051079 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm3727J3QM54 Nup50-201ENSMUST00000165443 4741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm3727J3QM54 Muc3-201ENSMUST00000041226 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm3727J3QM54 Flvcr2-201ENSMUST00000040461 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm3727J3QM54 Jmjd4-201ENSMUST00000045279 4315 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm3727J3QM54 Gm26642-201ENSMUST00000180981 2782 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm3727J3QM54 Pde6b-201ENSMUST00000031456 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm3727J3QM54 Tnfsf13b-203ENSMUST00000207792 4771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm3727J3QM54 U2af1l4-237ENSMUST00000167042 3007 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
Gm3727J3QM54 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm3727J3QM54 Hhip-201ENSMUST00000079038 9074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm3727J3QM54 Pdp2-201ENSMUST00000059588 5692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm3727J3QM54 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm3727J3QM54 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Gm3727J3QM54 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Gm3727J3QM54 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm3727J3QM54 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC10□□□□□ -0.81
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Gm3727J3QM54 Gm44793-201ENSMUST00000136923 582 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
Gm3727J3QM54 Gm13966-201ENSMUST00000148420 832 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
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Gm3727J3QM54 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Gm3727J3QM54 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Gm3727J3QM54 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Gm3727J3QM54 Gm5781-201ENSMUST00000219792 443 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Gm3727J3QM54 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm3727J3QM54 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm3727J3QM54 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm3727J3QM54 Gm10254-201ENSMUST00000052888 867 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Gm3727J3QM54 Cd37-202ENSMUST00000098461 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm3727J3QM54 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm3727J3QM54 Zcwpw1-201ENSMUST00000035852 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
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Gm3727J3QM54 Gm11696-203ENSMUST00000188296 1793 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
Gm3727J3QM54 Apol7a-203ENSMUST00000175919 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm3727J3QM54 Kdm4a-204ENSMUST00000106406 4663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
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Gm3727J3QM54 Bahcc1-203ENSMUST00000122148 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm3727J3QM54 Exoc4-203ENSMUST00000115080 2369 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
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Gm3727J3QM54 Gm5740-201ENSMUST00000211003 1857 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Gm3727J3QM54 1110051M20Rik-201ENSMUST00000064652 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm3727J3QM54 Car12-202ENSMUST00000085420 3639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm3727J3QM54 Grem1-201ENSMUST00000099575 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm3727J3QM54 Rad51ap2-201ENSMUST00000124065 3175 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
Gm3727J3QM54 Ctsb-201ENSMUST00000006235 4743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm3727J3QM54 Ppp1r10-201ENSMUST00000087210 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm3727J3QM54 Tob2-201ENSMUST00000050467 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm3727J3QM54 Gm9035-201ENSMUST00000218318 1697 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm3727J3QM54 Dip2a-205ENSMUST00000160048 6551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm3727J3QM54 Samd4-206ENSMUST00000137543 6874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm3727J3QM54 Dmbx1-203ENSMUST00000124071 4017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm3727J3QM54 Brat1-201ENSMUST00000041588 3333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm3727J3QM54 Arg1-201ENSMUST00000020161 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm3727J3QM54 Pkn3-201ENSMUST00000045246 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm3727J3QM54 Ccdc24-206ENSMUST00000164853 3990 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm3727J3QM54 Gabre-201ENSMUST00000064780 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm3727J3QM54 Pcdhgb8-201ENSMUST00000195764 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm3727J3QM54 Pik3r5-201ENSMUST00000021283 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm3727J3QM54 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm3727J3QM54 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm3727J3QM54 Mia-202ENSMUST00000121848 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
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