Protein–RNA interactions for Protein: J3KMS6

Gm21818, MCG122238, isoform CRA_a, mousemouse

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Length 170 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21818J3KMS6 Borcs7-201ENSMUST00000074912 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm21818J3KMS6 Akp-ps1-201ENSMUST00000188050 1600 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm21818J3KMS6 Cyp26b1-202ENSMUST00000168003 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm21818J3KMS6 Cyp26b1-201ENSMUST00000077705 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm21818J3KMS6 Gm20658-201ENSMUST00000175871 1489 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm21818J3KMS6 Zfp639-201ENSMUST00000029203 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm21818J3KMS6 AU019823-201ENSMUST00000131351 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm21818J3KMS6 Usp44-201ENSMUST00000095333 2946 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm21818J3KMS6 Gm45677-201ENSMUST00000209975 1341 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm21818J3KMS6 Gm21939-201ENSMUST00000221137 2773 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm21818J3KMS6 Stom-201ENSMUST00000028241 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm21818J3KMS6 Mfsd4b5-203ENSMUST00000164566 2372 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm21818J3KMS6 Htr1b-202ENSMUST00000183482 4724 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm21818J3KMS6 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm21818J3KMS6 Fam84a-201ENSMUST00000020926 4164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm21818J3KMS6 Nnt-201ENSMUST00000069902 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm21818J3KMS6 Epn3-202ENSMUST00000127305 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm21818J3KMS6 Topors-201ENSMUST00000042575 3856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm21818J3KMS6 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm21818J3KMS6 Gm34425-201ENSMUST00000216269 3079 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm21818J3KMS6 Aicda-201ENSMUST00000043301 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm21818J3KMS6 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm21818J3KMS6 Gm23912-201ENSMUST00000104687 87 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm21818J3KMS6 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm21818J3KMS6 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm21818J3KMS6 Gm27023-201ENSMUST00000182372 285 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm21818J3KMS6 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm21818J3KMS6 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm21818J3KMS6 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm21818J3KMS6 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm21818J3KMS6 Pcgf5-203ENSMUST00000224679 1269 ntAPPRIS P5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm21818J3KMS6 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm21818J3KMS6 Krtap4-7-201ENSMUST00000055121 984 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm21818J3KMS6 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm21818J3KMS6 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm21818J3KMS6 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm21818J3KMS6 Dmp1-201ENSMUST00000066708 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm21818J3KMS6 Radil-203ENSMUST00000110784 3106 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm21818J3KMS6 Hyal3-202ENSMUST00000148440 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm21818J3KMS6 Ddx55-202ENSMUST00000111438 2737 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm21818J3KMS6 Mospd2-203ENSMUST00000112248 2487 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm21818J3KMS6 Gm13142-201ENSMUST00000117213 1453 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm21818J3KMS6 Trit1-201ENSMUST00000102649 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm21818J3KMS6 Olfr1419-202ENSMUST00000213954 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm21818J3KMS6 Sel1l-201ENSMUST00000021347 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm21818J3KMS6 Zmiz2-205ENSMUST00000109787 4116 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm21818J3KMS6 Ranbp10-201ENSMUST00000041400 5308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm21818J3KMS6 Trip4-202ENSMUST00000119245 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm21818J3KMS6 Tubgcp4-201ENSMUST00000039541 4206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm21818J3KMS6 Gm38140-201ENSMUST00000193617 2755 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm21818J3KMS6 Mxd3-201ENSMUST00000021941 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm21818J3KMS6 Sel1l-204ENSMUST00000167466 5544 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm21818J3KMS6 Wdr43-201ENSMUST00000047086 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm21818J3KMS6 Fxyd5-212ENSMUST00000162733 2998 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm21818J3KMS6 Gstcd-201ENSMUST00000029651 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm21818J3KMS6 Tcf4-252ENSMUST00000202477 1873 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm21818J3KMS6 Dbh-201ENSMUST00000000910 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm21818J3KMS6 Plxna4os1-201ENSMUST00000150314 1977 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm21818J3KMS6 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm21818J3KMS6 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm21818J3KMS6 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm21818J3KMS6 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
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Gm21818J3KMS6 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm21818J3KMS6 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
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Gm21818J3KMS6 Mt3-203ENSMUST00000211930 477 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
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Gm21818J3KMS6 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm21818J3KMS6 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm21818J3KMS6 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm21818J3KMS6 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm21818J3KMS6 Gm9823-201ENSMUST00000051212 327 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm21818J3KMS6 Clcn4-201ENSMUST00000000619 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm21818J3KMS6 Xkr6-202ENSMUST00000120820 1702 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm21818J3KMS6 Phyhipl-201ENSMUST00000046513 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm21818J3KMS6 Trak1-201ENSMUST00000045903 4827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm21818J3KMS6 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm21818J3KMS6 Gm43773-201ENSMUST00000198548 2162 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm21818J3KMS6 Gabrr1-201ENSMUST00000029947 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm21818J3KMS6 Gm13990-201ENSMUST00000151391 2701 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm21818J3KMS6 Hbs1l-209ENSMUST00000219915 2733 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm21818J3KMS6 Exosc1-202ENSMUST00000112123 1499 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm21818J3KMS6 Rgs11-201ENSMUST00000025020 2006 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm21818J3KMS6 Sp100-213ENSMUST00000155094 1666 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm21818J3KMS6 Rbm4b-201ENSMUST00000036744 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm21818J3KMS6 Snap29-201ENSMUST00000023449 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm21818J3KMS6 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm21818J3KMS6 Wdr75-201ENSMUST00000027139 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm21818J3KMS6 Gtf3c1-204ENSMUST00000205659 6570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm21818J3KMS6 Nnt-203ENSMUST00000109204 3198 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm21818J3KMS6 Asb7-202ENSMUST00000124899 4928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm21818J3KMS6 Prx-201ENSMUST00000065487 4497 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm21818J3KMS6 B3glct-201ENSMUST00000100404 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm21818J3KMS6 Fbxo43-201ENSMUST00000058643 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
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