Protein–RNA interactions for Protein: G3XA52

Vmn1r34, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 309 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r34G3XA52 Zfp36l1-ps-201ENSMUST00000118349 899 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Vmn1r34G3XA52 Mcfd2-205ENSMUST00000145895 751 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Vmn1r34G3XA52 Mcpt8-201ENSMUST00000015594 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Vmn1r34G3XA52 Gm8815-201ENSMUST00000173809 620 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Vmn1r34G3XA52 Stx5a-219ENSMUST00000177373 995 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Vmn1r34G3XA52 Gm4310-201ENSMUST00000177847 889 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Vmn1r34G3XA52 Gm28778-201ENSMUST00000190734 785 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Vmn1r34G3XA52 Gm33222-201ENSMUST00000193725 654 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Vmn1r34G3XA52 Gm38117-201ENSMUST00000194653 939 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Vmn1r34G3XA52 Gm37466-201ENSMUST00000195692 652 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Vmn1r34G3XA52 Nkg7-203ENSMUST00000206741 686 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Vmn1r34G3XA52 Mettl6-204ENSMUST00000227595 1027 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Vmn1r34G3XA52 Cmtm2b-201ENSMUST00000041973 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Vmn1r34G3XA52 1110025L11Rik-201ENSMUST00000089104 591 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Vmn1r34G3XA52 Slc44a2-201ENSMUST00000034697 3456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Vmn1r34G3XA52 Arhgap1-202ENSMUST00000111329 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Vmn1r34G3XA52 Kif1a-203ENSMUST00000171556 5391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Vmn1r34G3XA52 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Vmn1r34G3XA52 Pcdhb17-201ENSMUST00000053856 4660 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Vmn1r34G3XA52 Mki67-201ENSMUST00000033310 10061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Vmn1r34G3XA52 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Vmn1r34G3XA52 Jak3-201ENSMUST00000051995 4019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Vmn1r34G3XA52 Riox2-206ENSMUST00000160571 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Vmn1r34G3XA52 Maml2-202ENSMUST00000159294 6404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Vmn1r34G3XA52 Kcnab2-201ENSMUST00000030768 3533 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Vmn1r34G3XA52 Epb41l1-203ENSMUST00000103136 6249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Vmn1r34G3XA52 Nfic-203ENSMUST00000105321 6237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Vmn1r34G3XA52 Eif2s1-201ENSMUST00000071230 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Vmn1r34G3XA52 Rgr-203ENSMUST00000225070 4704 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Vmn1r34G3XA52 Qrsl1-201ENSMUST00000020012 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Vmn1r34G3XA52 1300017J02Rik-202ENSMUST00000123530 1874 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Vmn1r34G3XA52 Tcf4-252ENSMUST00000202477 1873 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Vmn1r34G3XA52 Msra-201ENSMUST00000067927 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Vmn1r34G3XA52 Lcmt2-202ENSMUST00000110674 3056 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Vmn1r34G3XA52 Cnot7-211ENSMUST00000149992 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Vmn1r34G3XA52 Tpra1-218ENSMUST00000203185 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Vmn1r34G3XA52 Cacna1s-201ENSMUST00000112064 6251 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Vmn1r34G3XA52 Slc25a40-201ENSMUST00000066921 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Vmn1r34G3XA52 Pcdhga6-201ENSMUST00000195823 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Vmn1r34G3XA52 Spata20-201ENSMUST00000041705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Vmn1r34G3XA52 Slc2a7-201ENSMUST00000059893 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Vmn1r34G3XA52 Il22ra1-201ENSMUST00000102546 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Vmn1r34G3XA52 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Vmn1r34G3XA52 Strada-202ENSMUST00000103072 1517 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Vmn1r34G3XA52 Rbm47-209ENSMUST00000201544 5211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Vmn1r34G3XA52 Myl4-202ENSMUST00000106956 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Vmn1r34G3XA52 Gm11568-201ENSMUST00000107434 1145 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Vmn1r34G3XA52 Cstl1-201ENSMUST00000109952 629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Vmn1r34G3XA52 Gltp-202ENSMUST00000112212 799 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Vmn1r34G3XA52 Gm11450-201ENSMUST00000121144 333 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Vmn1r34G3XA52 Prdx5-203ENSMUST00000149261 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Vmn1r34G3XA52 Gm26047-201ENSMUST00000157308 113 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Vmn1r34G3XA52 Chtf8-203ENSMUST00000176090 615 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Vmn1r34G3XA52 Gm17087-201ENSMUST00000184183 471 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Vmn1r34G3XA52 Gm19744-202ENSMUST00000186135 948 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Vmn1r34G3XA52 Myl4-201ENSMUST00000018800 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Vmn1r34G3XA52 Ighv1-48-201ENSMUST00000191795 294 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Vmn1r34G3XA52 Gm26047-202ENSMUST00000198840 115 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Vmn1r34G3XA52 Gm6450-201ENSMUST00000200896 574 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Vmn1r34G3XA52 Gm43050-202ENSMUST00000201152 651 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Vmn1r34G3XA52 AC113082.1-201ENSMUST00000217324 327 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Vmn1r34G3XA52 AC151275.1-201ENSMUST00000224870 585 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Vmn1r34G3XA52 Nmral1-201ENSMUST00000074970 1155 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Vmn1r34G3XA52 Lrmda-201ENSMUST00000075639 908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Vmn1r34G3XA52 Rpl9-ps6-201ENSMUST00000078034 691 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Vmn1r34G3XA52 Rpl34-202ENSMUST00000079085 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Vmn1r34G3XA52 Gm5537-201ENSMUST00000091117 1252 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Vmn1r34G3XA52 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Vmn1r34G3XA52 Lrfn5-201ENSMUST00000055815 4410 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Vmn1r34G3XA52 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Vmn1r34G3XA52 Fbn2-201ENSMUST00000025497 10480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Vmn1r34G3XA52 Tmem237-202ENSMUST00000094917 1869 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Vmn1r34G3XA52 E330021D16Rik-203ENSMUST00000204830 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Vmn1r34G3XA52 Tmem8b-201ENSMUST00000107864 4726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Vmn1r34G3XA52 Trpv4-205ENSMUST00000112225 3226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Vmn1r34G3XA52 Fam177a-201ENSMUST00000177768 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Vmn1r34G3XA52 Nfe2l1-211ENSMUST00000167149 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Vmn1r34G3XA52 Tfdp1-201ENSMUST00000170909 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Vmn1r34G3XA52 Slc6a18-204ENSMUST00000220650 1728 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Vmn1r34G3XA52 Cdc14a-201ENSMUST00000090464 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Vmn1r34G3XA52 Wdr59-202ENSMUST00000038193 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Vmn1r34G3XA52 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Vmn1r34G3XA52 Rgs6-211ENSMUST00000191107 1621 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Vmn1r34G3XA52 Herc3-201ENSMUST00000031823 3596 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Vmn1r34G3XA52 Eif4a2-223ENSMUST00000168891 2203 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Vmn1r34G3XA52 Zfp639-201ENSMUST00000029203 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Vmn1r34G3XA52 Sspn-201ENSMUST00000032383 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Vmn1r34G3XA52 Rab11fip1-203ENSMUST00000209377 3769 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Vmn1r34G3XA52 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Vmn1r34G3XA52 Ttc29-202ENSMUST00000109902 1416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Vmn1r34G3XA52 5430405H02Rik-201ENSMUST00000153616 1431 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Vmn1r34G3XA52 Gm29771-201ENSMUST00000193142 1423 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Vmn1r34G3XA52 6030466F02Rik-201ENSMUST00000212339 1434 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Vmn1r34G3XA52 Gm7104-201ENSMUST00000179741 2532 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Vmn1r34G3XA52 Rab10os-203ENSMUST00000178074 4006 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Vmn1r34G3XA52 Rab11fip5-201ENSMUST00000060837 4035 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Vmn1r34G3XA52 P4ha1-203ENSMUST00000105466 2918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Vmn1r34G3XA52 Man2c1-215ENSMUST00000161182 2909 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Vmn1r34G3XA52 Ophn1-201ENSMUST00000033560 7170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Vmn1r34G3XA52 Zbtb45-205ENSMUST00000210282 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
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