Protein–RNA interactions for Protein: F7BCN0

Gm28048, Predicted gene, 28048 (Fragment), mousemouse

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Length 99 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28048F7BCN0 Vps54-201ENSMUST00000006221 4323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Gm28048F7BCN0 Jam3-201ENSMUST00000034472 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Gm28048F7BCN0 Cdc42ep4-201ENSMUST00000053536 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Gm28048F7BCN0 Immt-202ENSMUST00000101301 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm28048F7BCN0 Srebf1-201ENSMUST00000020846 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm28048F7BCN0 AC126257.1-201ENSMUST00000213195 1536 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm28048F7BCN0 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm28048F7BCN0 Slc17a5-202ENSMUST00000117645 3114 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm28048F7BCN0 Dcaf12l1-202ENSMUST00000115056 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm28048F7BCN0 Ikbkg-205ENSMUST00000114129 2222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm28048F7BCN0 Fmnl1-207ENSMUST00000218163 3824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm28048F7BCN0 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm28048F7BCN0 Camk1d-201ENSMUST00000044009 6962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm28048F7BCN0 Lnx1-203ENSMUST00000113531 3098 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm28048F7BCN0 Sptan1-204ENSMUST00000113717 7958 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm28048F7BCN0 Edil3-202ENSMUST00000081769 5317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm28048F7BCN0 Zbtb45-205ENSMUST00000210282 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm28048F7BCN0 Kat7-203ENSMUST00000103159 3248 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm28048F7BCN0 H2-T10-201ENSMUST00000166442 1481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm28048F7BCN0 Gm38292-201ENSMUST00000192646 3045 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm28048F7BCN0 Epn3-202ENSMUST00000127305 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm28048F7BCN0 Bzw1-201ENSMUST00000050552 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm28048F7BCN0 Ptgfr-201ENSMUST00000029670 6624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm28048F7BCN0 Slc25a45-206ENSMUST00000155697 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm28048F7BCN0 Gm36957-201ENSMUST00000192982 2824 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm28048F7BCN0 Snx13-202ENSMUST00000163677 3681 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm28048F7BCN0 Jaml-201ENSMUST00000050020 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm28048F7BCN0 Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm28048F7BCN0 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
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Gm28048F7BCN0 Srrm3os-201ENSMUST00000131896 1271 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm28048F7BCN0 Gm3890-201ENSMUST00000182416 207 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm28048F7BCN0 Gm6114-201ENSMUST00000182472 968 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
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Gm28048F7BCN0 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm28048F7BCN0 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm28048F7BCN0 4930504D19Rik-201ENSMUST00000204799 349 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
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Gm28048F7BCN0 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm28048F7BCN0 Larp7-201ENSMUST00000029588 2121 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm28048F7BCN0 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm28048F7BCN0 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm28048F7BCN0 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm28048F7BCN0 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm28048F7BCN0 Dscaml1-201ENSMUST00000034592 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm28048F7BCN0 Mad1l1-201ENSMUST00000031534 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm28048F7BCN0 Nr5a1-201ENSMUST00000028084 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm28048F7BCN0 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm28048F7BCN0 Tspan32-201ENSMUST00000009396 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
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Gm28048F7BCN0 Pias2-203ENSMUST00000168882 4984 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm28048F7BCN0 F830115B05Rik-201ENSMUST00000197638 1894 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm28048F7BCN0 Mfsd13b-201ENSMUST00000033166 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm28048F7BCN0 Tiam1-203ENSMUST00000114122 4596 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm28048F7BCN0 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm28048F7BCN0 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm28048F7BCN0 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm28048F7BCN0 Spag16-202ENSMUST00000113940 3559 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
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Gm28048F7BCN0 Thbs2-201ENSMUST00000170872 5922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
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Gm28048F7BCN0 Susd4-201ENSMUST00000085724 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm28048F7BCN0 Fthl17d-201ENSMUST00000105004 856 ntAPPRIS P1 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm28048F7BCN0 Tpm1-207ENSMUST00000113687 962 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
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Gm28048F7BCN0 Ccnk-202ENSMUST00000221167 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm28048F7BCN0 Txlna-201ENSMUST00000046425 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm28048F7BCN0 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm28048F7BCN0 Olfr311-201ENSMUST00000071625 927 ntAPPRIS P1 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm28048F7BCN0 Ncor2-202ENSMUST00000086083 8575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm28048F7BCN0 Erlin2-201ENSMUST00000033873 4838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm28048F7BCN0 Itgal-204ENSMUST00000120857 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm28048F7BCN0 Tcp11l2-201ENSMUST00000020223 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm28048F7BCN0 Ttll10-206ENSMUST00000184348 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm28048F7BCN0 Hvcn1-202ENSMUST00000100747 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm28048F7BCN0 Armc3-202ENSMUST00000114640 2818 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm28048F7BCN0 Zmym3-205ENSMUST00000119699 1750 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm28048F7BCN0 Gm2673-201ENSMUST00000120958 1608 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm28048F7BCN0 Csf1r-202ENSMUST00000115268 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm28048F7BCN0 Dctn1-205ENSMUST00000113919 4292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm28048F7BCN0 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm28048F7BCN0 Ttc30b-201ENSMUST00000099996 2737 ntAPPRIS P1 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm28048F7BCN0 Rad51ap1-202ENSMUST00000112221 1871 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm28048F7BCN0 Gm12200-201ENSMUST00000144876 1858 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm28048F7BCN0 Aldh16a1-206ENSMUST00000209963 3537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm28048F7BCN0 Nmrk1-203ENSMUST00000159572 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
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