Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1M3

Gm3250, Predicted gene 3250, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3250E9Q1M3 Lgi3-203ENSMUST00000226548 1001 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Gm3250E9Q1M3 Vmn1r36-202ENSMUST00000226635 918 ntAPPRIS P2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Gm3250E9Q1M3 Npff-201ENSMUST00000023814 540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Gm3250E9Q1M3 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Gm3250E9Q1M3 Olfr729-201ENSMUST00000061020 972 ntAPPRIS P1 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Gm3250E9Q1M3 B230118H07Rik-201ENSMUST00000090513 969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Gm3250E9Q1M3 Tbcel-206ENSMUST00000138506 1534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Gm3250E9Q1M3 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Gm3250E9Q1M3 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Gm3250E9Q1M3 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Gm3250E9Q1M3 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Gm3250E9Q1M3 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Gm3250E9Q1M3 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Gm3250E9Q1M3 Tmem25-202ENSMUST00000114705 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Gm3250E9Q1M3 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Gm3250E9Q1M3 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Gm3250E9Q1M3 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Gm3250E9Q1M3 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Gm3250E9Q1M3 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Gm3250E9Q1M3 Gm8024-201ENSMUST00000167099 1408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Gm3250E9Q1M3 Gm37370-201ENSMUST00000191996 1410 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Gm3250E9Q1M3 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Gm3250E9Q1M3 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Gm3250E9Q1M3 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Gm3250E9Q1M3 Hist2h4-201ENSMUST00000171473 1630 ntAPPRIS P1 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Gm3250E9Q1M3 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm3250E9Q1M3 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm3250E9Q1M3 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm3250E9Q1M3 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm3250E9Q1M3 Mff-209ENSMUST00000160972 1358 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm3250E9Q1M3 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm3250E9Q1M3 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm3250E9Q1M3 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm3250E9Q1M3 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm3250E9Q1M3 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm3250E9Q1M3 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm3250E9Q1M3 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm3250E9Q1M3 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm3250E9Q1M3 Gcg-201ENSMUST00000102733 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm3250E9Q1M3 Gm24934-201ENSMUST00000103764 111 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm3250E9Q1M3 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm3250E9Q1M3 Gm12579-201ENSMUST00000118040 783 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm3250E9Q1M3 Gm14724-201ENSMUST00000118400 537 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm3250E9Q1M3 Gm15352-201ENSMUST00000118696 270 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm3250E9Q1M3 Tex35-203ENSMUST00000119526 679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm3250E9Q1M3 Gm16420-201ENSMUST00000120258 856 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm3250E9Q1M3 Cntrobos-201ENSMUST00000132834 383 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm3250E9Q1M3 Gm14024-201ENSMUST00000141964 560 ntTSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm3250E9Q1M3 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm3250E9Q1M3 Fam184a-206ENSMUST00000169866 501 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm3250E9Q1M3 Taar8c-201ENSMUST00000170267 1035 ntAPPRIS P1 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm3250E9Q1M3 Gm20414-201ENSMUST00000172918 646 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm3250E9Q1M3 Gm26974-201ENSMUST00000182054 875 ntTSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm3250E9Q1M3 Mir6407-201ENSMUST00000184510 101 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm3250E9Q1M3 Gm27149-201ENSMUST00000184716 1266 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm3250E9Q1M3 2310034O05Rik-201ENSMUST00000185221 1107 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm3250E9Q1M3 A930005H10Rik-204ENSMUST00000185681 625 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm3250E9Q1M3 Tex35-206ENSMUST00000187546 856 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm3250E9Q1M3 A930005H10Rik-206ENSMUST00000188260 739 ntTSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm3250E9Q1M3 Gm42603-201ENSMUST00000199893 2146 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm3250E9Q1M3 Gm38395-201ENSMUST00000199904 830 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm3250E9Q1M3 Chn2-212ENSMUST00000204115 783 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm3250E9Q1M3 Gm8952-201ENSMUST00000206828 1102 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm3250E9Q1M3 Ssr4-201ENSMUST00000002090 765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm3250E9Q1M3 Gm45410-201ENSMUST00000211331 1093 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm3250E9Q1M3 Gm7333-201ENSMUST00000213449 1060 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm3250E9Q1M3 AC164087.2-201ENSMUST00000216206 1072 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm3250E9Q1M3 Gm3285-201ENSMUST00000218443 908 ntAPPRIS P1 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm3250E9Q1M3 CT010462.1-201ENSMUST00000220554 1200 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm3250E9Q1M3 Gm40879-201ENSMUST00000220759 612 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm3250E9Q1M3 Gm18968-201ENSMUST00000221319 862 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm3250E9Q1M3 Gm46400-201ENSMUST00000222294 724 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm3250E9Q1M3 Ms4a8a-201ENSMUST00000025636 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm3250E9Q1M3 Taar8a-201ENSMUST00000051133 1035 ntAPPRIS P1 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm3250E9Q1M3 Cdkn3-201ENSMUST00000067426 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm3250E9Q1M3 Olfr1100-201ENSMUST00000094913 969 ntAPPRIS P1 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm3250E9Q1M3 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm3250E9Q1M3 Lynx1-201ENSMUST00000023259 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm3250E9Q1M3 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm3250E9Q1M3 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm3250E9Q1M3 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm3250E9Q1M3 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm3250E9Q1M3 Zfp286-211ENSMUST00000207597 1668 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm3250E9Q1M3 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm3250E9Q1M3 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm3250E9Q1M3 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm3250E9Q1M3 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm3250E9Q1M3 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm3250E9Q1M3 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm3250E9Q1M3 Oprm1-203ENSMUST00000056385 1440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm3250E9Q1M3 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm3250E9Q1M3 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm3250E9Q1M3 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm3250E9Q1M3 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm3250E9Q1M3 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm3250E9Q1M3 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm3250E9Q1M3 Vmac-202ENSMUST00000164907 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm3250E9Q1M3 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm3250E9Q1M3 Gm44843-201ENSMUST00000208320 1396 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm3250E9Q1M3 Slc37a4-202ENSMUST00000213268 1353 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
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