Protein–RNA interactions for Protein: D3YZI9

Pgbd5, PiggyBac transposable element-derived protein 5, mousemouse

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Length 523 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pgbd5D3YZI9 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pgbd5D3YZI9 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pgbd5D3YZI9 Rnf225-201ENSMUST00000045870 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pgbd5D3YZI9 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Pgbd5D3YZI9 Abcd3-201ENSMUST00000029770 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pgbd5D3YZI9 Tmppe-201ENSMUST00000111820 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pgbd5D3YZI9 Gm5380-201ENSMUST00000119296 2136 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Pgbd5D3YZI9 E130018N17Rik-201ENSMUST00000129713 1309 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pgbd5D3YZI9 Capn3-205ENSMUST00000110719 2778 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pgbd5D3YZI9 Mapt-204ENSMUST00000106992 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pgbd5D3YZI9 Slc25a24-201ENSMUST00000029477 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pgbd5D3YZI9 Gm37131-201ENSMUST00000192502 1561 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Pgbd5D3YZI9 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pgbd5D3YZI9 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pgbd5D3YZI9 Tinf2-201ENSMUST00000007733 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pgbd5D3YZI9 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pgbd5D3YZI9 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Pgbd5D3YZI9 Ccdc163-202ENSMUST00000106462 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Pgbd5D3YZI9 Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Pgbd5D3YZI9 Tnfsf13b-201ENSMUST00000033892 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Pgbd5D3YZI9 Cep41-203ENSMUST00000115131 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Pgbd5D3YZI9 Arhgef10l-202ENSMUST00000069623 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pgbd5D3YZI9 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Pgbd5D3YZI9 Vsx2-202ENSMUST00000169934 3249 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pgbd5D3YZI9 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pgbd5D3YZI9 Gatad2a-201ENSMUST00000065169 3812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pgbd5D3YZI9 4930588G17Rik-201ENSMUST00000208075 1474 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Pgbd5D3YZI9 Nphs1os-201ENSMUST00000152625 1339 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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Pgbd5D3YZI9 Hmgn3-201ENSMUST00000161796 862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pgbd5D3YZI9 Isl1-202ENSMUST00000176044 1198 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pgbd5D3YZI9 Gm21092-201ENSMUST00000178995 955 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Pgbd5D3YZI9 Ighv5-11-201ENSMUST00000193354 371 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Pgbd5D3YZI9 Gm42657-201ENSMUST00000201746 211 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Pgbd5D3YZI9 Gm44867-201ENSMUST00000205675 530 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pgbd5D3YZI9 Gm45441-202ENSMUST00000209301 1235 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pgbd5D3YZI9 Gm2553-201ENSMUST00000215986 605 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Pgbd5D3YZI9 Olfr368-202ENSMUST00000217299 1200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
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Pgbd5D3YZI9 Amtn-201ENSMUST00000073363 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pgbd5D3YZI9 Kdm2b-203ENSMUST00000086200 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pgbd5D3YZI9 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pgbd5D3YZI9 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
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Pgbd5D3YZI9 Rgs6-222ENSMUST00000202210 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
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