Protein–RNA interactions for Protein: D3YYP3

Gm6685, Predicted pseudogene 6685, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6685D3YYP3 Gm21057-202ENSMUST00000206111 512 ntTSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm6685D3YYP3 Prf1-202ENSMUST00000219375 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm6685D3YYP3 Eif5-212ENSMUST00000222375 3547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm6685D3YYP3 Eif5-213ENSMUST00000222388 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm6685D3YYP3 4833420G17Rik-204ENSMUST00000225186 2627 ntAPPRIS P1 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm6685D3YYP3 AC121960.1-201ENSMUST00000227982 564 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm6685D3YYP3 Tmem258-201ENSMUST00000040372 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm6685D3YYP3 Il17c-201ENSMUST00000050963 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm6685D3YYP3 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm6685D3YYP3 Cad-201ENSMUST00000013773 7137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm6685D3YYP3 Asph-202ENSMUST00000078139 6694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm6685D3YYP3 Gm44758-201ENSMUST00000206096 2068 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm6685D3YYP3 Tacc2-201ENSMUST00000033141 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm6685D3YYP3 Bcl2l15-202ENSMUST00000106822 1902 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm6685D3YYP3 Map3k4-201ENSMUST00000089058 5305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm6685D3YYP3 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm6685D3YYP3 Ntpcr-202ENSMUST00000065135 1497 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm6685D3YYP3 D930032P07Rik-201ENSMUST00000181393 1314 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm6685D3YYP3 Robo4-201ENSMUST00000102895 3226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm6685D3YYP3 Dsp-201ENSMUST00000124830 9592 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm6685D3YYP3 Pde6b-201ENSMUST00000031456 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm6685D3YYP3 Cldn12-201ENSMUST00000060947 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm6685D3YYP3 Kpna1-201ENSMUST00000004054 5039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm6685D3YYP3 Jaml-201ENSMUST00000050020 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm6685D3YYP3 Ecd-201ENSMUST00000022344 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm6685D3YYP3 Timm22-201ENSMUST00000021203 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm6685D3YYP3 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm6685D3YYP3 Ptpn2-203ENSMUST00000122412 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm6685D3YYP3 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm6685D3YYP3 Arntl2-203ENSMUST00000111638 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm6685D3YYP3 Arntl2-201ENSMUST00000080530 1740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm6685D3YYP3 Cep97-203ENSMUST00000118500 3389 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm6685D3YYP3 Cbln3-201ENSMUST00000063871 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm6685D3YYP3 Nyap1-202ENSMUST00000118326 4565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm6685D3YYP3 Acly-203ENSMUST00000107389 4426 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm6685D3YYP3 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm6685D3YYP3 Ttc23-202ENSMUST00000107470 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm6685D3YYP3 Cald1-205ENSMUST00000115027 4777 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm6685D3YYP3 Cd72-205ENSMUST00000107926 1419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm6685D3YYP3 Cd72-203ENSMUST00000098105 1420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm6685D3YYP3 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm6685D3YYP3 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm6685D3YYP3 Tnnt3-206ENSMUST00000105944 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm6685D3YYP3 Tnnt3-210ENSMUST00000105948 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm6685D3YYP3 Tnnt3-212ENSMUST00000105950 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm6685D3YYP3 Gm11663-201ENSMUST00000117888 290 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm6685D3YYP3 Gm13611-201ENSMUST00000118269 318 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm6685D3YYP3 Gm12616-201ENSMUST00000118594 382 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm6685D3YYP3 Gm13045-201ENSMUST00000119019 712 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm6685D3YYP3 Gm13408-201ENSMUST00000119822 798 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm6685D3YYP3 Gm13935-201ENSMUST00000121859 798 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm6685D3YYP3 Gm53-203ENSMUST00000143887 757 ntTSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm6685D3YYP3 Gm13587-201ENSMUST00000152645 366 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm6685D3YYP3 Tnnt3-224ENSMUST00000169299 1013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm6685D3YYP3 Gm20426-201ENSMUST00000173657 440 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm6685D3YYP3 Gm12624-201ENSMUST00000177615 382 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm6685D3YYP3 Gm12621-201ENSMUST00000177760 382 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm6685D3YYP3 Gm12615-201ENSMUST00000177970 382 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm6685D3YYP3 Gm12622-201ENSMUST00000177975 382 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm6685D3YYP3 Gm12627-201ENSMUST00000178412 382 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm6685D3YYP3 Gm12625-201ENSMUST00000179122 382 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm6685D3YYP3 Gm12614-201ENSMUST00000179586 382 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm6685D3YYP3 Tnnt3-226ENSMUST00000180152 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm6685D3YYP3 Gm12613-201ENSMUST00000180323 382 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm6685D3YYP3 Mt3-202ENSMUST00000211915 440 ntTSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm6685D3YYP3 Cct2-206ENSMUST00000219573 637 ntTSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm6685D3YYP3 Gm1821-202ENSMUST00000227415 750 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm6685D3YYP3 Rbp2-201ENSMUST00000035029 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm6685D3YYP3 Slc7a7-201ENSMUST00000000984 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm6685D3YYP3 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm6685D3YYP3 Cyb5rl-202ENSMUST00000106756 1604 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm6685D3YYP3 Gm28047-201ENSMUST00000184772 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm6685D3YYP3 Tpra1-219ENSMUST00000203345 3359 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm6685D3YYP3 Tmem159-201ENSMUST00000033210 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm6685D3YYP3 Cd8b1-201ENSMUST00000065248 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm6685D3YYP3 Amer2-201ENSMUST00000022561 10506 ntAPPRIS P1 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm6685D3YYP3 Gm37368-201ENSMUST00000193173 3212 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm6685D3YYP3 Gfra1-201ENSMUST00000026076 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm6685D3YYP3 Gm12992-201ENSMUST00000124738 4493 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm6685D3YYP3 Ftsj1-201ENSMUST00000033513 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm6685D3YYP3 Zfp286-211ENSMUST00000207597 1668 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm6685D3YYP3 Polm-201ENSMUST00000020767 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm6685D3YYP3 Gbf1-201ENSMUST00000026254 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm6685D3YYP3 Sufu-201ENSMUST00000039922 4522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm6685D3YYP3 Gm2128-201ENSMUST00000108009 2560 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm6685D3YYP3 Pip5k1b-201ENSMUST00000025800 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm6685D3YYP3 Cacna1c-201ENSMUST00000075591 7584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm6685D3YYP3 Tcn2-201ENSMUST00000020710 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm6685D3YYP3 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm6685D3YYP3 AC126257.1-201ENSMUST00000213195 1536 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm6685D3YYP3 Xpot-203ENSMUST00000218004 6005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm6685D3YYP3 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm6685D3YYP3 Ahsa2-202ENSMUST00000109539 3583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm6685D3YYP3 Ambra1-204ENSMUST00000111316 5063 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm6685D3YYP3 Galr1-201ENSMUST00000065224 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm6685D3YYP3 Uprt-201ENSMUST00000087867 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm6685D3YYP3 Arhgef2-206ENSMUST00000175779 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm6685D3YYP3 Fam49a-201ENSMUST00000069005 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm6685D3YYP3 Evl-204ENSMUST00000172409 1955 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm6685D3YYP3 Tmem266-202ENSMUST00000085754 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.3 ms