Protein–RNA interactions for Protein: D3YYI7

Rnf217, Probable E3 ubiquitin-protein ligase RNF217, mousemouse

Predictions only

Length 515 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf217D3YYI7 AC164099.2-201ENSMUST00000227795 2005 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rnf217D3YYI7 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rnf217D3YYI7 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rnf217D3YYI7 Sgce-209ENSMUST00000133306 1619 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rnf217D3YYI7 Add2-207ENSMUST00000203724 3143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rnf217D3YYI7 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rnf217D3YYI7 Hspa4l-208ENSMUST00000204702 9479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rnf217D3YYI7 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rnf217D3YYI7 Vmn1r38-201ENSMUST00000226457 3462 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rnf217D3YYI7 Tmem135-202ENSMUST00000117852 2986 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rnf217D3YYI7 Gm13990-201ENSMUST00000151391 2701 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rnf217D3YYI7 Dnmt3l-202ENSMUST00000123940 1452 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rnf217D3YYI7 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rnf217D3YYI7 Gm6124-201ENSMUST00000188240 2580 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Rnf217D3YYI7 Zfp108-202ENSMUST00000205982 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rnf217D3YYI7 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rnf217D3YYI7 Crispld2-202ENSMUST00000108972 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rnf217D3YYI7 Cd2bp2-207ENSMUST00000206026 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rnf217D3YYI7 Gm19178-201ENSMUST00000217524 1819 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Rnf217D3YYI7 Tm9sf1-202ENSMUST00000120041 2164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rnf217D3YYI7 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rnf217D3YYI7 Cpne9-201ENSMUST00000041203 2777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rnf217D3YYI7 Agrn-201ENSMUST00000071248 4831 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rnf217D3YYI7 Gm11661-201ENSMUST00000121761 1327 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Rnf217D3YYI7 Cry2-201ENSMUST00000090559 3976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rnf217D3YYI7 Zfp251-201ENSMUST00000080406 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rnf217D3YYI7 Slc4a9-202ENSMUST00000115694 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rnf217D3YYI7 1110051M20Rik-201ENSMUST00000064652 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rnf217D3YYI7 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rnf217D3YYI7 Sgk1-213ENSMUST00000164659 2602 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rnf217D3YYI7 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rnf217D3YYI7 Thrap3-201ENSMUST00000080919 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rnf217D3YYI7 Gm20687-203ENSMUST00000185121 4242 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rnf217D3YYI7 Hcrtr2-203ENSMUST00000184757 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rnf217D3YYI7 Trpv6-201ENSMUST00000031902 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rnf217D3YYI7 Cttn-201ENSMUST00000033407 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rnf217D3YYI7 Nuak2-201ENSMUST00000072177 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rnf217D3YYI7 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rnf217D3YYI7 Nmnat1-203ENSMUST00000119921 2657 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rnf217D3YYI7 Gm13404-201ENSMUST00000156633 1960 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rnf217D3YYI7 Trim61-201ENSMUST00000078409 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rnf217D3YYI7 D3Ertd751e-204ENSMUST00000119572 1011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
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Rnf217D3YYI7 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
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Rnf217D3YYI7 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
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Rnf217D3YYI7 Ifi27-201ENSMUST00000066701 889 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rnf217D3YYI7 Ddo-202ENSMUST00000213442 2408 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
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Rnf217D3YYI7 Parp9-203ENSMUST00000114878 3548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
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Rnf217D3YYI7 Pex13-201ENSMUST00000020523 4146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rnf217D3YYI7 Dpysl4-201ENSMUST00000026551 3552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rnf217D3YYI7 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rnf217D3YYI7 Igf1-201ENSMUST00000062862 2292 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rnf217D3YYI7 Fads6-201ENSMUST00000056153 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rnf217D3YYI7 1600014C10Rik-201ENSMUST00000067854 3143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rnf217D3YYI7 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rnf217D3YYI7 Specc1-213ENSMUST00000202179 6676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rnf217D3YYI7 Gm43375-201ENSMUST00000196705 2480 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Rnf217D3YYI7 AU019823-201ENSMUST00000131351 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rnf217D3YYI7 AU019823-205ENSMUST00000171462 3339 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rnf217D3YYI7 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rnf217D3YYI7 Pappa-201ENSMUST00000084501 11027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
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Rnf217D3YYI7 Park7-202ENSMUST00000105673 919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
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