Protein–RNA interactions for Protein: B9EJA2

Cttnbp2, Cortactin-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cttnbp2B9EJA2 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cttnbp2B9EJA2 Gm43152-201ENSMUST00000202495 1638 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Cttnbp2B9EJA2 Mapk1ip1-201ENSMUST00000075667 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cttnbp2B9EJA2 Acsl6-208ENSMUST00000108899 1662 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cttnbp2B9EJA2 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cttnbp2B9EJA2 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cttnbp2B9EJA2 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cttnbp2B9EJA2 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cttnbp2B9EJA2 Pram1-201ENSMUST00000052079 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cttnbp2B9EJA2 Ighv7-1-201ENSMUST00000103474 363 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cttnbp2B9EJA2 Gm12745-201ENSMUST00000121767 214 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Cttnbp2B9EJA2 Fbxl12os-203ENSMUST00000138471 2127 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cttnbp2B9EJA2 Gm20441-201ENSMUST00000173512 756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cttnbp2B9EJA2 Gm37723-201ENSMUST00000194480 565 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Cttnbp2B9EJA2 Myo1h-206ENSMUST00000196467 1208 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cttnbp2B9EJA2 Tpi-rs4-201ENSMUST00000213734 720 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Cttnbp2B9EJA2 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cttnbp2B9EJA2 Gm3642-201ENSMUST00000166895 1762 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cttnbp2B9EJA2 Kyat1-206ENSMUST00000113663 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cttnbp2B9EJA2 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cttnbp2B9EJA2 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cttnbp2B9EJA2 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cttnbp2B9EJA2 Gm4593-201ENSMUST00000205334 1555 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cttnbp2B9EJA2 Zfp869-201ENSMUST00000080987 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cttnbp2B9EJA2 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cttnbp2B9EJA2 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cttnbp2B9EJA2 Gm8271-201ENSMUST00000171053 1469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cttnbp2B9EJA2 4931406C07Rik-203ENSMUST00000180339 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cttnbp2B9EJA2 Rab27b-201ENSMUST00000069749 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cttnbp2B9EJA2 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cttnbp2B9EJA2 Impdh2-ps-201ENSMUST00000120826 1545 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Cttnbp2B9EJA2 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cttnbp2B9EJA2 Gm17745-201ENSMUST00000212186 1692 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cttnbp2B9EJA2 Igkv3-10-201ENSMUST00000103397 356 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cttnbp2B9EJA2 Gm16069-201ENSMUST00000131146 545 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cttnbp2B9EJA2 Mrgpra2a-201ENSMUST00000159004 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cttnbp2B9EJA2 Cd79b-202ENSMUST00000167143 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cttnbp2B9EJA2 Gm43547-201ENSMUST00000197729 328 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Cttnbp2B9EJA2 Gm42867-201ENSMUST00000202995 469 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Cttnbp2B9EJA2 Gm6352-201ENSMUST00000203583 1134 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Cttnbp2B9EJA2 Gm18001-201ENSMUST00000212023 688 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Cttnbp2B9EJA2 Tnfrsf18-201ENSMUST00000040274 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cttnbp2B9EJA2 Gm10848-201ENSMUST00000192361 1811 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cttnbp2B9EJA2 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cttnbp2B9EJA2 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cttnbp2B9EJA2 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cttnbp2B9EJA2 BC017643-201ENSMUST00000038709 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cttnbp2B9EJA2 Polr1e-203ENSMUST00000107814 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cttnbp2B9EJA2 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cttnbp2B9EJA2 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cttnbp2B9EJA2 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cttnbp2B9EJA2 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cttnbp2B9EJA2 Ces2e-201ENSMUST00000034355 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cttnbp2B9EJA2 Orc5-201ENSMUST00000030872 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cttnbp2B9EJA2 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cttnbp2B9EJA2 Thy1-201ENSMUST00000114840 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cttnbp2B9EJA2 Gm15625-201ENSMUST00000117617 1093 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Cttnbp2B9EJA2 Gm4917-201ENSMUST00000121452 650 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Cttnbp2B9EJA2 Gm11993-201ENSMUST00000121861 820 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Cttnbp2B9EJA2 Atxn7l1os2-201ENSMUST00000138617 2019 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cttnbp2B9EJA2 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cttnbp2B9EJA2 Rpl41-201ENSMUST00000176010 582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cttnbp2B9EJA2 Dusp3-207ENSMUST00000176261 496 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cttnbp2B9EJA2 Rpl41-204ENSMUST00000176906 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cttnbp2B9EJA2 Gm8234-201ENSMUST00000198523 1107 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Cttnbp2B9EJA2 Rnasek-201ENSMUST00000040428 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cttnbp2B9EJA2 Gm44573-201ENSMUST00000191753 2370 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Cttnbp2B9EJA2 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cttnbp2B9EJA2 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cttnbp2B9EJA2 Snx27-208ENSMUST00000200642 1308 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cttnbp2B9EJA2 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cttnbp2B9EJA2 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cttnbp2B9EJA2 Gm38192-201ENSMUST00000194364 1847 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Cttnbp2B9EJA2 Gm14005-209ENSMUST00000224993 1832 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Cttnbp2B9EJA2 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cttnbp2B9EJA2 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cttnbp2B9EJA2 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cttnbp2B9EJA2 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cttnbp2B9EJA2 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cttnbp2B9EJA2 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cttnbp2B9EJA2 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cttnbp2B9EJA2 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cttnbp2B9EJA2 4930579F01Rik-202ENSMUST00000199293 1598 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cttnbp2B9EJA2 Rp9-204ENSMUST00000216973 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cttnbp2B9EJA2 4933407L21Rik-201ENSMUST00000027426 1146 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cttnbp2B9EJA2 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cttnbp2B9EJA2 Gm42432-201ENSMUST00000197902 1617 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Cttnbp2B9EJA2 1110051M20Rik-203ENSMUST00000102594 1977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cttnbp2B9EJA2 Polm-202ENSMUST00000109837 2697 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cttnbp2B9EJA2 Eng-202ENSMUST00000113272 3021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cttnbp2B9EJA2 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cttnbp2B9EJA2 Ppara-203ENSMUST00000109423 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Cttnbp2B9EJA2 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Cttnbp2B9EJA2 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Cttnbp2B9EJA2 Prr16-201ENSMUST00000116639 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Cttnbp2B9EJA2 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Cttnbp2B9EJA2 Anxa9-202ENSMUST00000107183 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Cttnbp2B9EJA2 Alox5-202ENSMUST00000164547 1854 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Cttnbp2B9EJA2 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Cttnbp2B9EJA2 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62 ms