Protein–RNA interactions for Protein: B2RVW2

Clrn2, Clarin 2, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clrn2B2RVW2 Ap3s1-202ENSMUST00000224622 978 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Clrn2B2RVW2 AC129308.3-201ENSMUST00000225652 524 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Clrn2B2RVW2 Lgi3-203ENSMUST00000226548 1001 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Clrn2B2RVW2 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Clrn2B2RVW2 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Clrn2B2RVW2 Zfp783-204ENSMUST00000130490 4419 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Clrn2B2RVW2 Gm15997-201ENSMUST00000202188 1491 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Clrn2B2RVW2 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Clrn2B2RVW2 5033403F01Rik-201ENSMUST00000181376 1678 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Clrn2B2RVW2 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Clrn2B2RVW2 Fndc8-201ENSMUST00000018988 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Clrn2B2RVW2 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Clrn2B2RVW2 Gm16237-201ENSMUST00000156666 1319 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Clrn2B2RVW2 Ttc29-202ENSMUST00000109902 1416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Clrn2B2RVW2 H2-M3-201ENSMUST00000038580 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Clrn2B2RVW2 Ninl-201ENSMUST00000109896 5093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Clrn2B2RVW2 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Clrn2B2RVW2 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Clrn2B2RVW2 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Clrn2B2RVW2 Rpl22-204ENSMUST00000139685 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Clrn2B2RVW2 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Clrn2B2RVW2 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Clrn2B2RVW2 1700010I14Rik-201ENSMUST00000024650 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Clrn2B2RVW2 E330023G01Rik-201ENSMUST00000186387 1483 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Clrn2B2RVW2 Rtbdn-202ENSMUST00000109740 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Clrn2B2RVW2 Pttg1-203ENSMUST00000101340 700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Clrn2B2RVW2 Sun3-202ENSMUST00000102909 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Clrn2B2RVW2 Ralyl-202ENSMUST00000108373 267 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Clrn2B2RVW2 Myl2-203ENSMUST00000111751 889 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Clrn2B2RVW2 Srd5a3-202ENSMUST00000113506 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Clrn2B2RVW2 Rfc4-202ENSMUST00000115337 416 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Clrn2B2RVW2 Gm14807-201ENSMUST00000116640 983 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Clrn2B2RVW2 Pttg1-205ENSMUST00000118368 696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Clrn2B2RVW2 Gm11980-201ENSMUST00000121445 986 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Clrn2B2RVW2 Gm14441-201ENSMUST00000121960 540 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Clrn2B2RVW2 Gm16081-201ENSMUST00000155992 684 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Clrn2B2RVW2 Gm7741-201ENSMUST00000181445 989 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Clrn2B2RVW2 Gm17889-201ENSMUST00000198410 598 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Clrn2B2RVW2 Abhd4-208ENSMUST00000199338 868 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Clrn2B2RVW2 Gm45758-201ENSMUST00000212448 1006 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Clrn2B2RVW2 AC114645.1-201ENSMUST00000215831 187 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Clrn2B2RVW2 Gm5805-201ENSMUST00000072779 456 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Clrn2B2RVW2 Gm2174-201ENSMUST00000079663 402 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Clrn2B2RVW2 Mapk4-202ENSMUST00000159162 3514 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Clrn2B2RVW2 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Clrn2B2RVW2 Ubxn10-201ENSMUST00000105809 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Clrn2B2RVW2 4930555B11Rik-201ENSMUST00000123210 1533 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Clrn2B2RVW2 Gm18642-201ENSMUST00000206642 1400 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Clrn2B2RVW2 Gm1840-201ENSMUST00000051687 1432 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Clrn2B2RVW2 Cd55b-201ENSMUST00000112488 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Clrn2B2RVW2 Osr2-204ENSMUST00000228152 1324 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Clrn2B2RVW2 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Clrn2B2RVW2 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Clrn2B2RVW2 Acsm4-201ENSMUST00000047045 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Clrn2B2RVW2 Zmynd11-206ENSMUST00000110637 3770 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Clrn2B2RVW2 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Clrn2B2RVW2 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Clrn2B2RVW2 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Clrn2B2RVW2 Serpina1b-203ENSMUST00000186166 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Clrn2B2RVW2 Wdfy1-204ENSMUST00000113512 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Clrn2B2RVW2 Wdfy1-205ENSMUST00000113513 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Clrn2B2RVW2 Wdfy1-206ENSMUST00000113514 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Clrn2B2RVW2 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Clrn2B2RVW2 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Clrn2B2RVW2 Krt33a-201ENSMUST00000018399 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Clrn2B2RVW2 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Clrn2B2RVW2 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Clrn2B2RVW2 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Clrn2B2RVW2 Coro6-202ENSMUST00000052515 1476 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Clrn2B2RVW2 Rtl5-204ENSMUST00000188731 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Clrn2B2RVW2 Slc37a4-202ENSMUST00000213268 1353 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Clrn2B2RVW2 Herc3-201ENSMUST00000031823 3596 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Clrn2B2RVW2 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Clrn2B2RVW2 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Clrn2B2RVW2 Gm12816-201ENSMUST00000118069 1212 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Clrn2B2RVW2 Gm15172-201ENSMUST00000118945 1046 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Clrn2B2RVW2 Asgr1-205ENSMUST00000146411 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Clrn2B2RVW2 Gm26047-201ENSMUST00000157308 113 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Clrn2B2RVW2 Taar8c-201ENSMUST00000170267 1035 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Clrn2B2RVW2 Gm26134-201ENSMUST00000178484 110 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Clrn2B2RVW2 Tmem242-203ENSMUST00000188282 822 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Clrn2B2RVW2 Gm26047-202ENSMUST00000198840 115 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Clrn2B2RVW2 Gm17825-201ENSMUST00000206836 794 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Clrn2B2RVW2 Gm35713-201ENSMUST00000210516 199 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Clrn2B2RVW2 Gm45338-206ENSMUST00000211460 1155 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Clrn2B2RVW2 Apoc4-201ENSMUST00000003071 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Clrn2B2RVW2 Sapcd1-201ENSMUST00000040151 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Clrn2B2RVW2 Taar8a-201ENSMUST00000051133 1035 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Clrn2B2RVW2 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Clrn2B2RVW2 Tcf4-250ENSMUST00000202458 2610 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Clrn2B2RVW2 Ift22-205ENSMUST00000200157 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Clrn2B2RVW2 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Clrn2B2RVW2 Bmp4-202ENSMUST00000100676 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Clrn2B2RVW2 Ltbp2-202ENSMUST00000110254 6602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Clrn2B2RVW2 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Clrn2B2RVW2 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Clrn2B2RVW2 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Clrn2B2RVW2 Nrxn1-215ENSMUST00000173917 1439 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Clrn2B2RVW2 Arl6ip5-201ENSMUST00000044681 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Clrn2B2RVW2 Btnl4-201ENSMUST00000065841 1761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
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