Protein–RNA interactions for Protein: B2RV38

Rd3l, BC048943 protein, mousemouse

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Length 197 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rd3lB2RV38 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rd3lB2RV38 Ndufa11-201ENSMUST00000002452 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rd3lB2RV38 Rbm5-201ENSMUST00000035199 3064 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rd3lB2RV38 4930594M22Rik-202ENSMUST00000161599 3595 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rd3lB2RV38 Gm37613-201ENSMUST00000195677 3580 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Rd3lB2RV38 Ehmt1-203ENSMUST00000102938 4680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rd3lB2RV38 Rims1-203ENSMUST00000097809 6179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rd3lB2RV38 Dlgap1-214ENSMUST00000155016 4712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rd3lB2RV38 L3mbtl1-201ENSMUST00000035751 2724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rd3lB2RV38 Txndc5-204ENSMUST00000162075 2619 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rd3lB2RV38 Prc1-211ENSMUST00000174199 2128 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rd3lB2RV38 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rd3lB2RV38 4933440M02Rik-203ENSMUST00000206609 1747 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rd3lB2RV38 Dcaf12l1-202ENSMUST00000115056 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Rd3lB2RV38 Ikzf4-204ENSMUST00000222067 2688 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Rd3lB2RV38 Celf1-204ENSMUST00000111448 4432 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Rd3lB2RV38 Zmynd8-220ENSMUST00000170272 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Rd3lB2RV38 Nfya-201ENSMUST00000046719 3645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Rd3lB2RV38 Ly6e-210ENSMUST00000188866 2068 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Rd3lB2RV38 Accs-202ENSMUST00000068513 1872 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Rd3lB2RV38 Bcl9l-203ENSMUST00000218183 6771 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Rd3lB2RV38 Slc6a2-201ENSMUST00000072939 6187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Rd3lB2RV38 Nrg1-206ENSMUST00000208205 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Rd3lB2RV38 Spata13-210ENSMUST00000162945 5469 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Rd3lB2RV38 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Rd3lB2RV38 Ep400-202ENSMUST00000112433 3399 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Rd3lB2RV38 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Rd3lB2RV38 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Rd3lB2RV38 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
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Rd3lB2RV38 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Rd3lB2RV38 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
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Rd3lB2RV38 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Rd3lB2RV38 Gm12984-201ENSMUST00000145711 273 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Rd3lB2RV38 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Rd3lB2RV38 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Rd3lB2RV38 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Rd3lB2RV38 Gm16379-201ENSMUST00000161469 348 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Rd3lB2RV38 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Rd3lB2RV38 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Rd3lB2RV38 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Rd3lB2RV38 Gm8762-201ENSMUST00000193486 339 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
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Rd3lB2RV38 4930447K03Rik-201ENSMUST00000222745 1033 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Rd3lB2RV38 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Rd3lB2RV38 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
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Rd3lB2RV38 Notch2-201ENSMUST00000079812 10500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Rd3lB2RV38 Scn8a-203ENSMUST00000108908 7030 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
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Rd3lB2RV38 Srsf6-203ENSMUST00000130411 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
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Rd3lB2RV38 Tmcc2-201ENSMUST00000045473 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Rd3lB2RV38 Arhgef2-231ENSMUST00000177498 3966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
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Rd3lB2RV38 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Rd3lB2RV38 Ccdc63-201ENSMUST00000058960 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
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Rd3lB2RV38 Sfrp4-203ENSMUST00000222464 4049 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Rd3lB2RV38 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Rd3lB2RV38 Ubtf-202ENSMUST00000079589 3286 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Rd3lB2RV38 Scn10a-202ENSMUST00000213392 6692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
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Rd3lB2RV38 Suclg2-201ENSMUST00000079847 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Rd3lB2RV38 Ift46-201ENSMUST00000002099 4169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Rd3lB2RV38 Dhx34-201ENSMUST00000094816 4073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Rd3lB2RV38 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
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Rd3lB2RV38 Abi1-209ENSMUST00000140164 3403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Rd3lB2RV38 Ghsr-201ENSMUST00000057186 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Rd3lB2RV38 Wwp2-201ENSMUST00000166615 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Rd3lB2RV38 Gabre-201ENSMUST00000064780 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Rd3lB2RV38 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rd3lB2RV38 Trpv4-205ENSMUST00000112225 3226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rd3lB2RV38 Gm12296-201ENSMUST00000144922 3220 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rd3lB2RV38 Olfr742-203ENSMUST00000217437 2244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rd3lB2RV38 Cox17-202ENSMUST00000120495 3690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
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Rd3lB2RV38 4631405K08Rik-201ENSMUST00000180420 2112 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rd3lB2RV38 Dclk3-201ENSMUST00000111879 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rd3lB2RV38 Egfr-202ENSMUST00000102884 2943 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
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Rd3lB2RV38 Cldn19-202ENSMUST00000094823 4168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rd3lB2RV38 Gm13398-201ENSMUST00000149378 2837 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rd3lB2RV38 Mtf2-201ENSMUST00000081567 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rd3lB2RV38 Tmub1-203ENSMUST00000115036 1455 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rd3lB2RV38 Slc2a10-201ENSMUST00000029196 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rd3lB2RV38 AC129336.2-201ENSMUST00000218053 3086 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Rd3lB2RV38 Dph6-201ENSMUST00000028640 2632 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rd3lB2RV38 Prrxl1-204ENSMUST00000189022 2985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rd3lB2RV38 A1cf-202ENSMUST00000224304 2968 ntAPPRIS ALT1 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rd3lB2RV38 Tmem168-206ENSMUST00000149123 3337 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rd3lB2RV38 Slc45a3-201ENSMUST00000027695 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rd3lB2RV38 Oxct1-205ENSMUST00000138927 1743 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rd3lB2RV38 Nos1-206ENSMUST00000142742 10123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
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