Protein–RNA interactions for Protein: B2RS91

Rrn3, RNA polymerase I-specific transcription initiation factor RRN3, mousemouse

Predictions only

Length 656 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrn3B2RS91 Atp10d-206ENSMUST00000169617 761 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rrn3B2RS91 Gm16505-201ENSMUST00000179981 232 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Rrn3B2RS91 Gm28450-201ENSMUST00000187349 638 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Rrn3B2RS91 Gm37312-201ENSMUST00000195753 685 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rrn3B2RS91 Gm35960-201ENSMUST00000202712 767 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Rrn3B2RS91 Gm2553-201ENSMUST00000215986 605 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Rrn3B2RS91 Abhd14b-210ENSMUST00000217496 631 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rrn3B2RS91 Zfp706-203ENSMUST00000226453 517 ntAPPRIS P1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rrn3B2RS91 Prr15l-202ENSMUST00000062172 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rrn3B2RS91 Gm26448-201ENSMUST00000082446 203 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Rrn3B2RS91 Mtf2-201ENSMUST00000081567 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rrn3B2RS91 Gm26684-202ENSMUST00000228229 8257 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Rrn3B2RS91 Frmpd2-203ENSMUST00000208577 5192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rrn3B2RS91 AC163354.1-205ENSMUST00000223262 1511 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rrn3B2RS91 Wnt5a-201ENSMUST00000063465 7010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rrn3B2RS91 Cabp5-201ENSMUST00000005791 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rrn3B2RS91 Fosb-202ENSMUST00000207334 3664 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rrn3B2RS91 Tbcd-201ENSMUST00000103013 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rrn3B2RS91 Kif2a-202ENSMUST00000117423 2023 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rrn3B2RS91 Mbtps1-201ENSMUST00000081381 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rrn3B2RS91 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rrn3B2RS91 AC154639.1-201ENSMUST00000224393 2849 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Rrn3B2RS91 Fads6-201ENSMUST00000056153 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rrn3B2RS91 Grm1-203ENSMUST00000105561 4435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rrn3B2RS91 Pink1-202ENSMUST00000105816 1465 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rrn3B2RS91 Cdk15-201ENSMUST00000114248 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rrn3B2RS91 Pcdhb17-201ENSMUST00000053856 4660 ntAPPRIS P1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rrn3B2RS91 Pofut1-201ENSMUST00000049863 5600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rrn3B2RS91 Tspan14-201ENSMUST00000047652 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rrn3B2RS91 Chil1-201ENSMUST00000082060 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rrn3B2RS91 Cacng5-201ENSMUST00000039071 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rrn3B2RS91 N4bp2l1-201ENSMUST00000016279 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rrn3B2RS91 Slc26a6-201ENSMUST00000098376 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rrn3B2RS91 Gm29100-201ENSMUST00000187564 4410 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Rrn3B2RS91 Dlk1-201ENSMUST00000056110 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rrn3B2RS91 Prc1-211ENSMUST00000174199 2128 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rrn3B2RS91 6030443J06Rik-202ENSMUST00000181374 1353 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rrn3B2RS91 Ppp1r3b-204ENSMUST00000211648 4386 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rrn3B2RS91 Spata20-201ENSMUST00000041705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rrn3B2RS91 Uprt-201ENSMUST00000087867 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rrn3B2RS91 Brwd1-204ENSMUST00000113829 9843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rrn3B2RS91 Gm11766-201ENSMUST00000143428 3018 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rrn3B2RS91 Nr1i3-202ENSMUST00000075469 1305 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rrn3B2RS91 Rbm6-207ENSMUST00000183032 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rrn3B2RS91 Slc6a16-201ENSMUST00000179310 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rrn3B2RS91 Hnrnpk-202ENSMUST00000116403 2970 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rrn3B2RS91 AC154517.2-201ENSMUST00000220829 2458 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Rrn3B2RS91 Ptchd3-201ENSMUST00000036690 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rrn3B2RS91 Olfr658-202ENSMUST00000210641 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rrn3B2RS91 Olfr658-201ENSMUST00000089296 2912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rrn3B2RS91 Sppl2b-211ENSMUST00000220091 3629 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rrn3B2RS91 Gimap5-201ENSMUST00000055558 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rrn3B2RS91 Hexim2-202ENSMUST00000107037 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rrn3B2RS91 Mageb17-ps-201ENSMUST00000117902 919 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Rrn3B2RS91 Dmrtc1a-202ENSMUST00000119624 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rrn3B2RS91 BC026585-202ENSMUST00000119891 1125 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rrn3B2RS91 Gm12036-201ENSMUST00000120008 530 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Rrn3B2RS91 Gm12164-201ENSMUST00000121695 551 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Rrn3B2RS91 3110056K07Rik-202ENSMUST00000136690 1063 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rrn3B2RS91 Gm12984-201ENSMUST00000145711 273 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rrn3B2RS91 Gm12589-201ENSMUST00000153767 638 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rrn3B2RS91 Ccdc127-205ENSMUST00000162672 677 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rrn3B2RS91 Gm35986-201ENSMUST00000197370 655 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rrn3B2RS91 1700018A23Rik-201ENSMUST00000201350 398 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rrn3B2RS91 Gm39460-201ENSMUST00000215728 1266 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rrn3B2RS91 Mpzl2-205ENSMUST00000217097 1175 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rrn3B2RS91 Mettl6-204ENSMUST00000227595 1027 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Rrn3B2RS91 S100a1-201ENSMUST00000060738 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rrn3B2RS91 Trim46-201ENSMUST00000041022 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rrn3B2RS91 Gucy1a3-204ENSMUST00000193924 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rrn3B2RS91 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rrn3B2RS91 9330199G10Rik-202ENSMUST00000221607 1728 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rrn3B2RS91 Thegl-201ENSMUST00000031161 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rrn3B2RS91 Mgmt-201ENSMUST00000081510 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rrn3B2RS91 Gm4755-201ENSMUST00000181803 2647 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rrn3B2RS91 Tcf4-234ENSMUST00000201410 1915 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rrn3B2RS91 Tcf4-243ENSMUST00000202057 1941 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rrn3B2RS91 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rrn3B2RS91 Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 6941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rrn3B2RS91 Pcdhga4-201ENSMUST00000194418 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rrn3B2RS91 Gm29050-201ENSMUST00000190732 2528 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rrn3B2RS91 Snx29-203ENSMUST00000122168 2096 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rrn3B2RS91 Akt2-201ENSMUST00000051356 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rrn3B2RS91 Ecd-201ENSMUST00000022344 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rrn3B2RS91 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rrn3B2RS91 Samd11-204ENSMUST00000218788 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rrn3B2RS91 F11-201ENSMUST00000034064 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rrn3B2RS91 Lrp8-203ENSMUST00000106732 2648 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rrn3B2RS91 Med1-202ENSMUST00000092735 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rrn3B2RS91 4833422C13Rik-202ENSMUST00000160385 2828 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rrn3B2RS91 Togaram1-201ENSMUST00000066296 6372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rrn3B2RS91 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rrn3B2RS91 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rrn3B2RS91 Folr1-203ENSMUST00000106983 1307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rrn3B2RS91 AC126257.1-201ENSMUST00000213195 1536 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Rrn3B2RS91 Ccdc151-202ENSMUST00000115336 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rrn3B2RS91 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rrn3B2RS91 Rcor3-201ENSMUST00000073279 3748 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rrn3B2RS91 Ttc7-202ENSMUST00000125875 3917 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rrn3B2RS91 Ndst1-201ENSMUST00000169273 6070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.3 ms