Protein–RNA interactions for Protein: A7VMS3

H2-M5, Histocompatibility 2, M region locus 5, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M5A7VMS3 D530033B14Rik-202ENSMUST00000206282 216 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
H2-M5A7VMS3 Olfr1347-205ENSMUST00000220413 964 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
H2-M5A7VMS3 Gm270-201ENSMUST00000223010 976 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
H2-M5A7VMS3 Olfr1347-201ENSMUST00000036357 964 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
H2-M5A7VMS3 C1qb-201ENSMUST00000046384 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
H2-M5A7VMS3 Gm5455-201ENSMUST00000058710 715 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
H2-M5A7VMS3 Gm10419-202ENSMUST00000196693 2530 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
H2-M5A7VMS3 Cul9-204ENSMUST00000182485 7848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
H2-M5A7VMS3 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
H2-M5A7VMS3 Arap1-202ENSMUST00000084896 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
H2-M5A7VMS3 Eif4g1-217ENSMUST00000143939 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
H2-M5A7VMS3 Gng5-202ENSMUST00000118280 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
H2-M5A7VMS3 BC017643-201ENSMUST00000038709 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
H2-M5A7VMS3 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
H2-M5A7VMS3 Prpf40b-202ENSMUST00000118287 3129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
H2-M5A7VMS3 Sdr9c7-201ENSMUST00000047134 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
H2-M5A7VMS3 Myo16-203ENSMUST00000207477 7169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
H2-M5A7VMS3 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
H2-M5A7VMS3 Fam149a-201ENSMUST00000093526 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
H2-M5A7VMS3 Cd300lg-201ENSMUST00000017453 2353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
H2-M5A7VMS3 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
H2-M5A7VMS3 Lmbr1-201ENSMUST00000055195 4926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
H2-M5A7VMS3 Gm37849-201ENSMUST00000194722 1881 ntBASIC10.15□□□□□ -0.79
H2-M5A7VMS3 Myo5b-203ENSMUST00000121875 6065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
H2-M5A7VMS3 Aldh1a7-201ENSMUST00000025656 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
H2-M5A7VMS3 Fosb-202ENSMUST00000207334 3664 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
H2-M5A7VMS3 Calm1-202ENSMUST00000110082 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
H2-M5A7VMS3 Cd40-201ENSMUST00000017799 2986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
H2-M5A7VMS3 Zfp335-201ENSMUST00000041361 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
H2-M5A7VMS3 Pitpnm2-201ENSMUST00000086123 6620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
H2-M5A7VMS3 Eya1-202ENSMUST00000080664 3426 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
H2-M5A7VMS3 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
H2-M5A7VMS3 Rtl5-204ENSMUST00000188731 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
H2-M5A7VMS3 Klhl29-202ENSMUST00000218384 2716 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
H2-M5A7VMS3 Dbf4-204ENSMUST00000168500 2000 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
H2-M5A7VMS3 Axin2-201ENSMUST00000052915 4260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
H2-M5A7VMS3 Ciz1-204ENSMUST00000113334 2871 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
H2-M5A7VMS3 Prpf8-201ENSMUST00000018449 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
H2-M5A7VMS3 Tex45-203ENSMUST00000161680 1526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
H2-M5A7VMS3 Cntnap1-201ENSMUST00000103109 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
H2-M5A7VMS3 Trp63-207ENSMUST00000115308 2380 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
H2-M5A7VMS3 Dyrk1a-203ENSMUST00000122284 2356 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
H2-M5A7VMS3 Rnf6-201ENSMUST00000067837 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
H2-M5A7VMS3 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
H2-M5A7VMS3 Rnf225-201ENSMUST00000045870 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
H2-M5A7VMS3 Pou2f1-209ENSMUST00000160908 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
H2-M5A7VMS3 Gngt2-207ENSMUST00000107714 558 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
H2-M5A7VMS3 Gm15711-201ENSMUST00000118889 535 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
H2-M5A7VMS3 Gm12380-201ENSMUST00000119012 544 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
H2-M5A7VMS3 Rpsa-ps12-201ENSMUST00000120596 892 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
H2-M5A7VMS3 Gm12130-201ENSMUST00000133599 639 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
H2-M5A7VMS3 Gm13966-201ENSMUST00000148420 832 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
H2-M5A7VMS3 Gm3625-201ENSMUST00000170816 102 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
H2-M5A7VMS3 Trmt112-204ENSMUST00000174786 646 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
H2-M5A7VMS3 Gm25732-201ENSMUST00000175168 60 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
H2-M5A7VMS3 1110008E08Rik-202ENSMUST00000183621 723 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
H2-M5A7VMS3 Gm4034-201ENSMUST00000187674 480 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
H2-M5A7VMS3 Gm29707-202ENSMUST00000198744 659 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
H2-M5A7VMS3 Spata24-201ENSMUST00000025209 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
H2-M5A7VMS3 3300002I08Rik-201ENSMUST00000051153 650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
H2-M5A7VMS3 S100a1-201ENSMUST00000060738 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
H2-M5A7VMS3 Gatad2a-201ENSMUST00000065169 3812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
H2-M5A7VMS3 Wfdc21-201ENSMUST00000070832 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
H2-M5A7VMS3 Spata24-202ENSMUST00000096573 709 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
H2-M5A7VMS3 Zbtb6-202ENSMUST00000112932 5077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
H2-M5A7VMS3 Gmppb-202ENSMUST00000112295 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
H2-M5A7VMS3 5031434O11Rik-201ENSMUST00000180404 3731 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
H2-M5A7VMS3 Med12l-201ENSMUST00000029393 2295 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
H2-M5A7VMS3 Anxa6-201ENSMUST00000102727 2471 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
H2-M5A7VMS3 Anxa6-202ENSMUST00000108883 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
H2-M5A7VMS3 Gm28036-202ENSMUST00000132494 5505 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
H2-M5A7VMS3 Mtmr4-201ENSMUST00000092802 5525 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
H2-M5A7VMS3 Wdr31-201ENSMUST00000030087 1440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
H2-M5A7VMS3 Gm35040-201ENSMUST00000206829 5094 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
H2-M5A7VMS3 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
H2-M5A7VMS3 4732490B19Rik-201ENSMUST00000130373 2446 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
H2-M5A7VMS3 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
H2-M5A7VMS3 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
H2-M5A7VMS3 Tsga10-202ENSMUST00000088072 3837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
H2-M5A7VMS3 Drd1-202ENSMUST00000221470 3576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
H2-M5A7VMS3 Irak2-201ENSMUST00000059286 3196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
H2-M5A7VMS3 Wdr75-201ENSMUST00000027139 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
H2-M5A7VMS3 AC154671.1-201ENSMUST00000228617 1578 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
H2-M5A7VMS3 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
H2-M5A7VMS3 Tas1r1-201ENSMUST00000030792 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
H2-M5A7VMS3 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
H2-M5A7VMS3 Dmbt1-202ENSMUST00000208311 6272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
H2-M5A7VMS3 6030458C11Rik-201ENSMUST00000057256 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
H2-M5A7VMS3 Cry2-201ENSMUST00000090559 3976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
H2-M5A7VMS3 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
H2-M5A7VMS3 Lmnb2-204ENSMUST00000179022 3370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
H2-M5A7VMS3 Gm5053-201ENSMUST00000208361 1678 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
H2-M5A7VMS3 Fam206a-201ENSMUST00000045368 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
H2-M5A7VMS3 Pabpc4-204ENSMUST00000106243 3111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
H2-M5A7VMS3 Mon1b-202ENSMUST00000179926 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
H2-M5A7VMS3 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
H2-M5A7VMS3 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
H2-M5A7VMS3 Gm23200-201ENSMUST00000104379 132 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
H2-M5A7VMS3 Hexim2-202ENSMUST00000107037 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
H2-M5A7VMS3 Ndufa3-202ENSMUST00000108644 351 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
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