Protein–RNA interactions for Protein: A3FIN4

Atp8b5, Phospholipid-transporting ATPase FetA, mousemouse

Predictions only

Length 1,183 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp8b5A3FIN4 Kat7-203ENSMUST00000103159 3248 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Atp8b5A3FIN4 Zfp689-201ENSMUST00000053392 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Atp8b5A3FIN4 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Atp8b5A3FIN4 Afg3l1-201ENSMUST00000001520 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Atp8b5A3FIN4 Lef1-201ENSMUST00000029611 3482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Atp8b5A3FIN4 Tnc-202ENSMUST00000107371 2928 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Atp8b5A3FIN4 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Atp8b5A3FIN4 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Atp8b5A3FIN4 Akap10-203ENSMUST00000108710 3394 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Atp8b5A3FIN4 Cep97-203ENSMUST00000118500 3389 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Atp8b5A3FIN4 Gbf1-201ENSMUST00000026254 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Atp8b5A3FIN4 Gm15884-201ENSMUST00000143765 643 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Atp8b5A3FIN4 Mfsd14b-203ENSMUST00000155487 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Atp8b5A3FIN4 Gm20482-202ENSMUST00000174729 825 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Atp8b5A3FIN4 Gm7584-201ENSMUST00000175829 940 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Atp8b5A3FIN4 Gm26636-201ENSMUST00000181696 1115 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Atp8b5A3FIN4 Mir8093-201ENSMUST00000185043 137 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Atp8b5A3FIN4 Gm28937-201ENSMUST00000185413 695 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Atp8b5A3FIN4 Gm29400-201ENSMUST00000187208 695 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Atp8b5A3FIN4 Gm28662-201ENSMUST00000188446 695 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Atp8b5A3FIN4 Gm28251-201ENSMUST00000188835 695 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Atp8b5A3FIN4 Gm37318-201ENSMUST00000194325 695 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Atp8b5A3FIN4 Gm38017-201ENSMUST00000194768 695 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Atp8b5A3FIN4 Gm37287-201ENSMUST00000195449 695 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Atp8b5A3FIN4 Gm37793-201ENSMUST00000195548 695 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Atp8b5A3FIN4 Gm42797-201ENSMUST00000197573 494 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Atp8b5A3FIN4 Gm42629-201ENSMUST00000199063 1102 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Atp8b5A3FIN4 Aprt-ps-201ENSMUST00000212311 505 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Atp8b5A3FIN4 AC099934.4-201ENSMUST00000220745 523 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Atp8b5A3FIN4 Tmem14a-202ENSMUST00000027065 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Atp8b5A3FIN4 Ctrc-201ENSMUST00000037059 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Atp8b5A3FIN4 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Atp8b5A3FIN4 Rpl35a-201ENSMUST00000078804 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Atp8b5A3FIN4 Ccdc15-204ENSMUST00000216042 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Atp8b5A3FIN4 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Atp8b5A3FIN4 Ippk-201ENSMUST00000021817 2856 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Atp8b5A3FIN4 Fosb-202ENSMUST00000207334 3664 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Atp8b5A3FIN4 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Atp8b5A3FIN4 Galnt10-201ENSMUST00000066987 4715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Atp8b5A3FIN4 Evi5l-208ENSMUST00000176825 3728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Atp8b5A3FIN4 Plce1-204ENSMUST00000182481 8357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Atp8b5A3FIN4 Lgr5-208ENSMUST00000173740 2508 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Atp8b5A3FIN4 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Atp8b5A3FIN4 Gm9072-201ENSMUST00000218390 1514 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Atp8b5A3FIN4 Hsd17b13-202ENSMUST00000112803 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Atp8b5A3FIN4 Fosb-201ENSMUST00000003640 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Atp8b5A3FIN4 Tiam1-214ENSMUST00000164263 3569 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Atp8b5A3FIN4 Syne3-202ENSMUST00000095439 3357 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Atp8b5A3FIN4 Gm37969-201ENSMUST00000195777 3409 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Atp8b5A3FIN4 Jak1-201ENSMUST00000102781 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Atp8b5A3FIN4 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Atp8b5A3FIN4 Kpna1-201ENSMUST00000004054 5039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Atp8b5A3FIN4 Nefl-201ENSMUST00000022639 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Atp8b5A3FIN4 Dao-202ENSMUST00000112292 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Atp8b5A3FIN4 Spats2l-203ENSMUST00000164302 2088 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Atp8b5A3FIN4 E230029C05Rik-203ENSMUST00000208028 2066 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Atp8b5A3FIN4 C5ar1-202ENSMUST00000168818 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Atp8b5A3FIN4 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Atp8b5A3FIN4 Rnf123-218ENSMUST00000178267 4309 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Atp8b5A3FIN4 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Atp8b5A3FIN4 Vstm2a-202ENSMUST00000109647 1745 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Atp8b5A3FIN4 Mzf1-201ENSMUST00000069289 3597 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Atp8b5A3FIN4 Gm14381-201ENSMUST00000122105 414 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Atp8b5A3FIN4 Gm14809-201ENSMUST00000152025 695 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Atp8b5A3FIN4 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Atp8b5A3FIN4 Rps13-201ENSMUST00000170953 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Atp8b5A3FIN4 Grp-203ENSMUST00000173985 952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Atp8b5A3FIN4 Gm25890-201ENSMUST00000177643 165 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Atp8b5A3FIN4 Rnu1b2-201ENSMUST00000178073 165 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Atp8b5A3FIN4 Rnu1b1-201ENSMUST00000178250 165 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Atp8b5A3FIN4 Gm22614-201ENSMUST00000178300 165 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Atp8b5A3FIN4 1110008E08Rik-202ENSMUST00000183621 723 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Atp8b5A3FIN4 Kdm4dl-201ENSMUST00000184843 1187 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Atp8b5A3FIN4 Gm19744-202ENSMUST00000186135 948 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Atp8b5A3FIN4 Gm38117-201ENSMUST00000194653 939 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Atp8b5A3FIN4 Gm43179-201ENSMUST00000198797 275 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Atp8b5A3FIN4 9230114K14Rik-203ENSMUST00000199547 437 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Atp8b5A3FIN4 Gm36503-201ENSMUST00000204284 875 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Atp8b5A3FIN4 Rpl17-ps3-201ENSMUST00000221295 556 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Atp8b5A3FIN4 Adm2-201ENSMUST00000066991 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Atp8b5A3FIN4 Gm22042-201ENSMUST00000082989 165 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Atp8b5A3FIN4 Gm26110-201ENSMUST00000083971 165 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Atp8b5A3FIN4 6820426E19Rik-201ENSMUST00000204274 1970 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Atp8b5A3FIN4 Fam172a-201ENSMUST00000091459 3892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Atp8b5A3FIN4 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Atp8b5A3FIN4 Olfr1349-204ENSMUST00000207820 1325 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Atp8b5A3FIN4 Cfap100-207ENSMUST00000165673 2072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Atp8b5A3FIN4 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Atp8b5A3FIN4 Os9-202ENSMUST00000164259 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Atp8b5A3FIN4 6030443J06Rik-202ENSMUST00000181374 1353 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Atp8b5A3FIN4 Tpx2-201ENSMUST00000028969 3654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Atp8b5A3FIN4 1700061G19Rik-201ENSMUST00000025048 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Atp8b5A3FIN4 Usp24-204ENSMUST00000165709 10594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Atp8b5A3FIN4 Hbs1l-209ENSMUST00000219915 2733 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Atp8b5A3FIN4 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Atp8b5A3FIN4 Akap10-202ENSMUST00000102650 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Atp8b5A3FIN4 Fam189b-201ENSMUST00000041913 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Atp8b5A3FIN4 Coro6-202ENSMUST00000052515 1476 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Atp8b5A3FIN4 Nars2-201ENSMUST00000044466 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Atp8b5A3FIN4 Uspl1-201ENSMUST00000050472 3757 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.9 ms