Protein–RNA interactions for Protein: A2ASI5

Scn3a, Sodium channel protein, mousemouse

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Length 1,947 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn3aA2ASI5 Evi2a-201ENSMUST00000103236 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Scn3aA2ASI5 Rab3c-202ENSMUST00000223922 2398 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Scn3aA2ASI5 Rnf225-201ENSMUST00000045870 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Scn3aA2ASI5 Gm42890-202ENSMUST00000167642 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Scn3aA2ASI5 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Scn3aA2ASI5 Hist1h3d-201ENSMUST00000105105 1249 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Scn3aA2ASI5 Gm15528-201ENSMUST00000117821 864 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Scn3aA2ASI5 Gm11500-201ENSMUST00000118237 601 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Scn3aA2ASI5 Gm13791-201ENSMUST00000123263 608 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Scn3aA2ASI5 Gm20420-201ENSMUST00000173178 639 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Scn3aA2ASI5 1700026F02Rik-203ENSMUST00000211950 1082 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Scn3aA2ASI5 Gm29961-201ENSMUST00000214692 644 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Scn3aA2ASI5 AC160028.1-201ENSMUST00000219645 1095 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Scn3aA2ASI5 Fkbpl-201ENSMUST00000036720 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Scn3aA2ASI5 3100002H09Rik-201ENSMUST00000053604 873 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Scn3aA2ASI5 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Scn3aA2ASI5 Elmod3-204ENSMUST00000141833 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Scn3aA2ASI5 Snhg17-203ENSMUST00000141809 1553 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Scn3aA2ASI5 Grsf1-202ENSMUST00000113234 2286 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Scn3aA2ASI5 Lgals3bp-201ENSMUST00000043722 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Scn3aA2ASI5 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Scn3aA2ASI5 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Scn3aA2ASI5 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Scn3aA2ASI5 Syvn1-207ENSMUST00000156550 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Scn3aA2ASI5 Fam47e-203ENSMUST00000146417 1357 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Scn3aA2ASI5 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Scn3aA2ASI5 Gm13561-201ENSMUST00000136879 1826 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Scn3aA2ASI5 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Scn3aA2ASI5 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Scn3aA2ASI5 Adipor2-202ENSMUST00000169744 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Scn3aA2ASI5 Gm4294-201ENSMUST00000105169 614 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Scn3aA2ASI5 Selenot-ps-201ENSMUST00000119098 593 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Scn3aA2ASI5 Gm12446-201ENSMUST00000123933 798 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Scn3aA2ASI5 Tmem190-201ENSMUST00000013235 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Scn3aA2ASI5 Rps19-ps10-201ENSMUST00000159750 435 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
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Scn3aA2ASI5 Slc10a1-203ENSMUST00000218342 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Scn3aA2ASI5 Tgm2-201ENSMUST00000103122 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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Scn3aA2ASI5 Apol9a-201ENSMUST00000081776 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Scn3aA2ASI5 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Scn3aA2ASI5 Gstcd-201ENSMUST00000029651 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Scn3aA2ASI5 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Scn3aA2ASI5 Gm13404-201ENSMUST00000156633 1960 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Scn3aA2ASI5 Abcd1-202ENSMUST00000114461 2323 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Scn3aA2ASI5 Birc3-201ENSMUST00000013949 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Scn3aA2ASI5 Srr-201ENSMUST00000065211 3699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Scn3aA2ASI5 Gm44573-201ENSMUST00000191753 2370 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Scn3aA2ASI5 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Scn3aA2ASI5 1700047I17Rik2-201ENSMUST00000177978 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Scn3aA2ASI5 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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Scn3aA2ASI5 Gm39168-201ENSMUST00000210181 1423 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Scn3aA2ASI5 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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Scn3aA2ASI5 Gm17709-201ENSMUST00000174536 1096 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
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Scn3aA2ASI5 Fam228a-203ENSMUST00000220978 861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Scn3aA2ASI5 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Scn3aA2ASI5 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Scn3aA2ASI5 Cdrt4os1-201ENSMUST00000130177 2090 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Scn3aA2ASI5 Arl13b-201ENSMUST00000089289 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Scn3aA2ASI5 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Scn3aA2ASI5 Stt3a-209ENSMUST00000217599 285 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Scn3aA2ASI5 AC165154.1-201ENSMUST00000226661 340 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Scn3aA2ASI5 Duxf3-201ENSMUST00000174056 1486 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Scn3aA2ASI5 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Scn3aA2ASI5 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Scn3aA2ASI5 Asz1-201ENSMUST00000010940 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Scn3aA2ASI5 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Scn3aA2ASI5 Myocd-201ENSMUST00000101042 2585 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Scn3aA2ASI5 Ttc30a2-201ENSMUST00000099995 2431 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Scn3aA2ASI5 Clcc1-202ENSMUST00000106609 2043 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Scn3aA2ASI5 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Scn3aA2ASI5 Zc3h12a-201ENSMUST00000036188 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Scn3aA2ASI5 Fbxl12os-203ENSMUST00000138471 2127 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Scn3aA2ASI5 Dusp6-204ENSMUST00000220291 2359 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Scn3aA2ASI5 Olfr1413-202ENSMUST00000214239 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.8 ms