Protein–RNA interactions for Protein: A2AGT5

Ckap5, Cytoskeleton-associated protein 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,032 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ckap5A2AGT5 Uba6-202ENSMUST00000113373 3504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ckap5A2AGT5 Flnc-201ENSMUST00000065090 9038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ckap5A2AGT5 Hnrnpk-202ENSMUST00000116403 2970 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ckap5A2AGT5 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ckap5A2AGT5 Tollip-201ENSMUST00000001950 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ckap5A2AGT5 Tfdp2-205ENSMUST00000179416 2408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ckap5A2AGT5 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ckap5A2AGT5 Cyp4x1-201ENSMUST00000051400 1524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ckap5A2AGT5 Pink1-202ENSMUST00000105816 1465 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ckap5A2AGT5 Gm29100-201ENSMUST00000187564 4410 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Ckap5A2AGT5 Gm44999-201ENSMUST00000207456 1493 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Ckap5A2AGT5 4930588G17Rik-201ENSMUST00000208075 1474 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ckap5A2AGT5 Hrct1-201ENSMUST00000095109 1452 ntAPPRIS P1 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ckap5A2AGT5 Rnf183-203ENSMUST00000107455 1432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ckap5A2AGT5 Taf1b-201ENSMUST00000075954 2209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ckap5A2AGT5 Parvg-201ENSMUST00000023074 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ckap5A2AGT5 Gm26703-201ENSMUST00000181370 2864 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ckap5A2AGT5 Lsg1-201ENSMUST00000117363 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ckap5A2AGT5 Gnb1l-204ENSMUST00000115601 3507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ckap5A2AGT5 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ckap5A2AGT5 Sumo3-203ENSMUST00000124024 776 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ckap5A2AGT5 Gm13605-201ENSMUST00000124489 658 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ckap5A2AGT5 Adap2os-201ENSMUST00000140556 984 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ckap5A2AGT5 Gm14235-201ENSMUST00000142445 366 ntTSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ckap5A2AGT5 Gm24844-201ENSMUST00000158679 127 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Ckap5A2AGT5 Cldn16-202ENSMUST00000161053 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ckap5A2AGT5 Gm19705-203ENSMUST00000181491 678 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ckap5A2AGT5 Gm9192-201ENSMUST00000183221 985 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Ckap5A2AGT5 Gm37707-201ENSMUST00000195309 325 ntTSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ckap5A2AGT5 Gm45641-201ENSMUST00000209775 452 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ckap5A2AGT5 Mia-201ENSMUST00000071986 566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ckap5A2AGT5 4930523C07Rik-202ENSMUST00000097513 300 ntAPPRIS P1 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ckap5A2AGT5 Rab11fip1-203ENSMUST00000209377 3769 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ckap5A2AGT5 Olfr156-203ENSMUST00000214843 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ckap5A2AGT5 Prkag3-206ENSMUST00000188073 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ckap5A2AGT5 Kctd18-210ENSMUST00000164963 2114 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ckap5A2AGT5 Pigk-201ENSMUST00000045029 1761 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ckap5A2AGT5 Ibsp-201ENSMUST00000031246 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ckap5A2AGT5 F10-205ENSMUST00000152034 1449 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ckap5A2AGT5 Vsx2-201ENSMUST00000021665 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ckap5A2AGT5 Ufd1-201ENSMUST00000005394 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ckap5A2AGT5 Acsf3-201ENSMUST00000015160 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ckap5A2AGT5 AC130671.2-201ENSMUST00000227224 1621 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Ckap5A2AGT5 Cyth4-201ENSMUST00000043069 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ckap5A2AGT5 Tagln2-202ENSMUST00000111230 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ckap5A2AGT5 6230400D17Rik-201ENSMUST00000180987 1554 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ckap5A2AGT5 Ighv1-52-201ENSMUST00000103522 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ckap5A2AGT5 Gm15573-201ENSMUST00000119487 540 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Ckap5A2AGT5 Taf9-201ENSMUST00000167256 1230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ckap5A2AGT5 Gm5714-201ENSMUST00000197343 566 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Ckap5A2AGT5 AC122876.1-201ENSMUST00000217619 825 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Ckap5A2AGT5 9430078K24Rik-201ENSMUST00000218818 1082 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ckap5A2AGT5 1700013F07Rik-201ENSMUST00000029485 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ckap5A2AGT5 Orc4-202ENSMUST00000090976 1153 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ckap5A2AGT5 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ckap5A2AGT5 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ckap5A2AGT5 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ckap5A2AGT5 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ckap5A2AGT5 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ckap5A2AGT5 Slc7a4-207ENSMUST00000172164 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ckap5A2AGT5 Ccdc154-203ENSMUST00000182621 2402 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ckap5A2AGT5 Dnajb6-203ENSMUST00000114839 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ckap5A2AGT5 C130050O18Rik-202ENSMUST00000163940 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ckap5A2AGT5 Olfr283-202ENSMUST00000215830 2392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ckap5A2AGT5 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ckap5A2AGT5 Spns3-202ENSMUST00000092940 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ckap5A2AGT5 E130018N17Rik-201ENSMUST00000129713 1309 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ckap5A2AGT5 Trpv4-201ENSMUST00000071968 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ckap5A2AGT5 Brwd1-204ENSMUST00000113829 9843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ckap5A2AGT5 6030458C11Rik-204ENSMUST00000228177 3156 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Ckap5A2AGT5 Nrf1-219ENSMUST00000167972 1541 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ckap5A2AGT5 Gm38569-201ENSMUST00000205476 2228 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ckap5A2AGT5 Ccpg1-208ENSMUST00000150826 2939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ckap5A2AGT5 Ptprh-202ENSMUST00000166650 3642 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ckap5A2AGT5 Gm24514-201ENSMUST00000174961 285 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Ckap5A2AGT5 Rpl19-201ENSMUST00000017548 751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ckap5A2AGT5 Gm6114-201ENSMUST00000182472 968 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Ckap5A2AGT5 A430050A11Rik-201ENSMUST00000195348 646 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Ckap5A2AGT5 Rpl36-ps9-201ENSMUST00000196458 277 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Ckap5A2AGT5 AC166992.1-201ENSMUST00000216356 565 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Ckap5A2AGT5 Gm18974-201ENSMUST00000221478 1031 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Ckap5A2AGT5 Cox6a2-201ENSMUST00000033049 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ckap5A2AGT5 Rpl19-202ENSMUST00000092425 737 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ckap5A2AGT5 Ercc2-201ENSMUST00000062831 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ckap5A2AGT5 Mdh1b-201ENSMUST00000114094 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ckap5A2AGT5 Spred2-201ENSMUST00000093298 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ckap5A2AGT5 Spast-201ENSMUST00000024869 4672 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ckap5A2AGT5 Drd3-201ENSMUST00000023390 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ckap5A2AGT5 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ckap5A2AGT5 Nr1h3-203ENSMUST00000111355 1672 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ckap5A2AGT5 Ctps2-205ENSMUST00000112302 3223 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ckap5A2AGT5 Rgs6-211ENSMUST00000191107 1621 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ckap5A2AGT5 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Ckap5A2AGT5 Slc37a1-202ENSMUST00000171233 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ckap5A2AGT5 Gnas-209ENSMUST00000109088 3519 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ckap5A2AGT5 Gnas-201ENSMUST00000080493 3519 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ckap5A2AGT5 Gsdmcl-ps-203ENSMUST00000188367 1375 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Ckap5A2AGT5 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ckap5A2AGT5 Grap2-201ENSMUST00000043149 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ckap5A2AGT5 Coa5-201ENSMUST00000027286 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
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