Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZF2

Gpc1, Glypican-1, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpc1Q9QZF2 Vmn1r130-201ENSMUST00000177936 924 ntAPPRIS P1 BASIC12.42□□□□□ -0.42
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Gpc1Q9QZF2 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
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Gpc1Q9QZF2 Tfdp2-205ENSMUST00000179416 2408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gpc1Q9QZF2 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gpc1Q9QZF2 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gpc1Q9QZF2 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
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Gpc1Q9QZF2 Gm18539-201ENSMUST00000204745 1090 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Gpc1Q9QZF2 Gm45258-201ENSMUST00000210042 853 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Gpc1Q9QZF2 Spata24-201ENSMUST00000025209 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gpc1Q9QZF2 Psmb2-201ENSMUST00000030642 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gpc1Q9QZF2 Spata24-202ENSMUST00000096573 709 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gpc1Q9QZF2 Tnni3-201ENSMUST00000098859 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gpc1Q9QZF2 Slc39a8-205ENSMUST00000167390 3533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
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Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms