Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLF7

Tlr5, Toll-like receptor 5, mousemouse

Predictions only

Length 859 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlr5Q9JLF7 Mrvi1-201ENSMUST00000005751 6198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tlr5Q9JLF7 Golga4-201ENSMUST00000084820 7583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tlr5Q9JLF7 Jpt2-201ENSMUST00000024981 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tlr5Q9JLF7 Ubl5-201ENSMUST00000129414 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tlr5Q9JLF7 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tlr5Q9JLF7 Cops7a-202ENSMUST00000112439 1328 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tlr5Q9JLF7 E130018N17Rik-201ENSMUST00000129713 1309 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tlr5Q9JLF7 Gm13553-201ENSMUST00000133025 1970 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tlr5Q9JLF7 Umod-201ENSMUST00000033263 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tlr5Q9JLF7 Trmt61b-202ENSMUST00000137830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tlr5Q9JLF7 Eno1-201ENSMUST00000080149 1902 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tlr5Q9JLF7 Vamp5-202ENSMUST00000101285 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tlr5Q9JLF7 1700080O16Rik-202ENSMUST00000114866 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tlr5Q9JLF7 Gm7857-201ENSMUST00000117957 358 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Tlr5Q9JLF7 Gm5982-201ENSMUST00000196234 512 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Tlr5Q9JLF7 Gm10069-203ENSMUST00000204081 907 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tlr5Q9JLF7 Rps4l-202ENSMUST00000204242 789 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Tlr5Q9JLF7 AC134869.4-202ENSMUST00000224350 837 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Tlr5Q9JLF7 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tlr5Q9JLF7 Coch-201ENSMUST00000085412 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tlr5Q9JLF7 Lipo2-201ENSMUST00000147153 3562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tlr5Q9JLF7 Gm9951-202ENSMUST00000149618 1772 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tlr5Q9JLF7 Frmpd1-202ENSMUST00000107804 5241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tlr5Q9JLF7 Kdm2b-203ENSMUST00000086200 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tlr5Q9JLF7 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tlr5Q9JLF7 Tnip1-204ENSMUST00000108885 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tlr5Q9JLF7 Chit1-203ENSMUST00000160060 1580 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tlr5Q9JLF7 Wapl-202ENSMUST00000090027 4185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tlr5Q9JLF7 Eng-202ENSMUST00000113272 3021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Tlr5Q9JLF7 Hk3-203ENSMUST00000126234 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Tlr5Q9JLF7 Sdad1-201ENSMUST00000031364 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Tlr5Q9JLF7 Fads1-201ENSMUST00000010807 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Tlr5Q9JLF7 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Tlr5Q9JLF7 Specc1-212ENSMUST00000202178 2932 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Tlr5Q9JLF7 Rps6kl1-202ENSMUST00000221972 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Tlr5Q9JLF7 6030466F02Rik-201ENSMUST00000212339 1434 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Tlr5Q9JLF7 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Tlr5Q9JLF7 4932443L11Rik-202ENSMUST00000177130 2827 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Tlr5Q9JLF7 Dnajc5-201ENSMUST00000072334 6578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Tlr5Q9JLF7 Kcnma1-213ENSMUST00000188991 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Tlr5Q9JLF7 Lrmp-201ENSMUST00000032396 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Tlr5Q9JLF7 Npr2-201ENSMUST00000030191 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Tlr5Q9JLF7 Hyal3-202ENSMUST00000148440 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Tlr5Q9JLF7 Cog4-201ENSMUST00000034203 2737 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Tlr5Q9JLF7 Gstcd-201ENSMUST00000029651 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Tlr5Q9JLF7 Parvg-201ENSMUST00000023074 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Tlr5Q9JLF7 Srek1-201ENSMUST00000074616 3934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Tlr5Q9JLF7 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Tlr5Q9JLF7 Ncmap-202ENSMUST00000105857 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Tlr5Q9JLF7 Gm12201-201ENSMUST00000120657 1234 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Tlr5Q9JLF7 Rtbdn-203ENSMUST00000121880 1223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Tlr5Q9JLF7 Gm13442-201ENSMUST00000135749 663 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Tlr5Q9JLF7 D630008O14Rik-202ENSMUST00000149909 1043 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Tlr5Q9JLF7 Ccdc127-205ENSMUST00000162672 677 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Tlr5Q9JLF7 Ssty2-201ENSMUST00000179136 684 ntAPPRIS P1 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Tlr5Q9JLF7 3110045C21Rik-201ENSMUST00000180638 1135 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Tlr5Q9JLF7 Gm8100-201ENSMUST00000182906 988 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Tlr5Q9JLF7 Cyb561-206ENSMUST00000184086 1130 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Tlr5Q9JLF7 Ssty2-202ENSMUST00000190565 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Tlr5Q9JLF7 Gm2965-201ENSMUST00000198365 343 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Tlr5Q9JLF7 Gm7940-201ENSMUST00000218195 769 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Tlr5Q9JLF7 Cby1-201ENSMUST00000023064 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Tlr5Q9JLF7 Mir219a-1-201ENSMUST00000083621 110 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Tlr5Q9JLF7 Gm21811-201ENSMUST00000096485 930 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Tlr5Q9JLF7 Ccdc15-204ENSMUST00000216042 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Tlr5Q9JLF7 Gipr-201ENSMUST00000094790 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Tlr5Q9JLF7 Vsx2-201ENSMUST00000021665 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Tlr5Q9JLF7 Fank1-201ENSMUST00000065359 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Tlr5Q9JLF7 Cxcr5-202ENSMUST00000179828 2824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Tlr5Q9JLF7 AC154639.1-201ENSMUST00000224393 2849 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Tlr5Q9JLF7 Atp1b2-201ENSMUST00000047889 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Tlr5Q9JLF7 Hbs1l-201ENSMUST00000020153 2793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Tlr5Q9JLF7 Lamp5-201ENSMUST00000057503 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Tlr5Q9JLF7 Pigo-201ENSMUST00000067481 3525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Tlr5Q9JLF7 AC159308.2-201ENSMUST00000213592 2325 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Tlr5Q9JLF7 Wdr45-203ENSMUST00000115688 1510 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Tlr5Q9JLF7 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Tlr5Q9JLF7 Ldhd-201ENSMUST00000070004 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Tlr5Q9JLF7 Cyth3-202ENSMUST00000116456 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Tlr5Q9JLF7 1700030J22Rik-201ENSMUST00000070577 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Tlr5Q9JLF7 Rit2-203ENSMUST00000153060 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Tlr5Q9JLF7 Gm1840-201ENSMUST00000051687 1432 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Tlr5Q9JLF7 Abhd12b-203ENSMUST00000169156 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Tlr5Q9JLF7 Pcdh1-202ENSMUST00000159405 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Tlr5Q9JLF7 Fam214a-205ENSMUST00000215370 4205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Tlr5Q9JLF7 Ecd-201ENSMUST00000022344 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Tlr5Q9JLF7 Fbxo39-201ENSMUST00000108504 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Tlr5Q9JLF7 Mdh1b-201ENSMUST00000114094 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Tlr5Q9JLF7 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Tlr5Q9JLF7 Zfp512-208ENSMUST00000202244 3045 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Tlr5Q9JLF7 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Tlr5Q9JLF7 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Tlr5Q9JLF7 Gm16364-201ENSMUST00000153722 1313 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Tlr5Q9JLF7 Gsdma2-201ENSMUST00000017355 1314 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Tlr5Q9JLF7 Osr2-204ENSMUST00000228152 1324 ntAPPRIS P1 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Tlr5Q9JLF7 Fxyd5-212ENSMUST00000162733 2998 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Tlr5Q9JLF7 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Tlr5Q9JLF7 Cacna1g-204ENSMUST00000107785 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Tlr5Q9JLF7 Ighg2c-201ENSMUST00000103416 1214 ntAPPRIS P5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Tlr5Q9JLF7 Tmem50a-202ENSMUST00000105863 719 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.3 ms