Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES64

Ush1c, Harmonin, mousemouse

Predictions only

Length 910 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ush1cQ9ES64 Acat3-202ENSMUST00000160378 987 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ush1cQ9ES64 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ush1cQ9ES64 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ush1cQ9ES64 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ush1cQ9ES64 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ush1cQ9ES64 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ush1cQ9ES64 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Ush1cQ9ES64 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Ush1cQ9ES64 Gm2762-206ENSMUST00000202502 335 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ush1cQ9ES64 Gm2762-208ENSMUST00000202976 568 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ush1cQ9ES64 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ush1cQ9ES64 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ush1cQ9ES64 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ush1cQ9ES64 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ush1cQ9ES64 Atp1a3-201ENSMUST00000080882 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ush1cQ9ES64 Atp6v1a-201ENSMUST00000063661 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ush1cQ9ES64 Gtf2i-219ENSMUST00000174155 4141 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ush1cQ9ES64 Myh2-201ENSMUST00000018641 6018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ush1cQ9ES64 Lamb1-205ENSMUST00000169088 5557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ush1cQ9ES64 Tbl2-204ENSMUST00000153183 7488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ush1cQ9ES64 Chd7-206ENSMUST00000170391 3462 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ush1cQ9ES64 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Ush1cQ9ES64 Cd6-202ENSMUST00000039043 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ush1cQ9ES64 Rnf20-210ENSMUST00000167496 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ush1cQ9ES64 Rpap1-202ENSMUST00000099529 4813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ush1cQ9ES64 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ush1cQ9ES64 4933413J09Rik-202ENSMUST00000059648 3387 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ush1cQ9ES64 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ush1cQ9ES64 Fhdc1-201ENSMUST00000091002 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ush1cQ9ES64 Rapgef2-206ENSMUST00000195708 6964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ush1cQ9ES64 Odf2l-204ENSMUST00000106192 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ush1cQ9ES64 Parvg-207ENSMUST00000163667 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ush1cQ9ES64 Zfp608-201ENSMUST00000064763 6112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ush1cQ9ES64 Dclk2-202ENSMUST00000191752 8042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ush1cQ9ES64 Il6st-201ENSMUST00000070731 5207 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ush1cQ9ES64 Rsph10b-203ENSMUST00000166847 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ush1cQ9ES64 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ush1cQ9ES64 Piwil1-201ENSMUST00000086056 4016 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ush1cQ9ES64 Eif3a-201ENSMUST00000025955 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ush1cQ9ES64 Hpcal4-201ENSMUST00000059667 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ush1cQ9ES64 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ush1cQ9ES64 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ush1cQ9ES64 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ush1cQ9ES64 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Ush1cQ9ES64 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ush1cQ9ES64 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Ush1cQ9ES64 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ush1cQ9ES64 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Ush1cQ9ES64 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Ush1cQ9ES64 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Ush1cQ9ES64 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Ush1cQ9ES64 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Ush1cQ9ES64 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ush1cQ9ES64 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ush1cQ9ES64 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ush1cQ9ES64 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ush1cQ9ES64 Ipo4-201ENSMUST00000047131 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ush1cQ9ES64 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ush1cQ9ES64 Gcc1-202ENSMUST00000090511 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ush1cQ9ES64 Ipo13-201ENSMUST00000036156 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ush1cQ9ES64 Phka2-203ENSMUST00000112377 3947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ush1cQ9ES64 Anxa6-201ENSMUST00000102727 2471 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ush1cQ9ES64 Kcna1-201ENSMUST00000055168 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ush1cQ9ES64 Nup210-201ENSMUST00000032179 7037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ush1cQ9ES64 Sptan1-204ENSMUST00000113717 7958 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ush1cQ9ES64 Tacc2-205ENSMUST00000207282 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ush1cQ9ES64 March7-202ENSMUST00000102747 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ush1cQ9ES64 H2-Q1-202ENSMUST00000105041 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ush1cQ9ES64 Rasal1-201ENSMUST00000031606 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ush1cQ9ES64 Lactb2-201ENSMUST00000027071 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ush1cQ9ES64 Tirap-203ENSMUST00000176531 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ush1cQ9ES64 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ush1cQ9ES64 Gm37660-201ENSMUST00000192754 1732 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Ush1cQ9ES64 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ush1cQ9ES64 Nfic-201ENSMUST00000020461 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ush1cQ9ES64 Trp53inp2-201ENSMUST00000043237 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ush1cQ9ES64 Rasal2-204ENSMUST00000132699 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ush1cQ9ES64 Armt1-201ENSMUST00000095893 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ush1cQ9ES64 Dhx34-201ENSMUST00000094816 4073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ush1cQ9ES64 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Ush1cQ9ES64 Rxfp2-206ENSMUST00000201612 2470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ush1cQ9ES64 Tcf4-251ENSMUST00000202474 1810 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ush1cQ9ES64 Art2b-202ENSMUST00000209526 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ush1cQ9ES64 Hgs-203ENSMUST00000106205 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ush1cQ9ES64 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ush1cQ9ES64 Snw1-201ENSMUST00000021428 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ush1cQ9ES64 Synpo2l-202ENSMUST00000117386 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ush1cQ9ES64 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ush1cQ9ES64 Os9-202ENSMUST00000164259 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ush1cQ9ES64 Sgpp2-201ENSMUST00000036172 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ush1cQ9ES64 Pcdhb21-201ENSMUST00000061405 4705 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ush1cQ9ES64 Nell2-202ENSMUST00000166170 3366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ush1cQ9ES64 Ttpa-201ENSMUST00000098244 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ush1cQ9ES64 Cish-204ENSMUST00000168260 2742 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ush1cQ9ES64 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ush1cQ9ES64 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ush1cQ9ES64 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Ush1cQ9ES64 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ush1cQ9ES64 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Ush1cQ9ES64 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.7 ms