Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2F1

Pramef12, PRAME family member 12, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef12Q9D2F1 Tcf4-238ENSMUST00000201631 2660 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Pramef12Q9D2F1 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pramef12Q9D2F1 Rnf6-201ENSMUST00000067837 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pramef12Q9D2F1 Traf7-201ENSMUST00000070777 2384 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Pramef12Q9D2F1 Tacc2-201ENSMUST00000033141 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Pramef12Q9D2F1 Poll-201ENSMUST00000026239 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pramef12Q9D2F1 2610011E03Rik-201ENSMUST00000200128 2235 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Pramef12Q9D2F1 Specc1-213ENSMUST00000202179 6676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pramef12Q9D2F1 Slc44a1-204ENSMUST00000107647 2176 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Pramef12Q9D2F1 Slc37a2-201ENSMUST00000115068 5943 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pramef12Q9D2F1 Spata7-203ENSMUST00000101146 1913 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pramef12Q9D2F1 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pramef12Q9D2F1 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pramef12Q9D2F1 Trappc8-202ENSMUST00000097658 2703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pramef12Q9D2F1 Madd-209ENSMUST00000111371 5816 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pramef12Q9D2F1 Madd-210ENSMUST00000111372 5813 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pramef12Q9D2F1 L3mbtl2-208ENSMUST00000174229 2578 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pramef12Q9D2F1 Rin2-202ENSMUST00000110005 4641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pramef12Q9D2F1 Epha5-206ENSMUST00000113406 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pramef12Q9D2F1 Grm5-201ENSMUST00000107263 3516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pramef12Q9D2F1 Pcnx-201ENSMUST00000021567 12139 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pramef12Q9D2F1 Cd72-205ENSMUST00000107926 1419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pramef12Q9D2F1 Cd72-203ENSMUST00000098105 1420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pramef12Q9D2F1 Pnp2-201ENSMUST00000095925 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pramef12Q9D2F1 Xpnpep1-209ENSMUST00000183108 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pramef12Q9D2F1 Phrf1-202ENSMUST00000122143 4864 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pramef12Q9D2F1 Kank4-201ENSMUST00000102790 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pramef12Q9D2F1 Cdk2ap1-202ENSMUST00000111472 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pramef12Q9D2F1 Rab15-202ENSMUST00000118604 778 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pramef12Q9D2F1 Mir1901-201ENSMUST00000122616 78 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Pramef12Q9D2F1 Spx-202ENSMUST00000126521 357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pramef12Q9D2F1 C230038L03Rik-202ENSMUST00000136294 1197 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pramef12Q9D2F1 Gm16347-202ENSMUST00000149000 772 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pramef12Q9D2F1 Gm6397-201ENSMUST00000161973 1069 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Pramef12Q9D2F1 Agtpbp1-216ENSMUST00000168821 721 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pramef12Q9D2F1 Gm17334-201ENSMUST00000170390 907 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pramef12Q9D2F1 Ager-207ENSMUST00000173992 1248 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pramef12Q9D2F1 Prox2os-201ENSMUST00000177043 1133 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pramef12Q9D2F1 Gm8100-201ENSMUST00000182906 988 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Pramef12Q9D2F1 Gm3332-201ENSMUST00000189337 928 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Pramef12Q9D2F1 Gm19166-201ENSMUST00000196041 1063 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Pramef12Q9D2F1 Rpl36-ps9-201ENSMUST00000196458 277 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Pramef12Q9D2F1 Gm44593-201ENSMUST00000208372 1249 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pramef12Q9D2F1 Gm45338-201ENSMUST00000209198 820 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pramef12Q9D2F1 Gm3028-201ENSMUST00000213805 1119 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Pramef12Q9D2F1 AC174797.2-202ENSMUST00000225729 568 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Pramef12Q9D2F1 Mrpl30-201ENSMUST00000027256 969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pramef12Q9D2F1 Emp3-201ENSMUST00000038876 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pramef12Q9D2F1 Fam151b-201ENSMUST00000040106 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pramef12Q9D2F1 Gm7551-201ENSMUST00000089593 1074 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Pramef12Q9D2F1 Tagln3-201ENSMUST00000096057 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pramef12Q9D2F1 Gipr-201ENSMUST00000094790 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pramef12Q9D2F1 Gm2238-201ENSMUST00000192074 3669 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Pramef12Q9D2F1 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pramef12Q9D2F1 Sema6d-207ENSMUST00000103240 4372 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pramef12Q9D2F1 Rfx6-204ENSMUST00000219364 2682 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pramef12Q9D2F1 Rac1-201ENSMUST00000080537 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pramef12Q9D2F1 AC154517.2-201ENSMUST00000220829 2458 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Pramef12Q9D2F1 Mdh1b-201ENSMUST00000114094 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pramef12Q9D2F1 Mapk3-203ENSMUST00000091328 1716 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pramef12Q9D2F1 Arhgef2-206ENSMUST00000175779 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pramef12Q9D2F1 Dip2a-202ENSMUST00000105417 6383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pramef12Q9D2F1 Acnat2-201ENSMUST00000081541 1664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pramef12Q9D2F1 Hnrnpk-202ENSMUST00000116403 2970 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pramef12Q9D2F1 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pramef12Q9D2F1 Fam78a-201ENSMUST00000056406 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pramef12Q9D2F1 Fnip2-203ENSMUST00000133154 7299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pramef12Q9D2F1 Trim46-202ENSMUST00000090924 2721 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pramef12Q9D2F1 Dpysl5-201ENSMUST00000088081 5022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pramef12Q9D2F1 Gm12915-201ENSMUST00000131381 1499 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pramef12Q9D2F1 Ppp3cb-202ENSMUST00000159027 3831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pramef12Q9D2F1 Med1-202ENSMUST00000092735 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pramef12Q9D2F1 Pabpc4-204ENSMUST00000106243 3111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pramef12Q9D2F1 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pramef12Q9D2F1 Jph2-202ENSMUST00000109425 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pramef12Q9D2F1 Zfp426-202ENSMUST00000115562 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pramef12Q9D2F1 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pramef12Q9D2F1 Pcnx3-202ENSMUST00000113615 7264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pramef12Q9D2F1 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pramef12Q9D2F1 Mfsd13b-201ENSMUST00000033166 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pramef12Q9D2F1 Hk1-205ENSMUST00000130422 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pramef12Q9D2F1 Timm10b-204ENSMUST00000106784 494 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pramef12Q9D2F1 Yipf6-202ENSMUST00000113811 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pramef12Q9D2F1 Gm11246-201ENSMUST00000120880 345 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Pramef12Q9D2F1 Gm13563-201ENSMUST00000125518 643 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pramef12Q9D2F1 Gm22138-201ENSMUST00000158748 128 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Pramef12Q9D2F1 Cldn16-202ENSMUST00000161053 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pramef12Q9D2F1 Gm20535-201ENSMUST00000173157 1268 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pramef12Q9D2F1 1110038B12Rik-208ENSMUST00000174714 520 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pramef12Q9D2F1 Glmp-208ENSMUST00000176519 447 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pramef12Q9D2F1 Rpl31-202ENSMUST00000178079 487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pramef12Q9D2F1 Gm9630-201ENSMUST00000178304 885 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Pramef12Q9D2F1 Gm3671-201ENSMUST00000182463 1007 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Pramef12Q9D2F1 Gm17831-201ENSMUST00000205579 900 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Pramef12Q9D2F1 AC153505.1-201ENSMUST00000218819 1071 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Pramef12Q9D2F1 Ggps1-204ENSMUST00000221713 667 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pramef12Q9D2F1 Tmem258-201ENSMUST00000040372 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pramef12Q9D2F1 Snora73b-201ENSMUST00000083419 205 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Pramef12Q9D2F1 Slc35b3-202ENSMUST00000167513 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pramef12Q9D2F1 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.7 ms