Protein–RNA interactions for Protein: Q9D176

Susd3, Sushi domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Susd3Q9D176 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Susd3Q9D176 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Susd3Q9D176 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Susd3Q9D176 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Susd3Q9D176 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Susd3Q9D176 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
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Susd3Q9D176 Gm6740-201ENSMUST00000100617 864 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Susd3Q9D176 Hist1h4i-201ENSMUST00000102977 727 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
Susd3Q9D176 Ighv1-62-3-201ENSMUST00000103532 405 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
Susd3Q9D176 Gm23439-201ENSMUST00000104292 132 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Susd3Q9D176 Gm11475-201ENSMUST00000118482 476 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Susd3Q9D176 Gm12946-201ENSMUST00000122969 519 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Susd3Q9D176 Gm16069-201ENSMUST00000131146 545 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
Susd3Q9D176 Gm14275-201ENSMUST00000152112 430 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Susd3Q9D176 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Susd3Q9D176 C130080G10Rik-204ENSMUST00000155185 954 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Susd3Q9D176 Gm8824-201ENSMUST00000182962 990 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Susd3Q9D176 Gm38103-201ENSMUST00000191707 864 ntBASIC12□□□□□ -0.49
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Susd3Q9D176 Gm6518-201ENSMUST00000208450 342 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Susd3Q9D176 4933407I05Rik-202ENSMUST00000213467 420 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Susd3Q9D176 AC170597.1-201ENSMUST00000221956 440 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Susd3Q9D176 Cby1-201ENSMUST00000023064 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Susd3Q9D176 Cd300c2-201ENSMUST00000092464 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Susd3Q9D176 4631405J19Rik-201ENSMUST00000099699 1225 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Susd3Q9D176 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Susd3Q9D176 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Susd3Q9D176 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Susd3Q9D176 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Susd3Q9D176 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Susd3Q9D176 AC154354.1-203ENSMUST00000225565 1364 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Susd3Q9D176 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Susd3Q9D176 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Susd3Q9D176 Gm14005-210ENSMUST00000225087 1413 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Susd3Q9D176 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Susd3Q9D176 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Susd3Q9D176 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Susd3Q9D176 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Susd3Q9D176 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Susd3Q9D176 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Susd3Q9D176 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Susd3Q9D176 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Susd3Q9D176 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
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Susd3Q9D176 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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Susd3Q9D176 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Susd3Q9D176 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Susd3Q9D176 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
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Susd3Q9D176 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Susd3Q9D176 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
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