Protein–RNA interactions for Protein: Q9D024

Ccdc47, Coiled-coil domain-containing protein 47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc47Q9D024 Fyn-206ENSMUST00000136659 1910 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccdc47Q9D024 6030443J06Rik-202ENSMUST00000181374 1353 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccdc47Q9D024 Hrct1-201ENSMUST00000095109 1452 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccdc47Q9D024 Smarca2-216ENSMUST00000176769 5703 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccdc47Q9D024 Sh3tc1-201ENSMUST00000070203 4549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccdc47Q9D024 Ptger4-202ENSMUST00000120563 3312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccdc47Q9D024 Sirt2-209ENSMUST00000170068 1585 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccdc47Q9D024 Gm13848-202ENSMUST00000211663 1560 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccdc47Q9D024 Slc39a8-205ENSMUST00000167390 3533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccdc47Q9D024 Oscar-203ENSMUST00000148012 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccdc47Q9D024 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccdc47Q9D024 Spatc1l-201ENSMUST00000009259 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccdc47Q9D024 Fam45a-202ENSMUST00000119633 2267 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccdc47Q9D024 Cbl-211ENSMUST00000206720 11372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccdc47Q9D024 Anxa11-201ENSMUST00000022416 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccdc47Q9D024 Ctsc-201ENSMUST00000032779 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccdc47Q9D024 Reps1-201ENSMUST00000126390 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccdc47Q9D024 Ckmt1-201ENSMUST00000000317 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccdc47Q9D024 Zbtb45-205ENSMUST00000210282 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccdc47Q9D024 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccdc47Q9D024 Axl-202ENSMUST00000085948 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccdc47Q9D024 Gm43727-201ENSMUST00000198021 2647 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccdc47Q9D024 Gm1995-201ENSMUST00000220838 2602 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccdc47Q9D024 Tyk2-203ENSMUST00000214454 4770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccdc47Q9D024 Ctdspl2-201ENSMUST00000036647 5053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccdc47Q9D024 Csnk1g1-202ENSMUST00000117849 5173 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccdc47Q9D024 Rbm3-202ENSMUST00000115615 1183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccdc47Q9D024 Rbm3-203ENSMUST00000115616 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccdc47Q9D024 Gm13205-201ENSMUST00000123548 562 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccdc47Q9D024 Bnip3-203ENSMUST00000130500 719 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccdc47Q9D024 1110008E08Rik-202ENSMUST00000183621 723 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccdc47Q9D024 Mir7677-201ENSMUST00000184226 67 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccdc47Q9D024 Ighv5-7-201ENSMUST00000192302 244 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccdc47Q9D024 4930578M07Rik-202ENSMUST00000212946 552 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccdc47Q9D024 AC110091.1-201ENSMUST00000216004 691 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccdc47Q9D024 Erg28-201ENSMUST00000021676 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccdc47Q9D024 Pebp4-201ENSMUST00000022678 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccdc47Q9D024 Polr2d-201ENSMUST00000025106 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccdc47Q9D024 Prg2-201ENSMUST00000028467 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccdc47Q9D024 Adm2-201ENSMUST00000066991 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccdc47Q9D024 Zfp639-201ENSMUST00000029203 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccdc47Q9D024 Art3-201ENSMUST00000113083 1561 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccdc47Q9D024 Galnt10-201ENSMUST00000066987 4715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccdc47Q9D024 Gm29480-201ENSMUST00000188589 1655 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccdc47Q9D024 Eif5a2-201ENSMUST00000060500 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccdc47Q9D024 Cldn18-202ENSMUST00000112882 1750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccdc47Q9D024 Tcf25-202ENSMUST00000108840 2582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccdc47Q9D024 Csrnp3-207ENSMUST00000145598 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccdc47Q9D024 Slc39a6-201ENSMUST00000070726 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccdc47Q9D024 Susd5-201ENSMUST00000135338 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccdc47Q9D024 Sh3tc2-201ENSMUST00000051720 4536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccdc47Q9D024 Grin1-205ENSMUST00000114312 3838 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccdc47Q9D024 Grin1-207ENSMUST00000114317 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccdc47Q9D024 Pik3cd-203ENSMUST00000105689 3132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccdc47Q9D024 Gck-201ENSMUST00000102920 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccdc47Q9D024 9330199G10Rik-202ENSMUST00000221607 1728 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccdc47Q9D024 Tubgcp2-201ENSMUST00000026547 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccdc47Q9D024 Armc5-201ENSMUST00000044660 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccdc47Q9D024 Eif5-212ENSMUST00000222375 3547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccdc47Q9D024 Tbl2-204ENSMUST00000153183 7488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccdc47Q9D024 AC122840.1-201ENSMUST00000220915 3334 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccdc47Q9D024 Rad51ap1-202ENSMUST00000112221 1871 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Ccdc47Q9D024 Gm27246-201ENSMUST00000183611 1240 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccdc47Q9D024 Pfn1-201ENSMUST00000018437 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccdc47Q9D024 Trav13-4-dv7-202ENSMUST00000184905 264 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccdc47Q9D024 Gm18038-201ENSMUST00000197900 485 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccdc47Q9D024 Tmem258-201ENSMUST00000040372 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccdc47Q9D024 Nol6-201ENSMUST00000030138 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccdc47Q9D024 Ripk4-202ENSMUST00000113743 3743 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Ccdc47Q9D024 Rfx1-201ENSMUST00000005600 4172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccdc47Q9D024 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccdc47Q9D024 Rab3d-203ENSMUST00000122211 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccdc47Q9D024 Agxt2-204ENSMUST00000110542 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccdc47Q9D024 Vsig10l-201ENSMUST00000107977 3836 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccdc47Q9D024 D030068K23Rik-201ENSMUST00000180382 2617 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccdc47Q9D024 Cpsf7-201ENSMUST00000038379 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccdc47Q9D024 5930412G12Rik-201ENSMUST00000091324 2403 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccdc47Q9D024 Rtp4-202ENSMUST00000209422 1859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccdc47Q9D024 Nr1i3-202ENSMUST00000075469 1305 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccdc47Q9D024 Dennd4a-201ENSMUST00000038890 8645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccdc47Q9D024 Rabgef1-203ENSMUST00000119797 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccdc47Q9D024 Atxn2l-203ENSMUST00000167759 4023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccdc47Q9D024 Slc7a7-201ENSMUST00000000984 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccdc47Q9D024 Ntrk2-201ENSMUST00000079828 8744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccdc47Q9D024 Ablim1-211ENSMUST00000111555 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccdc47Q9D024 Acoxl-201ENSMUST00000028859 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccdc47Q9D024 Cadm1-203ENSMUST00000114547 4444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccdc47Q9D024 Add2-203ENSMUST00000203279 1454 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccdc47Q9D024 March7-202ENSMUST00000102747 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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