Protein–RNA interactions for Protein: Q9CYI0

Protein Njmu-R1, mousemouse

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Length 393 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CYI0 Gm13376-201ENSMUST00000128743 448 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q9CYI0 Adgre5-208ENSMUST00000166939 2980 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q9CYI0 Ccl4-201ENSMUST00000019074 660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q9CYI0 4833445I07Rik-202ENSMUST00000194104 579 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q9CYI0 Gm19287-201ENSMUST00000203190 358 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Q9CYI0 Gm13522-202ENSMUST00000209682 997 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q9CYI0 AC121960.1-201ENSMUST00000227982 564 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Q9CYI0 Adgre5-201ENSMUST00000002964 2986 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q9CYI0 Cox6a2-201ENSMUST00000033049 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q9CYI0 Cryab-201ENSMUST00000034562 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q9CYI0 Mybphl-201ENSMUST00000090563 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q9CYI0 Gm5965-201ENSMUST00000009191 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q9CYI0 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q9CYI0 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q9CYI0 Tbc1d14-210ENSMUST00000140607 4649 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q9CYI0 Gm44152-201ENSMUST00000205007 1691 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Q9CYI0 Chil1-201ENSMUST00000082060 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q9CYI0 Anxa8-201ENSMUST00000022519 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q9CYI0 Lvrn-201ENSMUST00000025358 3219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q9CYI0 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q9CYI0 Prf1-202ENSMUST00000219375 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q9CYI0 Dgcr8-201ENSMUST00000009321 4320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q9CYI0 Gm26642-201ENSMUST00000180981 2782 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q9CYI0 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q9CYI0 Sparc-209ENSMUST00000216313 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q9CYI0 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q9CYI0 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q9CYI0 Ces5a-203ENSMUST00000212009 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q9CYI0 Tirap-203ENSMUST00000176531 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q9CYI0 Trpv6-203ENSMUST00000201471 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q9CYI0 Pla2g15-201ENSMUST00000034377 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q9CYI0 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q9CYI0 Bub1-201ENSMUST00000028858 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q9CYI0 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q9CYI0 Srrt-212ENSMUST00000199243 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q9CYI0 Ippk-201ENSMUST00000021817 2856 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q9CYI0 Mob3a-201ENSMUST00000003438 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q9CYI0 Agxt2-204ENSMUST00000110542 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q9CYI0 Gm9129-201ENSMUST00000218173 1689 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Q9CYI0 Gm11663-201ENSMUST00000117888 290 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Q9CYI0 Gm13809-201ENSMUST00000117921 597 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Q9CYI0 Rhox5-201ENSMUST00000179626 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q9CYI0 Gm10774-201ENSMUST00000188689 204 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Q9CYI0 Gm42817-201ENSMUST00000198962 607 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q9CYI0 Gm35960-201ENSMUST00000202712 767 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Q9CYI0 Gm9797-202ENSMUST00000218003 294 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Q9CYI0 AC122408.1-201ENSMUST00000218949 218 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Q9CYI0 Csrp2-203ENSMUST00000219502 544 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q9CYI0 Gm40983-201ENSMUST00000222524 502 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q9CYI0 AC154849.4-201ENSMUST00000224868 365 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Q9CYI0 Mrpl41-201ENSMUST00000045604 776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q9CYI0 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q9CYI0 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q9CYI0 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q9CYI0 Cdc20b-201ENSMUST00000109244 1620 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q9CYI0 Lingo4-201ENSMUST00000050975 3645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q9CYI0 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q9CYI0 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q9CYI0 Fli1-201ENSMUST00000016231 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q9CYI0 Ldb3-204ENSMUST00000064098 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q9CYI0 Aknad1-202ENSMUST00000133931 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q9CYI0 Gm29480-201ENSMUST00000188589 1655 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q9CYI0 2410002F23Rik-205ENSMUST00000107949 3610 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q9CYI0 Agpat3-205ENSMUST00000105390 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q9CYI0 Capn3-204ENSMUST00000110716 2752 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q9CYI0 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q9CYI0 Fam114a2-201ENSMUST00000020831 2557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q9CYI0 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q9CYI0 Zfp1-201ENSMUST00000077791 1811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q9CYI0 S100a16-206ENSMUST00000107335 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q9CYI0 Cd27-203ENSMUST00000112282 588 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q9CYI0 Cspp1-204ENSMUST00000119714 1268 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q9CYI0 Gm13461-201ENSMUST00000120980 662 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Q9CYI0 Gm8199-201ENSMUST00000121323 823 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Q9CYI0 Rpl28-ps1-201ENSMUST00000121497 414 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Q9CYI0 Gm14235-201ENSMUST00000142445 366 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q9CYI0 Gm10051-201ENSMUST00000145209 414 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Q9CYI0 Gm6397-201ENSMUST00000161973 1069 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Q9CYI0 Gm28686-201ENSMUST00000187404 609 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Q9CYI0 Gm5051-201ENSMUST00000204085 485 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Q9CYI0 Gm2553-201ENSMUST00000215986 605 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Q9CYI0 Neil1-201ENSMUST00000034842 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q9CYI0 Gm7551-201ENSMUST00000089593 1074 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Q9CYI0 Abcc5-202ENSMUST00000079158 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q9CYI0 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q9CYI0 Papss1-201ENSMUST00000029666 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q9CYI0 Arhgap39-201ENSMUST00000036176 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q9CYI0 Ecd-201ENSMUST00000022344 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q9CYI0 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q9CYI0 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q9CYI0 Tas1r2-201ENSMUST00000030510 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q9CYI0 Ripk4-202ENSMUST00000113743 3743 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q9CYI0 Susd3-201ENSMUST00000021816 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q9CYI0 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q9CYI0 Nr1h3-203ENSMUST00000111355 1672 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q9CYI0 Cyp2a12-201ENSMUST00000075552 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q9CYI0 Gmppb-202ENSMUST00000112295 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q9CYI0 Spop-201ENSMUST00000107722 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q9CYI0 Gm13657-201ENSMUST00000135682 1939 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q9CYI0 Fam71f1-201ENSMUST00000090487 1584 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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