Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXT6

Kdm8, JmjC domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm8Q9CXT6 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Kdm8Q9CXT6 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Kdm8Q9CXT6 Oc90-202ENSMUST00000079776 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Kdm8Q9CXT6 Clic3-201ENSMUST00000102918 791 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Kdm8Q9CXT6 Gm25766-201ENSMUST00000104101 131 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Kdm8Q9CXT6 Vbp1-202ENSMUST00000114070 632 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Kdm8Q9CXT6 Gm15507-201ENSMUST00000133523 592 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Kdm8Q9CXT6 Rpl9-ps7-201ENSMUST00000140507 579 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Kdm8Q9CXT6 Gm13703-201ENSMUST00000150705 449 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Kdm8Q9CXT6 Gm9866-204ENSMUST00000183238 351 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Kdm8Q9CXT6 Gm28760-202ENSMUST00000190376 481 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Kdm8Q9CXT6 Gm9136-201ENSMUST00000193368 454 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Kdm8Q9CXT6 D8Ertd738e-201ENSMUST00000019506 616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Kdm8Q9CXT6 Gm8574-201ENSMUST00000203207 924 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Kdm8Q9CXT6 Ssr4-201ENSMUST00000002090 765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Kdm8Q9CXT6 AC120394.2-201ENSMUST00000213905 702 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Kdm8Q9CXT6 AC160028.1-201ENSMUST00000219645 1095 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Kdm8Q9CXT6 Rpl9-ps4-201ENSMUST00000075549 579 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Kdm8Q9CXT6 Gm5451-201ENSMUST00000080545 579 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Kdm8Q9CXT6 Slc10a1-203ENSMUST00000218342 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Kdm8Q9CXT6 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Kdm8Q9CXT6 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Kdm8Q9CXT6 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Kdm8Q9CXT6 Pdp1-202ENSMUST00000095144 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Kdm8Q9CXT6 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Kdm8Q9CXT6 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Kdm8Q9CXT6 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Kdm8Q9CXT6 Gm9796-201ENSMUST00000062249 2250 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Kdm8Q9CXT6 Hnrnpa2b1-203ENSMUST00000114459 1728 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Kdm8Q9CXT6 Dnmt1-201ENSMUST00000004202 5367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Kdm8Q9CXT6 Myo5b-203ENSMUST00000121875 6065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Kdm8Q9CXT6 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Kdm8Q9CXT6 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Kdm8Q9CXT6 Fuca2-203ENSMUST00000121465 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Kdm8Q9CXT6 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Kdm8Q9CXT6 AC122018.1-201ENSMUST00000217769 1686 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Kdm8Q9CXT6 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Kdm8Q9CXT6 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Kdm8Q9CXT6 Ric3-201ENSMUST00000055993 5281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Kdm8Q9CXT6 Gm23272-201ENSMUST00000104053 129 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Kdm8Q9CXT6 Rbm3-205ENSMUST00000115619 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Kdm8Q9CXT6 Gm12419-201ENSMUST00000116649 636 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Kdm8Q9CXT6 9430093N23Rik-201ENSMUST00000152494 515 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Kdm8Q9CXT6 5430405H02Rik-201ENSMUST00000153616 1431 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Kdm8Q9CXT6 Gm23218-201ENSMUST00000158124 276 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Kdm8Q9CXT6 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Kdm8Q9CXT6 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Kdm8Q9CXT6 Gm15744-201ENSMUST00000161734 213 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Kdm8Q9CXT6 Gm10320-201ENSMUST00000170205 527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Kdm8Q9CXT6 Gm20420-201ENSMUST00000173178 639 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Kdm8Q9CXT6 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Kdm8Q9CXT6 Gm5100-201ENSMUST00000195631 589 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Kdm8Q9CXT6 Folr2-203ENSMUST00000210598 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Kdm8Q9CXT6 1700012D14Rik-204ENSMUST00000210788 547 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Kdm8Q9CXT6 Gm36423-202ENSMUST00000222215 1298 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Kdm8Q9CXT6 Nckap5l-201ENSMUST00000023747 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Kdm8Q9CXT6 Tex35-201ENSMUST00000027884 909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Kdm8Q9CXT6 Olfr584-201ENSMUST00000098210 964 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Kdm8Q9CXT6 Scaf4-202ENSMUST00000163419 4169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Kdm8Q9CXT6 Arhgap20-204ENSMUST00000130405 3881 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Kdm8Q9CXT6 Wdr59-201ENSMUST00000034437 4896 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Kdm8Q9CXT6 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Kdm8Q9CXT6 H2-T10-201ENSMUST00000166442 1481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Kdm8Q9CXT6 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Kdm8Q9CXT6 Mcm9-204ENSMUST00000219838 4132 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Kdm8Q9CXT6 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Kdm8Q9CXT6 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Kdm8Q9CXT6 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Kdm8Q9CXT6 Epha5-205ENSMUST00000113403 4675 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Kdm8Q9CXT6 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Kdm8Q9CXT6 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Kdm8Q9CXT6 Enpp5-201ENSMUST00000024756 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Kdm8Q9CXT6 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Kdm8Q9CXT6 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Kdm8Q9CXT6 Bbs1-201ENSMUST00000053506 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Kdm8Q9CXT6 Metap2-201ENSMUST00000047910 4424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Kdm8Q9CXT6 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Kdm8Q9CXT6 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Kdm8Q9CXT6 Gm7278-201ENSMUST00000119836 1401 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Kdm8Q9CXT6 4930453L07Rik-201ENSMUST00000209053 1439 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Kdm8Q9CXT6 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Kdm8Q9CXT6 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Kdm8Q9CXT6 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Kdm8Q9CXT6 Tmem25-202ENSMUST00000114705 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Kdm8Q9CXT6 Tcea3-201ENSMUST00000102533 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Kdm8Q9CXT6 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Kdm8Q9CXT6 Acrbp-204ENSMUST00000112413 672 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Kdm8Q9CXT6 Cntrobos-201ENSMUST00000132834 383 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Kdm8Q9CXT6 Gad1-207ENSMUST00000148210 1021 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Kdm8Q9CXT6 4930405O22Rik-201ENSMUST00000164605 954 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Kdm8Q9CXT6 Gm29410-201ENSMUST00000188383 694 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Kdm8Q9CXT6 AC165154.1-201ENSMUST00000226661 340 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Kdm8Q9CXT6 Eny2-204ENSMUST00000226827 558 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Kdm8Q9CXT6 Nudt2-201ENSMUST00000030154 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Kdm8Q9CXT6 4930596D02Rik-201ENSMUST00000043266 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Kdm8Q9CXT6 Fam25c-201ENSMUST00000052126 408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Kdm8Q9CXT6 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Kdm8Q9CXT6 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Kdm8Q9CXT6 Vps9d1-202ENSMUST00000118279 2696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Kdm8Q9CXT6 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.9 ms