Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWM4

Pfdn1, Prefoldin subunit 1, mousemouse

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Length 122 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfdn1Q9CWM4 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Pfdn1Q9CWM4 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Pfdn1Q9CWM4 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Pfdn1Q9CWM4 Gm14064-201ENSMUST00000134833 727 ntTSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Pfdn1Q9CWM4 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Pfdn1Q9CWM4 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Pfdn1Q9CWM4 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Pfdn1Q9CWM4 Gm4034-201ENSMUST00000187674 480 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Pfdn1Q9CWM4 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Pfdn1Q9CWM4 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Pfdn1Q9CWM4 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Pfdn1Q9CWM4 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Pfdn1Q9CWM4 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Pfdn1Q9CWM4 1700016D06Rik-201ENSMUST00000033906 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Pfdn1Q9CWM4 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Pfdn1Q9CWM4 Lhfpl5-201ENSMUST00000080780 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Pfdn1Q9CWM4 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Pfdn1Q9CWM4 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Pfdn1Q9CWM4 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Pfdn1Q9CWM4 Gm28774-201ENSMUST00000187087 1498 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Pfdn1Q9CWM4 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Pfdn1Q9CWM4 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Pfdn1Q9CWM4 Gm16958-201ENSMUST00000180603 1765 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Pfdn1Q9CWM4 Fcamr-202ENSMUST00000112477 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Pfdn1Q9CWM4 Exoc4-203ENSMUST00000115080 2369 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Pfdn1Q9CWM4 Ikzf4-204ENSMUST00000222067 2688 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Pfdn1Q9CWM4 Fxyd5-212ENSMUST00000162733 2998 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Pfdn1Q9CWM4 Prkd2-202ENSMUST00000168093 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Pfdn1Q9CWM4 Sgk3-203ENSMUST00000168907 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Pfdn1Q9CWM4 Rnf20-201ENSMUST00000029989 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Pfdn1Q9CWM4 Pex7-201ENSMUST00000020182 8099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Pfdn1Q9CWM4 Osbpl7-206ENSMUST00000168565 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Pfdn1Q9CWM4 Pip4k2c-201ENSMUST00000013970 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Pfdn1Q9CWM4 Scamp2-201ENSMUST00000045791 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Pfdn1Q9CWM4 Lct-201ENSMUST00000073490 6174 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Pfdn1Q9CWM4 Gm20755-201ENSMUST00000196893 1827 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Pfdn1Q9CWM4 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Pfdn1Q9CWM4 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Pfdn1Q9CWM4 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Pfdn1Q9CWM4 AC108858.2-201ENSMUST00000228186 1425 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Pfdn1Q9CWM4 Vamp1-202ENSMUST00000063588 1400 ntTSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Pfdn1Q9CWM4 Lrpap1-201ENSMUST00000030986 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Pfdn1Q9CWM4 Tbcel-203ENSMUST00000125995 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Pfdn1Q9CWM4 Ttc16-206ENSMUST00000161430 2874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Pfdn1Q9CWM4 Zfat-204ENSMUST00000162054 4386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Pfdn1Q9CWM4 5033428I22Rik-204ENSMUST00000210633 6652 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Pfdn1Q9CWM4 Parp1-201ENSMUST00000027777 3873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Pfdn1Q9CWM4 Wipf2-201ENSMUST00000037480 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Pfdn1Q9CWM4 Snhg11-201ENSMUST00000109488 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Pfdn1Q9CWM4 Zdhhc6-205ENSMUST00000224291 2603 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Pfdn1Q9CWM4 Fgf1-202ENSMUST00000115582 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Pfdn1Q9CWM4 Ces3b-202ENSMUST00000093221 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Pfdn1Q9CWM4 Phf21a-202ENSMUST00000068702 6023 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Pfdn1Q9CWM4 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Pfdn1Q9CWM4 Capza1-201ENSMUST00000094028 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Pfdn1Q9CWM4 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Pfdn1Q9CWM4 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Pfdn1Q9CWM4 Hmgcll1-202ENSMUST00000117981 1189 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Pfdn1Q9CWM4 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Pfdn1Q9CWM4 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Pfdn1Q9CWM4 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Pfdn1Q9CWM4 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Pfdn1Q9CWM4 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Pfdn1Q9CWM4 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Pfdn1Q9CWM4 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Pfdn1Q9CWM4 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Pfdn1Q9CWM4 Gm29233-201ENSMUST00000190311 281 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Pfdn1Q9CWM4 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Pfdn1Q9CWM4 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Pfdn1Q9CWM4 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
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Pfdn1Q9CWM4 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Pfdn1Q9CWM4 Pcdh15-207ENSMUST00000124046 5336 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Pfdn1Q9CWM4 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Pfdn1Q9CWM4 Nrf1-208ENSMUST00000115208 2492 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Pfdn1Q9CWM4 Stat5a-201ENSMUST00000004145 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Pfdn1Q9CWM4 Gm28047-201ENSMUST00000184772 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Pfdn1Q9CWM4 Slit2-208ENSMUST00000173107 9960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Pfdn1Q9CWM4 Qtrt2-201ENSMUST00000023387 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Pfdn1Q9CWM4 Aldh4a1-201ENSMUST00000039818 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Pfdn1Q9CWM4 Atp2b2-202ENSMUST00000101044 4586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Pfdn1Q9CWM4 Thbs4-201ENSMUST00000022213 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Pfdn1Q9CWM4 Rpe65-202ENSMUST00000196999 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Pfdn1Q9CWM4 Ccdc93-202ENSMUST00000112621 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Pfdn1Q9CWM4 Cr1l-204ENSMUST00000193094 2776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Pfdn1Q9CWM4 Gm26751-201ENSMUST00000181218 4245 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Pfdn1Q9CWM4 Tubb4a-201ENSMUST00000071135 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Pfdn1Q9CWM4 4933407K13Rik-203ENSMUST00000138943 4364 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Pfdn1Q9CWM4 Pard3-201ENSMUST00000026921 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Pfdn1Q9CWM4 Chd1-201ENSMUST00000024620 3196 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Pfdn1Q9CWM4 Slc27a5-201ENSMUST00000032539 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Pfdn1Q9CWM4 AU041133-202ENSMUST00000201286 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Pfdn1Q9CWM4 Lipg-201ENSMUST00000066532 3787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Pfdn1Q9CWM4 1500002C15Rik-201ENSMUST00000178987 2183 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Pfdn1Q9CWM4 Tmem109-201ENSMUST00000038128 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Pfdn1Q9CWM4 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Pfdn1Q9CWM4 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Pfdn1Q9CWM4 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Pfdn1Q9CWM4 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Pfdn1Q9CWM4 Anp32a-205ENSMUST00000135395 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
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