Protein–RNA interactions for Protein: Q9CV28

MINDY3, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase MINDY-3, mousemouse

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Length 444 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MINDY3Q9CV28 Gm6015-201ENSMUST00000217493 1586 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
MINDY3Q9CV28 Slc2a7-201ENSMUST00000059893 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
MINDY3Q9CV28 Cpsf7-201ENSMUST00000038379 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
MINDY3Q9CV28 Zbtb42-201ENSMUST00000169593 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
MINDY3Q9CV28 Pga5-201ENSMUST00000025647 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
MINDY3Q9CV28 Dlc1-201ENSMUST00000033923 6159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
MINDY3Q9CV28 Gm22323-201ENSMUST00000103832 109 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
MINDY3Q9CV28 Sumo3-203ENSMUST00000124024 776 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
MINDY3Q9CV28 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
MINDY3Q9CV28 AA672651-201ENSMUST00000151550 489 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
MINDY3Q9CV28 Rps28-202ENSMUST00000166693 271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
MINDY3Q9CV28 Gm17099-201ENSMUST00000166780 412 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
MINDY3Q9CV28 Gm25700-201ENSMUST00000177693 110 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
MINDY3Q9CV28 Gm37259-201ENSMUST00000193903 849 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
MINDY3Q9CV28 Gm43179-201ENSMUST00000198797 275 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
MINDY3Q9CV28 Gm43822-201ENSMUST00000200285 476 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
MINDY3Q9CV28 Pcbd1-201ENSMUST00000020298 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
MINDY3Q9CV28 Gm43962-201ENSMUST00000203898 190 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
MINDY3Q9CV28 Gm44992-206ENSMUST00000209313 1261 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
MINDY3Q9CV28 Zfp706-203ENSMUST00000226453 517 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
MINDY3Q9CV28 Tmem50a-201ENSMUST00000030626 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
MINDY3Q9CV28 Odf4-201ENSMUST00000038932 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
MINDY3Q9CV28 Snrpn-201ENSMUST00000059305 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
MINDY3Q9CV28 Zfp108-202ENSMUST00000205982 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
MINDY3Q9CV28 Clspn-201ENSMUST00000048391 5027 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
MINDY3Q9CV28 Nme8-202ENSMUST00000091763 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
MINDY3Q9CV28 Hrct1-201ENSMUST00000095109 1452 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
MINDY3Q9CV28 Epha5-206ENSMUST00000113406 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
MINDY3Q9CV28 4930431P19Rik-202ENSMUST00000207761 2959 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
MINDY3Q9CV28 Fam170a-201ENSMUST00000039121 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
MINDY3Q9CV28 Zfp280d-205ENSMUST00000183468 1834 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
MINDY3Q9CV28 Dpep2-206ENSMUST00000227363 1844 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
MINDY3Q9CV28 Spg11-201ENSMUST00000036450 7671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
MINDY3Q9CV28 Cacng5-201ENSMUST00000039071 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
MINDY3Q9CV28 Mfsd13b-201ENSMUST00000033166 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
MINDY3Q9CV28 Specc1-213ENSMUST00000202179 6676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
MINDY3Q9CV28 Acat1-201ENSMUST00000034547 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
MINDY3Q9CV28 Etfrf1-207ENSMUST00000111726 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
MINDY3Q9CV28 A630076J17Rik-201ENSMUST00000179399 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
MINDY3Q9CV28 Kdelr1-205ENSMUST00000211716 1350 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
MINDY3Q9CV28 Tunar-201ENSMUST00000180458 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
MINDY3Q9CV28 Zfp64-201ENSMUST00000087971 2438 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
MINDY3Q9CV28 Ttc30a2-201ENSMUST00000099995 2431 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
MINDY3Q9CV28 Cul9-204ENSMUST00000182485 7848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
MINDY3Q9CV28 Spata7-203ENSMUST00000101146 1913 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
MINDY3Q9CV28 Stx5a-213ENSMUST00000176381 2251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
MINDY3Q9CV28 Gm26872-201ENSMUST00000180862 2261 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
MINDY3Q9CV28 Stxbp5l-201ENSMUST00000023526 3344 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
MINDY3Q9CV28 Stxbp5l-204ENSMUST00000114781 3544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
MINDY3Q9CV28 Dab2ip-207ENSMUST00000112992 6184 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
MINDY3Q9CV28 Slc6a9-209ENSMUST00000163288 2107 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
MINDY3Q9CV28 Zmiz1-208ENSMUST00000162645 7482 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
MINDY3Q9CV28 Rufy2-203ENSMUST00000122231 2664 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
MINDY3Q9CV28 Eif5a2-201ENSMUST00000060500 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
MINDY3Q9CV28 Ciz1-204ENSMUST00000113334 2871 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
MINDY3Q9CV28 Epb41-207ENSMUST00000105975 5235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
MINDY3Q9CV28 Tnnt3-211ENSMUST00000105949 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
MINDY3Q9CV28 Gm15004-201ENSMUST00000119192 630 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
MINDY3Q9CV28 Gm4760-201ENSMUST00000119663 1030 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
MINDY3Q9CV28 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
MINDY3Q9CV28 Sh2d6-203ENSMUST00000159877 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
MINDY3Q9CV28 Sh2d6-206ENSMUST00000162561 1251 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
MINDY3Q9CV28 Gm6114-201ENSMUST00000182472 968 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
MINDY3Q9CV28 1700120C18Rik-201ENSMUST00000182952 985 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
MINDY3Q9CV28 Ank3-234ENSMUST00000182993 1233 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
MINDY3Q9CV28 1700045I11Rik-201ENSMUST00000194752 493 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
MINDY3Q9CV28 Gm38317-201ENSMUST00000195564 343 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
MINDY3Q9CV28 Gm8956-201ENSMUST00000203939 825 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
MINDY3Q9CV28 Nkg7-203ENSMUST00000206741 686 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
MINDY3Q9CV28 Gm44651-201ENSMUST00000207343 372 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
MINDY3Q9CV28 Camsap3-209ENSMUST00000207970 3817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
MINDY3Q9CV28 Emp3-203ENSMUST00000210297 601 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
MINDY3Q9CV28 AC025913.2-202ENSMUST00000219248 605 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
MINDY3Q9CV28 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
MINDY3Q9CV28 Lce3d-201ENSMUST00000059053 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
MINDY3Q9CV28 Ccdc28a-202ENSMUST00000080860 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
MINDY3Q9CV28 Ephb2-203ENSMUST00000105846 3653 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
MINDY3Q9CV28 Nrg1-202ENSMUST00000207417 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
MINDY3Q9CV28 Mbtps2-203ENSMUST00000112522 3891 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
MINDY3Q9CV28 Mbtps2-208ENSMUST00000179062 3890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
MINDY3Q9CV28 Rspry1-201ENSMUST00000060389 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
MINDY3Q9CV28 Vill-202ENSMUST00000074734 2440 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
MINDY3Q9CV28 Gid8-202ENSMUST00000078687 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
MINDY3Q9CV28 Nrd1-203ENSMUST00000106644 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
MINDY3Q9CV28 Tmem215-201ENSMUST00000049655 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
MINDY3Q9CV28 St6galnac6-201ENSMUST00000072111 2277 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
MINDY3Q9CV28 Kdm5c-201ENSMUST00000082177 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
MINDY3Q9CV28 Duox2-201ENSMUST00000053734 5744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
MINDY3Q9CV28 Ccdc183-201ENSMUST00000028309 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
MINDY3Q9CV28 Acad8-201ENSMUST00000060513 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
MINDY3Q9CV28 Arsa-202ENSMUST00000165199 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
MINDY3Q9CV28 Zfp251-201ENSMUST00000080406 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
MINDY3Q9CV28 Slc52a2-201ENSMUST00000023220 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
MINDY3Q9CV28 Cd2bp2-207ENSMUST00000206026 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
MINDY3Q9CV28 Mff-209ENSMUST00000160972 1358 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
MINDY3Q9CV28 Prdx2-202ENSMUST00000109733 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
MINDY3Q9CV28 Srsf5-205ENSMUST00000110356 1568 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
MINDY3Q9CV28 Sirt2-209ENSMUST00000170068 1585 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
MINDY3Q9CV28 Gm43242-201ENSMUST00000199507 1776 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
MINDY3Q9CV28 Gimap5-201ENSMUST00000055558 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
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