Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQJ8

Ndufb9, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufb9Q9CQJ8 Nol3-201ENSMUST00000014920 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ndufb9Q9CQJ8 Tnnt3-206ENSMUST00000105944 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ndufb9Q9CQJ8 Tnnt3-210ENSMUST00000105948 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ndufb9Q9CQJ8 Tnnt3-212ENSMUST00000105950 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ndufb9Q9CQJ8 Folr1-201ENSMUST00000106981 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ndufb9Q9CQJ8 Folr1-202ENSMUST00000106982 1039 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ndufb9Q9CQJ8 Cdk2ap1-202ENSMUST00000111472 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ndufb9Q9CQJ8 Adam19-201ENSMUST00000011400 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ndufb9Q9CQJ8 Gm14058-201ENSMUST00000116082 735 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Ndufb9Q9CQJ8 Gm13035-201ENSMUST00000117496 342 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Ndufb9Q9CQJ8 Gm15207-201ENSMUST00000119259 442 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Ndufb9Q9CQJ8 Asb8-202ENSMUST00000123626 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ndufb9Q9CQJ8 Asb8-203ENSMUST00000123922 1162 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ndufb9Q9CQJ8 Gm1667-201ENSMUST00000151651 558 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ndufb9Q9CQJ8 4930557F10Rik-201ENSMUST00000155432 630 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ndufb9Q9CQJ8 Gm15954-201ENSMUST00000160746 466 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ndufb9Q9CQJ8 Tnnt3-224ENSMUST00000169299 1013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ndufb9Q9CQJ8 Tnnt3-226ENSMUST00000180152 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ndufb9Q9CQJ8 Mir7070-201ENSMUST00000183657 86 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Ndufb9Q9CQJ8 Eloc-207ENSMUST00000187910 620 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ndufb9Q9CQJ8 Gm2453-202ENSMUST00000195508 568 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ndufb9Q9CQJ8 Gm38314-201ENSMUST00000195709 625 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Ndufb9Q9CQJ8 Fxyd4-203ENSMUST00000203082 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ndufb9Q9CQJ8 Gm7848-201ENSMUST00000210739 718 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Ndufb9Q9CQJ8 Gm4657-201ENSMUST00000213839 787 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ndufb9Q9CQJ8 Luc7l-201ENSMUST00000025023 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ndufb9Q9CQJ8 Cfap100-207ENSMUST00000165673 2072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ndufb9Q9CQJ8 Arhgap30-201ENSMUST00000056449 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ndufb9Q9CQJ8 Ppnr-201ENSMUST00000190974 3525 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ndufb9Q9CQJ8 4930430F08Rik-201ENSMUST00000054471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ndufb9Q9CQJ8 Gm13347-201ENSMUST00000120298 1353 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Ndufb9Q9CQJ8 Brsk1-204ENSMUST00000205666 1398 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ndufb9Q9CQJ8 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ndufb9Q9CQJ8 Camsap3-209ENSMUST00000207970 3817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ndufb9Q9CQJ8 Xpnpep1-209ENSMUST00000183108 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ndufb9Q9CQJ8 Mmachc-201ENSMUST00000030453 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ndufb9Q9CQJ8 Vmn1r45-206ENSMUST00000227977 3297 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ndufb9Q9CQJ8 Katnal2-207ENSMUST00000137354 1482 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ndufb9Q9CQJ8 Spert-204ENSMUST00000169658 1474 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ndufb9Q9CQJ8 Mthfd1l-201ENSMUST00000043735 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ndufb9Q9CQJ8 Mob1a-201ENSMUST00000038658 4119 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ndufb9Q9CQJ8 Ercc4-201ENSMUST00000023206 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ndufb9Q9CQJ8 Gm16364-201ENSMUST00000153722 1313 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ndufb9Q9CQJ8 Gm3139-202ENSMUST00000201138 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ndufb9Q9CQJ8 Gm3183-203ENSMUST00000202911 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ndufb9Q9CQJ8 Chit1-203ENSMUST00000160060 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ndufb9Q9CQJ8 Gm37648-201ENSMUST00000192072 2563 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Ndufb9Q9CQJ8 Rph3a-201ENSMUST00000079204 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ndufb9Q9CQJ8 Prkd1-201ENSMUST00000002765 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ndufb9Q9CQJ8 Yars-201ENSMUST00000106054 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ndufb9Q9CQJ8 Rab27b-201ENSMUST00000069749 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ndufb9Q9CQJ8 Ccdc154-203ENSMUST00000182621 2402 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ndufb9Q9CQJ8 Ctsd-201ENSMUST00000066401 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ndufb9Q9CQJ8 Ttc29-202ENSMUST00000109902 1416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ndufb9Q9CQJ8 Gm13910-201ENSMUST00000121752 1428 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Ndufb9Q9CQJ8 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ndufb9Q9CQJ8 Gm26584-201ENSMUST00000180551 3216 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ndufb9Q9CQJ8 Vamp5-202ENSMUST00000101285 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ndufb9Q9CQJ8 Mrpl55-202ENSMUST00000108784 729 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ndufb9Q9CQJ8 1700080O16Rik-202ENSMUST00000114866 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ndufb9Q9CQJ8 Camk1d-202ENSMUST00000114987 1295 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ndufb9Q9CQJ8 Gm14724-201ENSMUST00000118400 537 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Ndufb9Q9CQJ8 Gm11700-201ENSMUST00000119409 403 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Ndufb9Q9CQJ8 Gm13461-201ENSMUST00000120980 662 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Ndufb9Q9CQJ8 Spata3-211ENSMUST00000159876 760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ndufb9Q9CQJ8 Gm38304-201ENSMUST00000161826 600 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ndufb9Q9CQJ8 Ccdc127-205ENSMUST00000162672 677 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ndufb9Q9CQJ8 Arid3b-204ENSMUST00000164010 1259 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ndufb9Q9CQJ8 Gm8100-201ENSMUST00000182906 988 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Ndufb9Q9CQJ8 Kdm4dl-201ENSMUST00000184843 1187 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Ndufb9Q9CQJ8 Gm27184-201ENSMUST00000185095 607 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ndufb9Q9CQJ8 Gm37246-201ENSMUST00000192665 835 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Ndufb9Q9CQJ8 1700016D08Rik-202ENSMUST00000195807 368 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Ndufb9Q9CQJ8 AC155637.1-201ENSMUST00000218560 636 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Ndufb9Q9CQJ8 Gm6867-201ENSMUST00000219165 425 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Ndufb9Q9CQJ8 Gm40983-201ENSMUST00000222524 502 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ndufb9Q9CQJ8 Agrp-201ENSMUST00000005849 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ndufb9Q9CQJ8 Matn2-202ENSMUST00000163455 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ndufb9Q9CQJ8 Art2b-202ENSMUST00000209526 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ndufb9Q9CQJ8 AC126257.2-201ENSMUST00000215507 2300 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Ndufb9Q9CQJ8 Apon-202ENSMUST00000218722 1747 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ndufb9Q9CQJ8 Snx29-203ENSMUST00000122168 2096 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ndufb9Q9CQJ8 Mtus1-202ENSMUST00000059115 6548 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ndufb9Q9CQJ8 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ndufb9Q9CQJ8 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ndufb9Q9CQJ8 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ndufb9Q9CQJ8 Gstcd-201ENSMUST00000029651 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ndufb9Q9CQJ8 Gaa-203ENSMUST00000106259 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ndufb9Q9CQJ8 Wdr66-202ENSMUST00000121964 4873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ndufb9Q9CQJ8 Gga3-201ENSMUST00000019135 3816 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ndufb9Q9CQJ8 Ugt1a8-201ENSMUST00000113139 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ndufb9Q9CQJ8 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ndufb9Q9CQJ8 Lrrc8c-201ENSMUST00000067924 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ndufb9Q9CQJ8 Zfp263-201ENSMUST00000023176 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ndufb9Q9CQJ8 Vmac-202ENSMUST00000164907 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ndufb9Q9CQJ8 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ndufb9Q9CQJ8 Ttc30a2-201ENSMUST00000099995 2431 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ndufb9Q9CQJ8 Pip4k2c-201ENSMUST00000013970 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ndufb9Q9CQJ8 Ctr9-201ENSMUST00000005749 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ndufb9Q9CQJ8 Wnt3-201ENSMUST00000000127 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.5 ms