Protein–RNA interactions for Protein: Q99PE5

Smim3, Small integral membrane protein 3, mousemouse

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Length 60 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim3Q99PE5 Bco1-202ENSMUST00000167370 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Smim3Q99PE5 Ica1-204ENSMUST00000115520 1876 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Smim3Q99PE5 Ttll10-206ENSMUST00000184348 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Smim3Q99PE5 Mms19-201ENSMUST00000026168 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Smim3Q99PE5 Mcf2l-217ENSMUST00000145067 5313 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Smim3Q99PE5 Olfr582-202ENSMUST00000210119 1787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Smim3Q99PE5 Sirpa-201ENSMUST00000049262 3644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Smim3Q99PE5 Gm17029-203ENSMUST00000153443 2758 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Smim3Q99PE5 Rps6ka1-209ENSMUST00000174481 2228 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Smim3Q99PE5 Thoc5-201ENSMUST00000038237 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Smim3Q99PE5 Supt16-201ENSMUST00000046709 4673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Smim3Q99PE5 Nfe2l1-212ENSMUST00000169828 3530 ntTSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Smim3Q99PE5 Rsl24d1-201ENSMUST00000034738 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Smim3Q99PE5 Gm8146-201ENSMUST00000192106 1847 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Smim3Q99PE5 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Smim3Q99PE5 Gm43868-201ENSMUST00000205187 2114 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Smim3Q99PE5 Gm44755-201ENSMUST00000207830 2102 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Smim3Q99PE5 Myh13-201ENSMUST00000081911 5817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Smim3Q99PE5 Ttll13-201ENSMUST00000058266 3010 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Smim3Q99PE5 Myo9a-205ENSMUST00000135298 12198 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Smim3Q99PE5 Gm2606-201ENSMUST00000100754 1002 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Smim3Q99PE5 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Smim3Q99PE5 Oxsm-202ENSMUST00000112624 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Smim3Q99PE5 Gm12286-201ENSMUST00000119246 1002 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Smim3Q99PE5 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Smim3Q99PE5 Slc19a1-209ENSMUST00000144234 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Smim3Q99PE5 1700088E04Rik-201ENSMUST00000169604 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Smim3Q99PE5 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Smim3Q99PE5 Gm43002-201ENSMUST00000200310 155 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Smim3Q99PE5 Nkg7-203ENSMUST00000206741 686 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Smim3Q99PE5 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Smim3Q99PE5 Ptpn23-201ENSMUST00000040021 5346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Smim3Q99PE5 Rap1gap-201ENSMUST00000047243 3247 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Smim3Q99PE5 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Smim3Q99PE5 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Smim3Q99PE5 Borcs7-201ENSMUST00000074912 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Smim3Q99PE5 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Smim3Q99PE5 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Smim3Q99PE5 Ctnnd1-204ENSMUST00000099941 5783 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Smim3Q99PE5 Camk2a-203ENSMUST00000102888 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Smim3Q99PE5 Tln2-205ENSMUST00000215267 4999 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Smim3Q99PE5 Cldn18-202ENSMUST00000112882 1750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Smim3Q99PE5 Rgs6-211ENSMUST00000191107 1621 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Smim3Q99PE5 Kalrn-205ENSMUST00000114953 4722 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Smim3Q99PE5 Csf1r-202ENSMUST00000115268 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Smim3Q99PE5 Gm19040-201ENSMUST00000203280 4726 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Smim3Q99PE5 Asb1-201ENSMUST00000027538 5826 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Smim3Q99PE5 Crybg3-205ENSMUST00000172910 2870 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Smim3Q99PE5 AC110816.2-201ENSMUST00000220360 1323 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Smim3Q99PE5 Agrn-203ENSMUST00000105575 7262 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Smim3Q99PE5 Entpd8-201ENSMUST00000044078 2299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Smim3Q99PE5 Pml-202ENSMUST00000114136 4343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Smim3Q99PE5 Ddr1-202ENSMUST00000097333 3593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Smim3Q99PE5 Synj2-203ENSMUST00000115784 2634 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Smim3Q99PE5 D030068K23Rik-201ENSMUST00000180382 2617 ntTSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Smim3Q99PE5 Steap3-203ENSMUST00000112641 5158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Smim3Q99PE5 Hnrnpa2b1-202ENSMUST00000090002 1662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.8
Smim3Q99PE5 Mybph-202ENSMUST00000191577 2320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.8
Smim3Q99PE5 Gm10829-201ENSMUST00000202084 2988 ntBASIC10.02□□□□□ -0.8
Smim3Q99PE5 Vcan-202ENSMUST00000109544 5702 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.8
Smim3Q99PE5 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Smim3Q99PE5 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.8
Smim3Q99PE5 Dcaf4-201ENSMUST00000021645 2008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.8
Smim3Q99PE5 AC154171.2-201ENSMUST00000225219 2652 ntBASIC10.02□□□□□ -0.8
Smim3Q99PE5 Pin1-201ENSMUST00000034689 3843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Smim3Q99PE5 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Smim3Q99PE5 Acrbp-202ENSMUST00000088294 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Smim3Q99PE5 Tram2-201ENSMUST00000037998 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Smim3Q99PE5 Auts2-209ENSMUST00000161804 5392 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Smim3Q99PE5 Tmem138-201ENSMUST00000025568 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Smim3Q99PE5 Msh3-201ENSMUST00000022220 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Smim3Q99PE5 Snap29-201ENSMUST00000023449 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Smim3Q99PE5 Mageb4-201ENSMUST00000096378 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Smim3Q99PE5 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Smim3Q99PE5 Fam45a-202ENSMUST00000119633 2267 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Smim3Q99PE5 Adamts9-201ENSMUST00000113438 8016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Smim3Q99PE5 Slc2a4-203ENSMUST00000141837 1776 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Smim3Q99PE5 Lins1-202ENSMUST00000077967 2647 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Smim3Q99PE5 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Smim3Q99PE5 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Smim3Q99PE5 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Smim3Q99PE5 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Smim3Q99PE5 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Smim3Q99PE5 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Smim3Q99PE5 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Smim3Q99PE5 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Smim3Q99PE5 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Smim3Q99PE5 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Smim3Q99PE5 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Smim3Q99PE5 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Smim3Q99PE5 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Smim3Q99PE5 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Smim3Q99PE5 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Smim3Q99PE5 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Smim3Q99PE5 Ifi27-203ENSMUST00000076788 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Smim3Q99PE5 Ckmt1-201ENSMUST00000000317 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Smim3Q99PE5 Ahnak2-201ENSMUST00000101010 2821 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Smim3Q99PE5 Specc1l-204ENSMUST00000218766 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Smim3Q99PE5 Cacna1c-226ENSMUST00000219833 7591 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Smim3Q99PE5 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
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