Protein–RNA interactions for Protein: Q99KG7

Hps4, Hermansky-Pudlak syndrome 4 protein homolog, mousemouse

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Length 671 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hps4Q99KG7 Ccdc12-201ENSMUST00000019803 834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hps4Q99KG7 4930413E15Rik-201ENSMUST00000202500 1290 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hps4Q99KG7 Chn2-212ENSMUST00000204115 783 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hps4Q99KG7 6430531B16Rik-204ENSMUST00000209335 898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hps4Q99KG7 Gm2875-201ENSMUST00000211333 360 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Hps4Q99KG7 Pbld1-204ENSMUST00000219045 602 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hps4Q99KG7 Tex35-201ENSMUST00000027884 909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hps4Q99KG7 Prss47-202ENSMUST00000203968 1353 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hps4Q99KG7 Immt-202ENSMUST00000101301 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hps4Q99KG7 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hps4Q99KG7 Nelfcd-201ENSMUST00000016397 2280 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hps4Q99KG7 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hps4Q99KG7 Myo9b-202ENSMUST00000168839 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hps4Q99KG7 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hps4Q99KG7 Tfcp2-201ENSMUST00000009877 3250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hps4Q99KG7 Rgma-202ENSMUST00000119206 3481 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hps4Q99KG7 Ak4-202ENSMUST00000106945 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hps4Q99KG7 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hps4Q99KG7 Sdad1-201ENSMUST00000031364 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hps4Q99KG7 Arhgef10l-202ENSMUST00000069623 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hps4Q99KG7 Cbfa2t2-202ENSMUST00000099178 3247 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hps4Q99KG7 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hps4Q99KG7 Ckmt1-201ENSMUST00000000317 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Hps4Q99KG7 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Hps4Q99KG7 Cry2-201ENSMUST00000090559 3976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Hps4Q99KG7 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hps4Q99KG7 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hps4Q99KG7 Txndc5-203ENSMUST00000160653 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hps4Q99KG7 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hps4Q99KG7 Gatad2a-201ENSMUST00000065169 3812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hps4Q99KG7 4931415C17Rik-202ENSMUST00000131064 2255 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hps4Q99KG7 Ly6e-210ENSMUST00000188866 2068 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hps4Q99KG7 Phykpl-206ENSMUST00000167797 3116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hps4Q99KG7 6030458C11Rik-201ENSMUST00000057256 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hps4Q99KG7 Hpgd-201ENSMUST00000034026 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hps4Q99KG7 Oxsm-202ENSMUST00000112624 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hps4Q99KG7 Gm10785-201ENSMUST00000156242 1583 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hps4Q99KG7 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hps4Q99KG7 Mafk-202ENSMUST00000110836 3097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hps4Q99KG7 Nhlrc2-201ENSMUST00000071423 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Hps4Q99KG7 Plgrkt-209ENSMUST00000152936 604 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hps4Q99KG7 Gm28388-201ENSMUST00000186262 437 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Hps4Q99KG7 Gm38210-201ENSMUST00000191944 809 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
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Hps4Q99KG7 Timm10b-210ENSMUST00000209588 373 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Hps4Q99KG7 Pgpep1l-201ENSMUST00000032770 953 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Hps4Q99KG7 H3f3a-201ENSMUST00000081026 888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Hps4Q99KG7 Gm10775-201ENSMUST00000099425 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Hps4Q99KG7 Atp2b2-203ENSMUST00000101045 8877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Hps4Q99KG7 Herc3-201ENSMUST00000031823 3596 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hps4Q99KG7 Qpctl-201ENSMUST00000032566 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hps4Q99KG7 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hps4Q99KG7 Papss1-201ENSMUST00000029666 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Hps4Q99KG7 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Hps4Q99KG7 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hps4Q99KG7 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Hps4Q99KG7 Abcb9-201ENSMUST00000031354 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Hps4Q99KG7 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hps4Q99KG7 Ap1g2-211ENSMUST00000170285 2596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Hps4Q99KG7 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hps4Q99KG7 Acly-203ENSMUST00000107389 4426 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hps4Q99KG7 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hps4Q99KG7 Ddx46-201ENSMUST00000099479 5664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hps4Q99KG7 Zfp810-201ENSMUST00000086278 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hps4Q99KG7 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hps4Q99KG7 Gm14942-201ENSMUST00000119642 336 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Hps4Q99KG7 Mia-202ENSMUST00000121848 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hps4Q99KG7 Gm13182-201ENSMUST00000122241 312 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Hps4Q99KG7 Mir1901-201ENSMUST00000122616 78 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Hps4Q99KG7 Tmem190-201ENSMUST00000013235 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hps4Q99KG7 1110028F11Rik-201ENSMUST00000137077 837 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hps4Q99KG7 Gm23153-201ENSMUST00000175323 313 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Hps4Q99KG7 Gm37981-201ENSMUST00000194280 535 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Hps4Q99KG7 Gm5982-201ENSMUST00000196234 512 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Hps4Q99KG7 Gm42657-201ENSMUST00000201746 211 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Hps4Q99KG7 Gm44593-201ENSMUST00000208372 1249 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hps4Q99KG7 Olfr567-ps1-201ENSMUST00000210349 857 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Hps4Q99KG7 1110019B22Rik-202ENSMUST00000218396 989 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hps4Q99KG7 Gm9661-201ENSMUST00000221611 1122 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Hps4Q99KG7 Rgs6-211ENSMUST00000191107 1621 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hps4Q99KG7 Abhd14b-207ENSMUST00000213179 1627 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hps4Q99KG7 Poc1a-201ENSMUST00000072206 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hps4Q99KG7 Atp6v0a1-210ENSMUST00000168757 3967 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hps4Q99KG7 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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