Protein–RNA interactions for Protein: Q99J79

Ddb2, DNA damage-binding protein 2, mousemouse

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Length 432 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddb2Q99J79 Maml2-202ENSMUST00000159294 6404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ddb2Q99J79 Aldh4a1-201ENSMUST00000039818 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ddb2Q99J79 Cdh18-204ENSMUST00000165614 2162 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ddb2Q99J79 H2-M2-201ENSMUST00000016427 1550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ddb2Q99J79 Riox2-206ENSMUST00000160571 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ddb2Q99J79 Rfx1-201ENSMUST00000005600 4172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ddb2Q99J79 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ddb2Q99J79 Efna1-202ENSMUST00000118587 1632 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ddb2Q99J79 Olfm4-201ENSMUST00000088735 1640 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ddb2Q99J79 Olfr283-202ENSMUST00000215830 2392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ddb2Q99J79 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ddb2Q99J79 AC160411.1-201ENSMUST00000218544 4560 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ddb2Q99J79 Vps9d1-202ENSMUST00000118279 2696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ddb2Q99J79 Rabgef1-203ENSMUST00000119797 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ddb2Q99J79 Gdpd5-208ENSMUST00000213887 2711 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ddb2Q99J79 Hr-205ENSMUST00000163060 5278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ddb2Q99J79 Rapgef2-206ENSMUST00000195708 6964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ddb2Q99J79 Gm26286-201ENSMUST00000104166 134 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Ddb2Q99J79 Eif5a-205ENSMUST00000108608 775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ddb2Q99J79 Rpl36-ps10-201ENSMUST00000117431 216 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Ddb2Q99J79 Gm15711-201ENSMUST00000118889 535 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Ddb2Q99J79 Gm12380-201ENSMUST00000119012 544 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Ddb2Q99J79 Gm13376-201ENSMUST00000128743 448 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ddb2Q99J79 Hmgn1-202ENSMUST00000133885 261 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ddb2Q99J79 Gm20442-201ENSMUST00000174630 492 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ddb2Q99J79 Prox2os-201ENSMUST00000177043 1133 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ddb2Q99J79 1110008E08Rik-202ENSMUST00000183621 723 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Ddb2Q99J79 Ighv4-2-201ENSMUST00000192975 362 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Ddb2Q99J79 Gstp-ps-201ENSMUST00000195526 631 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Ddb2Q99J79 Gm42800-201ENSMUST00000202494 733 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ddb2Q99J79 4930578M07Rik-202ENSMUST00000212946 552 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ddb2Q99J79 AC160052.1-201ENSMUST00000213173 1248 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ddb2Q99J79 Tmem258-201ENSMUST00000040372 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ddb2Q99J79 Mrpl41-201ENSMUST00000045604 776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ddb2Q99J79 Immt-202ENSMUST00000101301 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ddb2Q99J79 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ddb2Q99J79 Slc35a4-202ENSMUST00000050476 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ddb2Q99J79 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ddb2Q99J79 Tmem269-201ENSMUST00000030394 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ddb2Q99J79 Oxsm-202ENSMUST00000112624 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ddb2Q99J79 Ehd3-201ENSMUST00000024860 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ddb2Q99J79 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ddb2Q99J79 Mark4-201ENSMUST00000085715 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ddb2Q99J79 Maats1-201ENSMUST00000023501 2750 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ddb2Q99J79 Gm5936-201ENSMUST00000114116 2857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ddb2Q99J79 Gm5640-201ENSMUST00000114119 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ddb2Q99J79 Enah-201ENSMUST00000078719 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ddb2Q99J79 DXBay18-201ENSMUST00000080324 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ddb2Q99J79 Gm14685-201ENSMUST00000088459 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ddb2Q99J79 Cldn18-202ENSMUST00000112882 1750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ddb2Q99J79 Tpm1-201ENSMUST00000030185 1797 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ddb2Q99J79 Gabre-201ENSMUST00000064780 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ddb2Q99J79 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ddb2Q99J79 Cd300lf-201ENSMUST00000051264 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ddb2Q99J79 Tmem237-202ENSMUST00000094917 1869 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ddb2Q99J79 Th-202ENSMUST00000105929 1950 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ddb2Q99J79 Bicra-204ENSMUST00000210781 5975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ddb2Q99J79 Epha5-205ENSMUST00000113403 4675 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ddb2Q99J79 Spats2l-203ENSMUST00000164302 2088 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ddb2Q99J79 Zfp532-202ENSMUST00000169679 5003 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ddb2Q99J79 Tacc2-201ENSMUST00000033141 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ddb2Q99J79 Jak3-203ENSMUST00000110013 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ddb2Q99J79 Jak3-201ENSMUST00000051995 4019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ddb2Q99J79 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ddb2Q99J79 Tepsin-202ENSMUST00000093901 2770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ddb2Q99J79 Grip2-201ENSMUST00000159684 3006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ddb2Q99J79 Sgk1-204ENSMUST00000120509 3096 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ddb2Q99J79 1700025G04Rik-201ENSMUST00000044581 9559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ddb2Q99J79 Herc3-201ENSMUST00000031823 3596 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
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Ddb2Q99J79 Gm12216-202ENSMUST00000120776 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ddb2Q99J79 Gm14277-201ENSMUST00000121195 360 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Ddb2Q99J79 Gm14051-201ENSMUST00000131603 377 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ddb2Q99J79 Gm11210-201ENSMUST00000150203 422 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ddb2Q99J79 Rpl41-203ENSMUST00000176683 437 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ddb2Q99J79 Trav13-4-dv7-202ENSMUST00000184905 264 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ddb2Q99J79 Gm34728-201ENSMUST00000201510 414 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ddb2Q99J79 Gm18212-201ENSMUST00000211678 889 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Ddb2Q99J79 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ddb2Q99J79 Abracl-204ENSMUST00000220110 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ddb2Q99J79 Rpl17-ps3-201ENSMUST00000221295 556 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Ddb2Q99J79 Pebp4-201ENSMUST00000022678 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ddb2Q99J79 Nit2-201ENSMUST00000023432 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ddb2Q99J79 Fabp4-201ENSMUST00000029041 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ddb2Q99J79 Dnajc17-201ENSMUST00000038439 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ddb2Q99J79 Kcnk7-201ENSMUST00000052448 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ddb2Q99J79 2410015M20Rik-201ENSMUST00000052832 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ddb2Q99J79 Olfr981-201ENSMUST00000059859 997 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ddb2Q99J79 S100a1-201ENSMUST00000060738 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ddb2Q99J79 Nr1i3-202ENSMUST00000075469 1305 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ddb2Q99J79 Spatc1l-201ENSMUST00000009259 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ddb2Q99J79 AC163354.1-205ENSMUST00000223262 1511 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ddb2Q99J79 Kbtbd12-202ENSMUST00000120933 4644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ddb2Q99J79 4930563E18Rik-201ENSMUST00000180948 1553 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ddb2Q99J79 Rgs6-211ENSMUST00000191107 1621 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ddb2Q99J79 Plet1-201ENSMUST00000114474 1689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ddb2Q99J79 Tbx10-201ENSMUST00000041871 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ddb2Q99J79 E330021D16Rik-203ENSMUST00000204830 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
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