Protein–RNA interactions for Protein: Q91VW3

Sh3bgrl3, SH3 domain-binding glutamic acid-rich-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bgrl3Q91VW3 Ldb2-204ENSMUST00000199256 2596 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Sh3bgrl3Q91VW3 Zfp108-202ENSMUST00000205982 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Sh3bgrl3Q91VW3 Csgalnact1-203ENSMUST00000130214 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Sh3bgrl3Q91VW3 Tesk2-201ENSMUST00000045542 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Sh3bgrl3Q91VW3 Erich3-203ENSMUST00000189969 3460 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
Sh3bgrl3Q91VW3 2410002F23Rik-204ENSMUST00000107948 2908 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Sh3bgrl3Q91VW3 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Sh3bgrl3Q91VW3 Scn5a-202ENSMUST00000117911 8453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Sh3bgrl3Q91VW3 Ikbkb-202ENSMUST00000063401 3977 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Sh3bgrl3Q91VW3 Myo1b-201ENSMUST00000018561 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Sh3bgrl3Q91VW3 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Sh3bgrl3Q91VW3 Ciita-201ENSMUST00000023147 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Sh3bgrl3Q91VW3 Synpr-201ENSMUST00000070323 2541 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Sh3bgrl3Q91VW3 Ccdc96-201ENSMUST00000060100 3585 ntAPPRIS P1 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Sh3bgrl3Q91VW3 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Sh3bgrl3Q91VW3 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Sh3bgrl3Q91VW3 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Sh3bgrl3Q91VW3 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
Sh3bgrl3Q91VW3 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Sh3bgrl3Q91VW3 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
Sh3bgrl3Q91VW3 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Sh3bgrl3Q91VW3 Taar7e-201ENSMUST00000092656 1077 ntAPPRIS P1 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Sh3bgrl3Q91VW3 Cd6-203ENSMUST00000080292 3032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Sh3bgrl3Q91VW3 1700017B05Rik-202ENSMUST00000213199 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm43447-201ENSMUST00000198471 1535 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
Sh3bgrl3Q91VW3 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Sh3bgrl3Q91VW3 Trmt2a-207ENSMUST00000140206 3520 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Sh3bgrl3Q91VW3 Ap1s2-203ENSMUST00000112294 3199 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Sh3bgrl3Q91VW3 Sh3gl2-201ENSMUST00000030212 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Sh3bgrl3Q91VW3 Dzip1l-203ENSMUST00000112885 4350 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm44207-201ENSMUST00000204568 1424 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
Sh3bgrl3Q91VW3 Sel1l-201ENSMUST00000021347 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Sh3bgrl3Q91VW3 Slc17a5-201ENSMUST00000052441 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm44152-201ENSMUST00000205007 1691 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
Sh3bgrl3Q91VW3 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Sh3bgrl3Q91VW3 Nfkbiz-202ENSMUST00000096026 4067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Sh3bgrl3Q91VW3 Ptpn11-201ENSMUST00000054547 5535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Sh3bgrl3Q91VW3 Map3k12-208ENSMUST00000171565 4318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm36635-201ENSMUST00000221152 1332 ntTSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Sh3bgrl3Q91VW3 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Sh3bgrl3Q91VW3 Scaf1-206ENSMUST00000211735 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Sh3bgrl3Q91VW3 Baiap3-206ENSMUST00000182825 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Sh3bgrl3Q91VW3 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Sh3bgrl3Q91VW3 Egfr-201ENSMUST00000020329 10208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Sh3bgrl3Q91VW3 Trpc6-203ENSMUST00000217462 3168 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Sh3bgrl3Q91VW3 D930048N14Rik-202ENSMUST00000117859 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Sh3bgrl3Q91VW3 Mier1-204ENSMUST00000106857 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Sh3bgrl3Q91VW3 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Sh3bgrl3Q91VW3 Slc10a7-201ENSMUST00000034111 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Sh3bgrl3Q91VW3 Thoc5-201ENSMUST00000038237 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Sh3bgrl3Q91VW3 Mab21l1-201ENSMUST00000075422 2492 ntAPPRIS P1 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Sh3bgrl3Q91VW3 Chd7-206ENSMUST00000170391 3462 ntTSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Sh3bgrl3Q91VW3 Dclk1-204ENSMUST00000196745 7962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Sh3bgrl3Q91VW3 Eef1d-205ENSMUST00000109972 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Sh3bgrl3Q91VW3 4930432K21Rik-202ENSMUST00000118856 2366 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Sh3bgrl3Q91VW3 Bmp3-203ENSMUST00000200388 6609 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Sh3bgrl3Q91VW3 AC125409.1-201ENSMUST00000223213 3370 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
Sh3bgrl3Q91VW3 Rad9b-201ENSMUST00000049009 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Sh3bgrl3Q91VW3 Car12-202ENSMUST00000085420 3639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Sh3bgrl3Q91VW3 Srrm2-201ENSMUST00000088621 8564 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Sh3bgrl3Q91VW3 Rin2-201ENSMUST00000094480 4657 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Sh3bgrl3Q91VW3 Fam227a-204ENSMUST00000187519 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Sh3bgrl3Q91VW3 Fhdc1-201ENSMUST00000091002 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Sh3bgrl3Q91VW3 Kcnab2-207ENSMUST00000160884 3922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Sh3bgrl3Q91VW3 Caprin1-202ENSMUST00000111147 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Sh3bgrl3Q91VW3 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Sh3bgrl3Q91VW3 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Sh3bgrl3Q91VW3 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm11439-201ENSMUST00000118598 409 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
Sh3bgrl3Q91VW3 Bmp5-201ENSMUST00000012281 3822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Sh3bgrl3Q91VW3 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Sh3bgrl3Q91VW3 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Sh3bgrl3Q91VW3 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Sh3bgrl3Q91VW3 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Sh3bgrl3Q91VW3 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm17040-201ENSMUST00000168672 548 ntTSL 3 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Sh3bgrl3Q91VW3 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
Sh3bgrl3Q91VW3 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Sh3bgrl3Q91VW3 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Sh3bgrl3Q91VW3 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Sh3bgrl3Q91VW3 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
Sh3bgrl3Q91VW3 Slc1a4-201ENSMUST00000004634 3872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Sh3bgrl3Q91VW3 Bahcc1-201ENSMUST00000044985 10726 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Sh3bgrl3Q91VW3 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Sh3bgrl3Q91VW3 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Sh3bgrl3Q91VW3 Rbm39-201ENSMUST00000029149 2711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.4 ms