Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2L8

Trappc12, Trafficking protein particle complex subunit 12, mousemouse

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Length 797 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc12Q8K2L8 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trappc12Q8K2L8 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trappc12Q8K2L8 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trappc12Q8K2L8 Cog3-203ENSMUST00000227473 4197 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Trappc12Q8K2L8 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trappc12Q8K2L8 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trappc12Q8K2L8 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Trappc12Q8K2L8 4930465M20Rik-201ENSMUST00000130564 1446 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Trappc12Q8K2L8 Gm21759-201ENSMUST00000178345 1828 ntBASIC13.71□□□□□ -0.22
Trappc12Q8K2L8 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Trappc12Q8K2L8 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Trappc12Q8K2L8 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Trappc12Q8K2L8 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Trappc12Q8K2L8 Srsf5-205ENSMUST00000110356 1568 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Trappc12Q8K2L8 Lta-201ENSMUST00000025266 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Trappc12Q8K2L8 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trappc12Q8K2L8 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trappc12Q8K2L8 Tarm1-203ENSMUST00000203821 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trappc12Q8K2L8 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trappc12Q8K2L8 Gabpb1-206ENSMUST00000110425 4153 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trappc12Q8K2L8 Cd55b-201ENSMUST00000112488 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trappc12Q8K2L8 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trappc12Q8K2L8 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trappc12Q8K2L8 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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Trappc12Q8K2L8 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trappc12Q8K2L8 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trappc12Q8K2L8 Rmdn1-202ENSMUST00000108253 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trappc12Q8K2L8 Olfr1267-ps1-201ENSMUST00000118957 930 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trappc12Q8K2L8 Gm45716-203ENSMUST00000153734 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trappc12Q8K2L8 1700007P06Rik-201ENSMUST00000160380 823 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trappc12Q8K2L8 Gm17192-201ENSMUST00000169031 511 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Trappc12Q8K2L8 Gm16938-201ENSMUST00000180517 464 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
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Trappc12Q8K2L8 Tmem242-203ENSMUST00000188282 822 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trappc12Q8K2L8 Tmbim7-204ENSMUST00000198739 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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Trappc12Q8K2L8 Fcer2a-206ENSMUST00000208438 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trappc12Q8K2L8 Fcer2a-208ENSMUST00000208603 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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Trappc12Q8K2L8 Actg1-201ENSMUST00000062147 876 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trappc12Q8K2L8 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trappc12Q8K2L8 Ckmt1-201ENSMUST00000000317 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trappc12Q8K2L8 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trappc12Q8K2L8 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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Trappc12Q8K2L8 Mog-201ENSMUST00000102665 1704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trappc12Q8K2L8 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trappc12Q8K2L8 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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Trappc12Q8K2L8 Fcrl1-201ENSMUST00000072480 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Trappc12Q8K2L8 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Trappc12Q8K2L8 Hps1-209ENSMUST00000162061 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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Trappc12Q8K2L8 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
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Trappc12Q8K2L8 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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Trappc12Q8K2L8 Gm14275-201ENSMUST00000152112 430 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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Trappc12Q8K2L8 1700065I16Rik-201ENSMUST00000185277 512 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
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Trappc12Q8K2L8 Gm5700-201ENSMUST00000191483 989 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Trappc12Q8K2L8 Gm43671-201ENSMUST00000200422 433 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Trappc12Q8K2L8 4930543N07Rik-202ENSMUST00000209503 1117 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Trappc12Q8K2L8 Gm5996-201ENSMUST00000211110 718 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Trappc12Q8K2L8 Gm34655-202ENSMUST00000215259 877 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Trappc12Q8K2L8 AC134869.4-202ENSMUST00000224350 837 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Trappc12Q8K2L8 Prss3-201ENSMUST00000096003 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Trappc12Q8K2L8 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Trappc12Q8K2L8 Acsf3-201ENSMUST00000015160 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Trappc12Q8K2L8 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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