Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFE2

Hpf1, Histone PARylation factor 1, mousemouse

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Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hpf1Q8CFE2 Rn7s1-201ENSMUST00000174924 300 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Hpf1Q8CFE2 Rn7s2-201ENSMUST00000175032 300 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Hpf1Q8CFE2 Gm26461-201ENSMUST00000175064 290 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Hpf1Q8CFE2 Spint5-202ENSMUST00000180193 443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hpf1Q8CFE2 Gm28071-201ENSMUST00000190355 478 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Hpf1Q8CFE2 Gm43068-201ENSMUST00000201095 1273 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Hpf1Q8CFE2 Gm43962-201ENSMUST00000203898 190 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Hpf1Q8CFE2 Ggps1-204ENSMUST00000221713 667 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hpf1Q8CFE2 Pebp4-201ENSMUST00000022678 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hpf1Q8CFE2 4930564D02Rik-201ENSMUST00000070584 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hpf1Q8CFE2 Olfr117-201ENSMUST00000073636 954 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hpf1Q8CFE2 Olfr130-201ENSMUST00000087129 954 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hpf1Q8CFE2 Eef1d-203ENSMUST00000089680 973 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hpf1Q8CFE2 Hist1h3a-201ENSMUST00000091701 534 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hpf1Q8CFE2 Npbwr1-201ENSMUST00000044180 3692 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hpf1Q8CFE2 Tnip1-201ENSMUST00000018482 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hpf1Q8CFE2 Otof-202ENSMUST00000114747 6881 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hpf1Q8CFE2 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hpf1Q8CFE2 Rftn1-202ENSMUST00000113195 2385 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hpf1Q8CFE2 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hpf1Q8CFE2 Traf7-201ENSMUST00000070777 2384 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hpf1Q8CFE2 R3hdm2-210ENSMUST00000164831 2937 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hpf1Q8CFE2 Rorc-204ENSMUST00000200009 1543 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hpf1Q8CFE2 Gm44260-201ENSMUST00000204946 2094 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Hpf1Q8CFE2 Gm18782-201ENSMUST00000209023 1399 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Hpf1Q8CFE2 Arhgap39-201ENSMUST00000036176 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hpf1Q8CFE2 Sod2-201ENSMUST00000007012 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hpf1Q8CFE2 Bbs1-201ENSMUST00000053506 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hpf1Q8CFE2 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hpf1Q8CFE2 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hpf1Q8CFE2 Myo16-201ENSMUST00000042103 6725 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hpf1Q8CFE2 Myo18a-205ENSMUST00000100794 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hpf1Q8CFE2 Gm29100-201ENSMUST00000187564 4410 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Hpf1Q8CFE2 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hpf1Q8CFE2 Taok1-202ENSMUST00000058496 12409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hpf1Q8CFE2 Pla2g6-206ENSMUST00000173163 3018 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hpf1Q8CFE2 Art3-201ENSMUST00000113083 1561 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hpf1Q8CFE2 0610037L13Rik-207ENSMUST00000125107 1551 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hpf1Q8CFE2 AC123619.2-202ENSMUST00000225097 1568 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Hpf1Q8CFE2 Grip1-205ENSMUST00000105262 4996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hpf1Q8CFE2 Asb8-204ENSMUST00000143400 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hpf1Q8CFE2 CU062626.3-201ENSMUST00000225522 1411 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Hpf1Q8CFE2 Gm44831-201ENSMUST00000208469 2989 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Hpf1Q8CFE2 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hpf1Q8CFE2 Acnat2-201ENSMUST00000081541 1664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hpf1Q8CFE2 Jhy-201ENSMUST00000034521 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hpf1Q8CFE2 Hopx-202ENSMUST00000113453 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hpf1Q8CFE2 Gm7857-201ENSMUST00000117957 358 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Hpf1Q8CFE2 Gm12217-201ENSMUST00000118858 696 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Hpf1Q8CFE2 Platr29-201ENSMUST00000130022 830 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hpf1Q8CFE2 Rprl1-201ENSMUST00000158050 327 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Hpf1Q8CFE2 Ip6k2-202ENSMUST00000192028 1199 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hpf1Q8CFE2 Gm44710-201ENSMUST00000208885 471 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hpf1Q8CFE2 CT571245.2-201ENSMUST00000218421 305 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Hpf1Q8CFE2 CT025694.1-201ENSMUST00000226188 934 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Hpf1Q8CFE2 Mcpt1-201ENSMUST00000022836 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hpf1Q8CFE2 Dnajc4-201ENSMUST00000025915 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hpf1Q8CFE2 Prr15l-202ENSMUST00000062172 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hpf1Q8CFE2 Apbb1-201ENSMUST00000081165 2530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hpf1Q8CFE2 Fyb2-201ENSMUST00000106803 3136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hpf1Q8CFE2 Zfand2a-202ENSMUST00000110851 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hpf1Q8CFE2 Brap-202ENSMUST00000111765 3861 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hpf1Q8CFE2 Cyp26b1-204ENSMUST00000204146 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hpf1Q8CFE2 Rgma-202ENSMUST00000119206 3481 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hpf1Q8CFE2 Gdpd2-201ENSMUST00000019503 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hpf1Q8CFE2 Rgs3-205ENSMUST00000107424 4084 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hpf1Q8CFE2 Zfp426-202ENSMUST00000115562 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hpf1Q8CFE2 Drd1-202ENSMUST00000221470 3576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hpf1Q8CFE2 Car14-201ENSMUST00000036181 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hpf1Q8CFE2 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hpf1Q8CFE2 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hpf1Q8CFE2 Ece1-201ENSMUST00000102518 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hpf1Q8CFE2 Vmn1r24-201ENSMUST00000228097 1901 ntAPPRIS P1 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hpf1Q8CFE2 Tgfb2-206ENSMUST00000195201 3485 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hpf1Q8CFE2 Hgs-203ENSMUST00000106205 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hpf1Q8CFE2 Zfp61-208ENSMUST00000165241 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hpf1Q8CFE2 5033406O09Rik-201ENSMUST00000221314 1662 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hpf1Q8CFE2 Igfbp4-201ENSMUST00000017637 3831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hpf1Q8CFE2 Gm26811-201ENSMUST00000181258 5485 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hpf1Q8CFE2 Ddx55-202ENSMUST00000111438 2737 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hpf1Q8CFE2 Lrrc27-201ENSMUST00000016124 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hpf1Q8CFE2 Satb1-208ENSMUST00000144331 6243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hpf1Q8CFE2 Grin1-206ENSMUST00000114314 3882 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hpf1Q8CFE2 Znrf3-203ENSMUST00000172492 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hpf1Q8CFE2 Gm22133-201ENSMUST00000102082 109 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Hpf1Q8CFE2 Myl4-202ENSMUST00000106956 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hpf1Q8CFE2 Gm16066-201ENSMUST00000118575 1086 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hpf1Q8CFE2 Gm4909-201ENSMUST00000118749 794 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Hpf1Q8CFE2 Dnajb6-202ENSMUST00000012734 1024 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hpf1Q8CFE2 Gm7568-202ENSMUST00000160446 709 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hpf1Q8CFE2 Tnnt1-213ENSMUST00000178163 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hpf1Q8CFE2 Gm4034-201ENSMUST00000187674 480 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Hpf1Q8CFE2 Myl4-201ENSMUST00000018800 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hpf1Q8CFE2 Gm18827-201ENSMUST00000188341 790 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Hpf1Q8CFE2 Gm44934-201ENSMUST00000208941 238 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hpf1Q8CFE2 AC107638.1-201ENSMUST00000213690 1061 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Hpf1Q8CFE2 Mpzl2-205ENSMUST00000217097 1175 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hpf1Q8CFE2 Abhd14b-210ENSMUST00000217496 631 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hpf1Q8CFE2 Cga-201ENSMUST00000029975 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hpf1Q8CFE2 Ndufaf5-201ENSMUST00000044825 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
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