Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGG7

Ubash3b, Ubiquitin-associated and SH3 domain-containing protein B, mousemouse

Predictions only

Length 638 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubash3bQ8BGG7 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ubash3bQ8BGG7 Nfia-202ENSMUST00000075448 9526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ubash3bQ8BGG7 Nrros-202ENSMUST00000115163 3559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ubash3bQ8BGG7 Pabpc4-203ENSMUST00000106241 3050 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ubash3bQ8BGG7 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Ubash3bQ8BGG7 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ubash3bQ8BGG7 Gm22119-201ENSMUST00000175594 99 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Ubash3bQ8BGG7 Gm2310-201ENSMUST00000179217 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ubash3bQ8BGG7 Olfr1414-202ENSMUST00000189174 1159 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ubash3bQ8BGG7 Gm37489-201ENSMUST00000191883 159 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Ubash3bQ8BGG7 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Ubash3bQ8BGG7 Gm37436-201ENSMUST00000193842 1085 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Ubash3bQ8BGG7 Gm18711-201ENSMUST00000199341 750 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Ubash3bQ8BGG7 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Ubash3bQ8BGG7 4930513D17Rik-203ENSMUST00000202800 1159 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ubash3bQ8BGG7 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ubash3bQ8BGG7 4930447K03Rik-201ENSMUST00000222745 1033 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ubash3bQ8BGG7 Gm5773-201ENSMUST00000090853 1143 ntAPPRIS P1 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ubash3bQ8BGG7 Gusb-201ENSMUST00000026613 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ubash3bQ8BGG7 Zfp941-201ENSMUST00000080651 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ubash3bQ8BGG7 Hnrnpf-201ENSMUST00000035493 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ubash3bQ8BGG7 Tiam1-214ENSMUST00000164263 3569 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ubash3bQ8BGG7 Syt11-203ENSMUST00000107505 5020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ubash3bQ8BGG7 AC122811.1-201ENSMUST00000222257 2921 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Ubash3bQ8BGG7 Gstt2-208ENSMUST00000220440 2254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ubash3bQ8BGG7 Lnx2-201ENSMUST00000016664 4557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ubash3bQ8BGG7 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ubash3bQ8BGG7 Mirg-208ENSMUST00000182499 3187 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ubash3bQ8BGG7 Gpr158-201ENSMUST00000055946 7171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ubash3bQ8BGG7 Inip-201ENSMUST00000095063 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ubash3bQ8BGG7 5930412G12Rik-201ENSMUST00000091324 2403 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ubash3bQ8BGG7 Ndel1-202ENSMUST00000101017 1646 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ubash3bQ8BGG7 Kcnh5-201ENSMUST00000042299 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ubash3bQ8BGG7 Nr1h3-203ENSMUST00000111355 1672 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ubash3bQ8BGG7 Gm10851-201ENSMUST00000192087 1685 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ubash3bQ8BGG7 Gm16083-201ENSMUST00000125681 2547 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ubash3bQ8BGG7 Parp9-203ENSMUST00000114878 3548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ubash3bQ8BGG7 Alg12-201ENSMUST00000043087 1793 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ubash3bQ8BGG7 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ubash3bQ8BGG7 Ncor2-202ENSMUST00000086083 8575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ubash3bQ8BGG7 N4bp2l1-201ENSMUST00000016279 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ubash3bQ8BGG7 Adamts9-201ENSMUST00000113438 8016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ubash3bQ8BGG7 Cdh20-201ENSMUST00000062528 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ubash3bQ8BGG7 AC211878.3-201ENSMUST00000222629 2018 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Ubash3bQ8BGG7 Gm34425-201ENSMUST00000216269 3079 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ubash3bQ8BGG7 Gm14698-201ENSMUST00000096420 4226 ntAPPRIS P1 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ubash3bQ8BGG7 Msantd2-204ENSMUST00000211060 2165 ntTSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ubash3bQ8BGG7 Epha5-205ENSMUST00000113403 4675 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ubash3bQ8BGG7 Trpc7-207ENSMUST00000173817 2406 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ubash3bQ8BGG7 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ubash3bQ8BGG7 Tmsb10-201ENSMUST00000114048 623 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ubash3bQ8BGG7 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Ubash3bQ8BGG7 Gm12036-201ENSMUST00000120008 530 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Ubash3bQ8BGG7 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ubash3bQ8BGG7 Gm14230-202ENSMUST00000137463 874 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ubash3bQ8BGG7 Gm13966-201ENSMUST00000148420 832 ntTSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ubash3bQ8BGG7 6530401F13Rik-201ENSMUST00000166971 1090 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ubash3bQ8BGG7 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ubash3bQ8BGG7 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ubash3bQ8BGG7 Gm16833-202ENSMUST00000189204 672 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ubash3bQ8BGG7 Gm5244-202ENSMUST00000189517 743 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Ubash3bQ8BGG7 Gm38134-201ENSMUST00000191858 1234 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ubash3bQ8BGG7 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Ubash3bQ8BGG7 Gm45022-201ENSMUST00000208332 545 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ubash3bQ8BGG7 Gm7619-201ENSMUST00000210649 1282 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Ubash3bQ8BGG7 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ubash3bQ8BGG7 Colca2-202ENSMUST00000215038 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ubash3bQ8BGG7 AC153929.1-201ENSMUST00000219009 303 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Ubash3bQ8BGG7 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ubash3bQ8BGG7 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ubash3bQ8BGG7 Morn3-201ENSMUST00000031437 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ubash3bQ8BGG7 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ubash3bQ8BGG7 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ubash3bQ8BGG7 Mmel1-204ENSMUST00000105635 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ubash3bQ8BGG7 Gm32036-201ENSMUST00000221484 2638 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ubash3bQ8BGG7 Gm6203-201ENSMUST00000209575 1342 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Ubash3bQ8BGG7 Sugp1-201ENSMUST00000011450 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ubash3bQ8BGG7 Tnip1-201ENSMUST00000018482 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ubash3bQ8BGG7 Smarca2-209ENSMUST00000176030 5862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ubash3bQ8BGG7 Gatsl2-201ENSMUST00000016088 7367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ubash3bQ8BGG7 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Ubash3bQ8BGG7 Ppil2-203ENSMUST00000115721 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ubash3bQ8BGG7 Kalrn-206ENSMUST00000114954 4677 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ubash3bQ8BGG7 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ubash3bQ8BGG7 Tunar-201ENSMUST00000180458 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ubash3bQ8BGG7 Unk-201ENSMUST00000021116 3735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ubash3bQ8BGG7 Kalrn-211ENSMUST00000114966 3857 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ubash3bQ8BGG7 Topors-201ENSMUST00000042575 3856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ubash3bQ8BGG7 Zfp236-202ENSMUST00000182122 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ubash3bQ8BGG7 Ubl5-201ENSMUST00000129414 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ubash3bQ8BGG7 Gtf3c1-204ENSMUST00000205659 6570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ubash3bQ8BGG7 Myzap-201ENSMUST00000093823 2283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ubash3bQ8BGG7 Astl-201ENSMUST00000059839 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ubash3bQ8BGG7 Gm37648-201ENSMUST00000192072 2563 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Ubash3bQ8BGG7 Ttc27-201ENSMUST00000024882 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ubash3bQ8BGG7 5330417C22Rik-202ENSMUST00000106625 5836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ubash3bQ8BGG7 Kifc2-201ENSMUST00000004294 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ubash3bQ8BGG7 Park7-202ENSMUST00000105673 919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ubash3bQ8BGG7 Stx1b-201ENSMUST00000106267 4536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ubash3bQ8BGG7 Eef2k-203ENSMUST00000106488 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 103.3 ms