Protein–RNA interactions for Protein: Q85ZW8

H2-M10.4, Histocompatibility 2, M region locus 10.4, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M10.4Q85ZW8 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
H2-M10.4Q85ZW8 Gm15082-201ENSMUST00000147045 1960 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
H2-M10.4Q85ZW8 Dubr-204ENSMUST00000186944 2052 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.78
H2-M10.4Q85ZW8 Gm19692-201ENSMUST00000203856 2084 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
H2-M10.4Q85ZW8 Bmp3-201ENSMUST00000031278 6548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
H2-M10.4Q85ZW8 Zfp783-204ENSMUST00000130490 4419 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
H2-M10.4Q85ZW8 CT009757.3-201ENSMUST00000223367 2320 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
H2-M10.4Q85ZW8 Slc25a22-203ENSMUST00000106007 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
H2-M10.4Q85ZW8 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
H2-M10.4Q85ZW8 Gm18983-201ENSMUST00000222884 2729 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
H2-M10.4Q85ZW8 Gm44831-201ENSMUST00000208469 2989 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
H2-M10.4Q85ZW8 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
H2-M10.4Q85ZW8 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
H2-M10.4Q85ZW8 Snap29-201ENSMUST00000023449 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
H2-M10.4Q85ZW8 Arl13b-201ENSMUST00000089289 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
H2-M10.4Q85ZW8 Nsun7-204ENSMUST00000202994 3632 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
H2-M10.4Q85ZW8 Abcb9-201ENSMUST00000031354 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
H2-M10.4Q85ZW8 Wdr18-201ENSMUST00000045247 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
H2-M10.4Q85ZW8 Baiap3-202ENSMUST00000182056 4645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
H2-M10.4Q85ZW8 Pappa-201ENSMUST00000084501 11027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
H2-M10.4Q85ZW8 Ccdc163-202ENSMUST00000106462 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
H2-M10.4Q85ZW8 Srsf5-202ENSMUST00000110351 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
H2-M10.4Q85ZW8 Gsto2-202ENSMUST00000120645 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
H2-M10.4Q85ZW8 4930557F10Rik-201ENSMUST00000155432 630 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
H2-M10.4Q85ZW8 Gm17168-201ENSMUST00000169146 345 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
H2-M10.4Q85ZW8 Zic4-204ENSMUST00000172646 2535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
H2-M10.4Q85ZW8 Gm20535-201ENSMUST00000173157 1268 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
H2-M10.4Q85ZW8 Trub2-210ENSMUST00000177467 744 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
H2-M10.4Q85ZW8 1110059E24Rik-208ENSMUST00000179768 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
H2-M10.4Q85ZW8 Gm26838-201ENSMUST00000180485 911 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
H2-M10.4Q85ZW8 Dleu2-205ENSMUST00000182325 463 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
H2-M10.4Q85ZW8 Dleu2-212ENSMUST00000183079 535 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
H2-M10.4Q85ZW8 Kdm4dl-201ENSMUST00000184843 1187 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
H2-M10.4Q85ZW8 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
H2-M10.4Q85ZW8 Gm6108-201ENSMUST00000208365 367 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
H2-M10.4Q85ZW8 Olfr707-202ENSMUST00000208759 1242 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
H2-M10.4Q85ZW8 Gm45428-201ENSMUST00000209619 1789 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
H2-M10.4Q85ZW8 Colca2-202ENSMUST00000215038 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
H2-M10.4Q85ZW8 Slc25a21-205ENSMUST00000217690 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
H2-M10.4Q85ZW8 AC138329.2-201ENSMUST00000225579 1842 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
H2-M10.4Q85ZW8 AC108858.2-201ENSMUST00000228186 1425 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
H2-M10.4Q85ZW8 Bmp2-201ENSMUST00000028836 3555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
H2-M10.4Q85ZW8 Ckmt1-201ENSMUST00000000317 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
H2-M10.4Q85ZW8 Gm6781-201ENSMUST00000038304 1242 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
H2-M10.4Q85ZW8 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
H2-M10.4Q85ZW8 Tbx10-201ENSMUST00000041871 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
H2-M10.4Q85ZW8 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
H2-M10.4Q85ZW8 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
H2-M10.4Q85ZW8 Amtn-201ENSMUST00000073363 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
H2-M10.4Q85ZW8 Hist1h1b-201ENSMUST00000080511 743 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
H2-M10.4Q85ZW8 Fut1-201ENSMUST00000008605 2580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
H2-M10.4Q85ZW8 Col8a1-201ENSMUST00000089332 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
H2-M10.4Q85ZW8 Grm7-202ENSMUST00000172951 4197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
H2-M10.4Q85ZW8 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
H2-M10.4Q85ZW8 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
H2-M10.4Q85ZW8 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
H2-M10.4Q85ZW8 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
H2-M10.4Q85ZW8 Tmppe-201ENSMUST00000111820 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
H2-M10.4Q85ZW8 Aknad1-202ENSMUST00000133931 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
H2-M10.4Q85ZW8 Arid4a-201ENSMUST00000046305 4998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
H2-M10.4Q85ZW8 Ikzf4-203ENSMUST00000221150 2213 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
H2-M10.4Q85ZW8 Wdr92-201ENSMUST00000046955 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
H2-M10.4Q85ZW8 Rgs6-211ENSMUST00000191107 1621 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
H2-M10.4Q85ZW8 Abhd14b-207ENSMUST00000213179 1627 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
H2-M10.4Q85ZW8 Rad9b-201ENSMUST00000049009 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
H2-M10.4Q85ZW8 Sgk1-204ENSMUST00000120509 3096 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
H2-M10.4Q85ZW8 Prpf19-203ENSMUST00000179297 6035 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
H2-M10.4Q85ZW8 Camta2-202ENSMUST00000100933 4383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
H2-M10.4Q85ZW8 Camta2-204ENSMUST00000108545 4377 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
H2-M10.4Q85ZW8 Camta2-206ENSMUST00000120261 4398 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
H2-M10.4Q85ZW8 Pisd-ps2-201ENSMUST00000127960 1424 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
H2-M10.4Q85ZW8 Adamts5-201ENSMUST00000023611 8091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
H2-M10.4Q85ZW8 Pcdh1-202ENSMUST00000159405 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
H2-M10.4Q85ZW8 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
H2-M10.4Q85ZW8 Gm22920-201ENSMUST00000102175 109 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
H2-M10.4Q85ZW8 Ttc4-202ENSMUST00000106772 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
H2-M10.4Q85ZW8 Cdc42se1-204ENSMUST00000107201 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
H2-M10.4Q85ZW8 Gm5150-201ENSMUST00000108347 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
H2-M10.4Q85ZW8 Mkl2-203ENSMUST00000115809 667 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
H2-M10.4Q85ZW8 Gm15573-201ENSMUST00000119487 540 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
H2-M10.4Q85ZW8 Gm11956-201ENSMUST00000119525 512 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
H2-M10.4Q85ZW8 Gm13822-201ENSMUST00000127563 346 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
H2-M10.4Q85ZW8 Gm12395-201ENSMUST00000144765 536 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
H2-M10.4Q85ZW8 Erh-202ENSMUST00000166931 506 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
H2-M10.4Q85ZW8 C730034F03Rik-201ENSMUST00000168646 1280 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
H2-M10.4Q85ZW8 Gm28262-201ENSMUST00000185463 477 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
H2-M10.4Q85ZW8 Gm10550-201ENSMUST00000188846 982 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
H2-M10.4Q85ZW8 Gm38151-201ENSMUST00000195085 289 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
H2-M10.4Q85ZW8 Gm43916-201ENSMUST00000205062 967 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
H2-M10.4Q85ZW8 Gm17831-201ENSMUST00000205579 900 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
H2-M10.4Q85ZW8 Gm45113-201ENSMUST00000207518 165 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
H2-M10.4Q85ZW8 Gm45770-201ENSMUST00000212105 616 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
H2-M10.4Q85ZW8 Timm9-201ENSMUST00000021486 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
H2-M10.4Q85ZW8 4930423D24Rik-202ENSMUST00000219785 554 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
H2-M10.4Q85ZW8 AC154849.4-201ENSMUST00000224868 365 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
H2-M10.4Q85ZW8 Ntan1-201ENSMUST00000023362 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
H2-M10.4Q85ZW8 Ank3-201ENSMUST00000047061 2517 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
H2-M10.4Q85ZW8 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
H2-M10.4Q85ZW8 Ptger4-201ENSMUST00000047379 3264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
H2-M10.4Q85ZW8 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
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