Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSQ1

Clec18a, C-type lectin domain family 18 member A, mousemouse

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Length 534 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clec18aQ7TSQ1 Neat1-202ENSMUST00000174287 3004 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Clec18aQ7TSQ1 Gm26872-201ENSMUST00000180862 2261 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Clec18aQ7TSQ1 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Clec18aQ7TSQ1 Rorc-204ENSMUST00000200009 1543 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Clec18aQ7TSQ1 Pnp2-201ENSMUST00000095925 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Clec18aQ7TSQ1 Tpra1-219ENSMUST00000203345 3359 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Clec18aQ7TSQ1 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Clec18aQ7TSQ1 Nek4-201ENSMUST00000050171 2793 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Clec18aQ7TSQ1 Samd11-201ENSMUST00000179919 2610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Clec18aQ7TSQ1 Plod3-201ENSMUST00000004968 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Clec18aQ7TSQ1 Adgre5-208ENSMUST00000166939 2980 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Clec18aQ7TSQ1 Adgre5-201ENSMUST00000002964 2986 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Clec18aQ7TSQ1 Tmem246-201ENSMUST00000042750 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Clec18aQ7TSQ1 Snap23-201ENSMUST00000028743 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Clec18aQ7TSQ1 Ldb3-203ENSMUST00000022330 1586 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Clec18aQ7TSQ1 Slc2a4-201ENSMUST00000018710 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Clec18aQ7TSQ1 Dbx2-201ENSMUST00000054244 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Clec18aQ7TSQ1 Gfra1-203ENSMUST00000129100 4415 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Clec18aQ7TSQ1 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
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Clec18aQ7TSQ1 Gm12501-201ENSMUST00000119163 529 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Clec18aQ7TSQ1 H2-M6-ps-201ENSMUST00000119193 1034 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Clec18aQ7TSQ1 Uox-202ENSMUST00000121133 768 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Clec18aQ7TSQ1 Mcfd2-205ENSMUST00000145895 751 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Clec18aQ7TSQ1 Gm21976-204ENSMUST00000186911 528 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Clec18aQ7TSQ1 AC122876.1-201ENSMUST00000217619 825 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Clec18aQ7TSQ1 AC158523.3-201ENSMUST00000220664 864 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
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Clec18aQ7TSQ1 Srr-201ENSMUST00000065211 3699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Clec18aQ7TSQ1 Stra6-202ENSMUST00000085677 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Clec18aQ7TSQ1 Cog3-203ENSMUST00000227473 4197 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Clec18aQ7TSQ1 Rapgef3-203ENSMUST00000126854 4005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Clec18aQ7TSQ1 Gm11924-201ENSMUST00000152306 1750 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Clec18aQ7TSQ1 Sgce-209ENSMUST00000133306 1619 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Clec18aQ7TSQ1 Nek5-202ENSMUST00000209656 2253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
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Clec18aQ7TSQ1 Arhgap33-201ENSMUST00000044338 4280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Clec18aQ7TSQ1 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Clec18aQ7TSQ1 Stxbp5l-201ENSMUST00000023526 3344 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Clec18aQ7TSQ1 Wdr4-207ENSMUST00000171171 4153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Clec18aQ7TSQ1 Mrps17-206ENSMUST00000121339 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Clec18aQ7TSQ1 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Clec18aQ7TSQ1 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Clec18aQ7TSQ1 Stxbp6-202ENSMUST00000120531 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Clec18aQ7TSQ1 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Clec18aQ7TSQ1 Dusp6-204ENSMUST00000220291 2359 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Clec18aQ7TSQ1 Klhl6-201ENSMUST00000058839 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Clec18aQ7TSQ1 Jak1-201ENSMUST00000102781 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Clec18aQ7TSQ1 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Clec18aQ7TSQ1 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Clec18aQ7TSQ1 Gm45871-202ENSMUST00000209969 1368 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Clec18aQ7TSQ1 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Clec18aQ7TSQ1 Nrg1-202ENSMUST00000207417 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Clec18aQ7TSQ1 Ahi1-201ENSMUST00000105525 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Clec18aQ7TSQ1 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Clec18aQ7TSQ1 Ttc25-201ENSMUST00000006976 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Clec18aQ7TSQ1 Tirap-203ENSMUST00000176531 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Clec18aQ7TSQ1 Plrg1-202ENSMUST00000122128 1608 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Clec18aQ7TSQ1 Ighv8-9-201ENSMUST00000103533 301 ntAPPRIS P1 BASIC11.8□□□□□ -0.52
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Clec18aQ7TSQ1 Cd7-201ENSMUST00000026159 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
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Clec18aQ7TSQ1 Inca1-201ENSMUST00000073625 1218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Clec18aQ7TSQ1 Pitpnm3-201ENSMUST00000075258 6555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Clec18aQ7TSQ1 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Clec18aQ7TSQ1 Gm20687-203ENSMUST00000185121 4242 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Clec18aQ7TSQ1 Gnb1l-202ENSMUST00000090086 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Clec18aQ7TSQ1 Gm43321-201ENSMUST00000198897 2409 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Clec18aQ7TSQ1 Sstr3-201ENSMUST00000053239 3928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Clec18aQ7TSQ1 Dph6-201ENSMUST00000028640 2632 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Clec18aQ7TSQ1 Rad23a-201ENSMUST00000003911 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Clec18aQ7TSQ1 Etv3-205ENSMUST00000170036 5127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Clec18aQ7TSQ1 Epb42-201ENSMUST00000023987 2695 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Clec18aQ7TSQ1 Tsga10-202ENSMUST00000088072 3837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Clec18aQ7TSQ1 Gm15587-201ENSMUST00000146326 3493 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Clec18aQ7TSQ1 4931428F04Rik-201ENSMUST00000014981 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Clec18aQ7TSQ1 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Clec18aQ7TSQ1 Coa5-201ENSMUST00000027286 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Clec18aQ7TSQ1 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Clec18aQ7TSQ1 Got1l1-201ENSMUST00000038174 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Clec18aQ7TSQ1 Bpi-202ENSMUST00000109499 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Clec18aQ7TSQ1 Cldn18-202ENSMUST00000112882 1750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Clec18aQ7TSQ1 Gm45897-201ENSMUST00000212679 1998 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Clec18aQ7TSQ1 Cdh18-204ENSMUST00000165614 2162 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Clec18aQ7TSQ1 Anxa11-201ENSMUST00000022416 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Clec18aQ7TSQ1 Ffar1-201ENSMUST00000052700 4175 ntAPPRIS P1 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Clec18aQ7TSQ1 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Clec18aQ7TSQ1 Mcfd2-204ENSMUST00000144236 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
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Clec18aQ7TSQ1 Egfem1-202ENSMUST00000119598 2687 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
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