Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF1

Dsg1b, Desmoglein-1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,060 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1bQ7TSF1 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Dsg1bQ7TSF1 Apbb2-215ENSMUST00000162349 3362 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Dsg1bQ7TSF1 Apbb2-201ENSMUST00000087256 3362 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Dsg1bQ7TSF1 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Dsg1bQ7TSF1 Grhl2-201ENSMUST00000022895 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Dsg1bQ7TSF1 Gm16364-201ENSMUST00000153722 1313 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Dsg1bQ7TSF1 Ewsr1-201ENSMUST00000063232 1320 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Dsg1bQ7TSF1 Acnat2-201ENSMUST00000081541 1664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Dsg1bQ7TSF1 D130043K22Rik-201ENSMUST00000006893 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Dsg1bQ7TSF1 Tmem269-201ENSMUST00000030394 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Dsg1bQ7TSF1 Cdh22-201ENSMUST00000065438 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Dsg1bQ7TSF1 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Dsg1bQ7TSF1 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Dsg1bQ7TSF1 Gjd4-201ENSMUST00000041007 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Dsg1bQ7TSF1 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Dsg1bQ7TSF1 Slc19a1-209ENSMUST00000144234 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Dsg1bQ7TSF1 Stat5b-202ENSMUST00000107358 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Dsg1bQ7TSF1 St6galnac4-204ENSMUST00000179989 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Dsg1bQ7TSF1 Trav13d-4-201ENSMUST00000103607 264 ntAPPRIS P1 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Dsg1bQ7TSF1 Gm24891-201ENSMUST00000104391 136 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Dsg1bQ7TSF1 Gm8566-201ENSMUST00000120174 465 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Dsg1bQ7TSF1 Pcbd2-202ENSMUST00000124968 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Dsg1bQ7TSF1 Mcfd2-205ENSMUST00000145895 751 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Dsg1bQ7TSF1 D630008O14Rik-202ENSMUST00000149909 1043 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Dsg1bQ7TSF1 Gm23085-201ENSMUST00000157849 293 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Dsg1bQ7TSF1 Pid1-205ENSMUST00000176720 450 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Dsg1bQ7TSF1 Trav13-4-dv7-202ENSMUST00000184905 264 ntAPPRIS P1 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Dsg1bQ7TSF1 Gm18827-201ENSMUST00000188341 790 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Dsg1bQ7TSF1 Gm4482-201ENSMUST00000200876 742 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Dsg1bQ7TSF1 Gm43050-202ENSMUST00000201152 651 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Dsg1bQ7TSF1 Gm10069-203ENSMUST00000204081 907 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Dsg1bQ7TSF1 Gm44044-201ENSMUST00000205178 1089 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Dsg1bQ7TSF1 Gm44968-201ENSMUST00000207652 1171 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Dsg1bQ7TSF1 Gm45428-201ENSMUST00000209619 1789 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Dsg1bQ7TSF1 Gm45743-201ENSMUST00000212701 2795 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Dsg1bQ7TSF1 Zbtb45-205ENSMUST00000210282 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Dsg1bQ7TSF1 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Dsg1bQ7TSF1 Il22ra1-201ENSMUST00000102546 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Dsg1bQ7TSF1 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Dsg1bQ7TSF1 Oxsm-202ENSMUST00000112624 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Dsg1bQ7TSF1 Arhgap1-202ENSMUST00000111329 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Dsg1bQ7TSF1 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Dsg1bQ7TSF1 Riox2-206ENSMUST00000160571 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Dsg1bQ7TSF1 Kifap3-202ENSMUST00000077642 4012 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Dsg1bQ7TSF1 Rab3c-202ENSMUST00000223922 2398 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Dsg1bQ7TSF1 Cnot7-211ENSMUST00000149992 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Dsg1bQ7TSF1 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Dsg1bQ7TSF1 Cc2d1a-202ENSMUST00000117424 3262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Dsg1bQ7TSF1 Patl1-201ENSMUST00000061618 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Dsg1bQ7TSF1 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Dsg1bQ7TSF1 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Dsg1bQ7TSF1 Wwtr1-201ENSMUST00000029380 4697 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Dsg1bQ7TSF1 Orc5-201ENSMUST00000030872 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Dsg1bQ7TSF1 Pcnt-202ENSMUST00000217838 9341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Dsg1bQ7TSF1 P2rx7-203ENSMUST00000100737 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Dsg1bQ7TSF1 Abhd14b-207ENSMUST00000213179 1627 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Dsg1bQ7TSF1 Bpi-202ENSMUST00000109499 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Dsg1bQ7TSF1 Wdr20rt-201ENSMUST00000046331 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Dsg1bQ7TSF1 Dis3l-208ENSMUST00000168844 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Dsg1bQ7TSF1 Mog-201ENSMUST00000102665 1704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Dsg1bQ7TSF1 Timm10b-204ENSMUST00000106784 494 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Dsg1bQ7TSF1 Gm12566-201ENSMUST00000121479 359 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Dsg1bQ7TSF1 Gm13376-201ENSMUST00000128743 448 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Dsg1bQ7TSF1 4933405E24Rik-201ENSMUST00000131019 1078 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Dsg1bQ7TSF1 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
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Dsg1bQ7TSF1 1700125G22Rik-201ENSMUST00000181124 861 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
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Dsg1bQ7TSF1 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Dsg1bQ7TSF1 Tmem210-201ENSMUST00000028340 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Dsg1bQ7TSF1 Lcn8-201ENSMUST00000038482 651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Dsg1bQ7TSF1 Cib2-201ENSMUST00000041901 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Dsg1bQ7TSF1 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Dsg1bQ7TSF1 Lyz1-201ENSMUST00000092162 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Dsg1bQ7TSF1 Rspo3-201ENSMUST00000092623 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Dsg1bQ7TSF1 Tnni3-201ENSMUST00000098859 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Dsg1bQ7TSF1 Bahcc1-202ENSMUST00000118987 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Dsg1bQ7TSF1 AI314180-202ENSMUST00000102889 7045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Dsg1bQ7TSF1 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Dsg1bQ7TSF1 Vwa7-201ENSMUST00000007245 4313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Dsg1bQ7TSF1 Jak3-201ENSMUST00000051995 4019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Dsg1bQ7TSF1 Plxna4os1-201ENSMUST00000150314 1977 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Dsg1bQ7TSF1 Als2cl-206ENSMUST00000155014 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Dsg1bQ7TSF1 Chil1-201ENSMUST00000082060 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Dsg1bQ7TSF1 Metap2-201ENSMUST00000047910 4424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Dsg1bQ7TSF1 Lrp12-201ENSMUST00000022916 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Dsg1bQ7TSF1 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Dsg1bQ7TSF1 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Dsg1bQ7TSF1 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Dsg1bQ7TSF1 Tenm3-201ENSMUST00000033965 8961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Dsg1bQ7TSF1 Ikzf4-203ENSMUST00000221150 2213 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Dsg1bQ7TSF1 Tubb4a-201ENSMUST00000071135 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Dsg1bQ7TSF1 Sin3a-206ENSMUST00000168177 5086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Dsg1bQ7TSF1 Gm42706-201ENSMUST00000199733 1910 ntBASIC11.9□□□□□ -0.51
Dsg1bQ7TSF1 4931406C07Rik-203ENSMUST00000180339 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Dsg1bQ7TSF1 Iqcc-201ENSMUST00000046675 2639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.51
Dsg1bQ7TSF1 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Dsg1bQ7TSF1 Rnf144a-202ENSMUST00000062149 4812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
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