Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF0

Dsg1c, Desmoglein-1-gamma, mousemouse

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1cQ7TSF0 Rprl1-202ENSMUST00000198476 238 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Dsg1cQ7TSF0 Gm30459-201ENSMUST00000206203 1193 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Dsg1cQ7TSF0 Gm31224-201ENSMUST00000212682 513 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Dsg1cQ7TSF0 Cga-201ENSMUST00000029975 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Dsg1cQ7TSF0 Cdk19os-201ENSMUST00000044774 534 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Dsg1cQ7TSF0 Cox5a-201ENSMUST00000000090 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Dsg1cQ7TSF0 Fgd5-202ENSMUST00000113466 5621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Dsg1cQ7TSF0 Trpc7-207ENSMUST00000173817 2406 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Dsg1cQ7TSF0 Cacna1c-212ENSMUST00000187940 7507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Dsg1cQ7TSF0 Hmgcs2-202ENSMUST00000120541 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Dsg1cQ7TSF0 Rassf4-201ENSMUST00000035842 6460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Dsg1cQ7TSF0 Reps1-201ENSMUST00000126390 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Dsg1cQ7TSF0 Fam149a-201ENSMUST00000093526 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Dsg1cQ7TSF0 Lsg1-201ENSMUST00000117363 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Dsg1cQ7TSF0 1700025G04Rik-201ENSMUST00000044581 9559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Dsg1cQ7TSF0 Txndc5-204ENSMUST00000162075 2619 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Dsg1cQ7TSF0 Gm10782-202ENSMUST00000223775 1480 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Dsg1cQ7TSF0 Cdc14a-201ENSMUST00000090464 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Dsg1cQ7TSF0 AC164441.2-201ENSMUST00000220818 2746 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Dsg1cQ7TSF0 Arfgap1-201ENSMUST00000029092 2714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Dsg1cQ7TSF0 Enah-201ENSMUST00000078719 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Dsg1cQ7TSF0 Pigo-201ENSMUST00000067481 3525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Dsg1cQ7TSF0 Cpsf7-201ENSMUST00000038379 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Dsg1cQ7TSF0 Sparc-201ENSMUST00000018737 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Dsg1cQ7TSF0 Pitpnc1-202ENSMUST00000103064 6329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Dsg1cQ7TSF0 1700110I01Rik-201ENSMUST00000112775 1671 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Dsg1cQ7TSF0 Als2cl-203ENSMUST00000130386 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Dsg1cQ7TSF0 Gm9008-201ENSMUST00000097218 2353 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Dsg1cQ7TSF0 Zfand2a-202ENSMUST00000110851 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Dsg1cQ7TSF0 Arvcf-202ENSMUST00000115610 3829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Dsg1cQ7TSF0 AC138329.2-201ENSMUST00000225579 1842 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Dsg1cQ7TSF0 Arvcf-204ENSMUST00000115613 4800 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Dsg1cQ7TSF0 Fbxo40-201ENSMUST00000075869 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Dsg1cQ7TSF0 Prps1-201ENSMUST00000033809 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Dsg1cQ7TSF0 Sdr9c7-201ENSMUST00000047134 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Dsg1cQ7TSF0 Tmod4-202ENSMUST00000107227 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Dsg1cQ7TSF0 Hsd17b10-202ENSMUST00000112617 992 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Dsg1cQ7TSF0 C330007P06Rik-203ENSMUST00000115249 1145 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Dsg1cQ7TSF0 Rap1a-ps2-201ENSMUST00000118467 559 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Dsg1cQ7TSF0 Spata3-210ENSMUST00000153247 884 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Dsg1cQ7TSF0 2310057J18Rik-201ENSMUST00000015663 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Dsg1cQ7TSF0 Gm17105-201ENSMUST00000163715 652 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Dsg1cQ7TSF0 Rps13-201ENSMUST00000170953 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Dsg1cQ7TSF0 A430027H14Rik-202ENSMUST00000192797 618 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Dsg1cQ7TSF0 Nanos3-202ENSMUST00000210202 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Dsg1cQ7TSF0 Gm33104-201ENSMUST00000214178 1010 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Dsg1cQ7TSF0 CT571245.2-201ENSMUST00000218421 305 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Dsg1cQ7TSF0 Hsd17b10-201ENSMUST00000026289 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Dsg1cQ7TSF0 Tectb-202ENSMUST00000120936 1349 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Dsg1cQ7TSF0 Taf1b-201ENSMUST00000075954 2209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Dsg1cQ7TSF0 Col6a6-202ENSMUST00000098441 8781 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Dsg1cQ7TSF0 Prkag3-201ENSMUST00000081636 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Dsg1cQ7TSF0 Dusp6-204ENSMUST00000220291 2359 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Dsg1cQ7TSF0 Mtm1-203ENSMUST00000061970 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Dsg1cQ7TSF0 Gm43908-201ENSMUST00000205074 1472 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Dsg1cQ7TSF0 Phldb2-201ENSMUST00000036355 5483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Dsg1cQ7TSF0 Trim55-201ENSMUST00000029139 2595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Dsg1cQ7TSF0 H2-M2-201ENSMUST00000016427 1550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Dsg1cQ7TSF0 AC123619.2-202ENSMUST00000225097 1568 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Dsg1cQ7TSF0 AC123857.2-201ENSMUST00000225756 1582 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Dsg1cQ7TSF0 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Dsg1cQ7TSF0 Abcc10-204ENSMUST00000167360 4866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Dsg1cQ7TSF0 Tex9-209ENSMUST00000184125 2794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Dsg1cQ7TSF0 Nek4-201ENSMUST00000050171 2793 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Dsg1cQ7TSF0 Zfp512-208ENSMUST00000202244 3045 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Dsg1cQ7TSF0 Arhgef2-206ENSMUST00000175779 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Dsg1cQ7TSF0 Rad51ap1-202ENSMUST00000112221 1871 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Dsg1cQ7TSF0 Ccdc32-201ENSMUST00000036470 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Dsg1cQ7TSF0 Nuak2-202ENSMUST00000082125 3107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Dsg1cQ7TSF0 Bpi-201ENSMUST00000065039 1926 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Dsg1cQ7TSF0 Cyp8b1-201ENSMUST00000062474 1950 ntAPPRIS P1 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Dsg1cQ7TSF0 Aars2-201ENSMUST00000024733 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Dsg1cQ7TSF0 Ehbp1l1-202ENSMUST00000075606 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Dsg1cQ7TSF0 Eif5a2-201ENSMUST00000060500 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Dsg1cQ7TSF0 Med12l-201ENSMUST00000029393 2295 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Dsg1cQ7TSF0 Slc19a1-209ENSMUST00000144234 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Dsg1cQ7TSF0 Slc35a4-202ENSMUST00000050476 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Dsg1cQ7TSF0 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Dsg1cQ7TSF0 Galnt11-202ENSMUST00000114950 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Dsg1cQ7TSF0 6430571L13Rik-201ENSMUST00000042581 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Dsg1cQ7TSF0 Traf3ip2-201ENSMUST00000019987 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Dsg1cQ7TSF0 Ehbp1-202ENSMUST00000109563 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Dsg1cQ7TSF0 Frmpd2-203ENSMUST00000208577 5192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Dsg1cQ7TSF0 Nol3-201ENSMUST00000014920 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Dsg1cQ7TSF0 Ikbip-201ENSMUST00000020149 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Dsg1cQ7TSF0 Aplp2-209ENSMUST00000217641 3462 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Dsg1cQ7TSF0 Drd1-202ENSMUST00000221470 3576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Dsg1cQ7TSF0 Bicra-204ENSMUST00000210781 5975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Dsg1cQ7TSF0 Gm4760-201ENSMUST00000119663 1030 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Dsg1cQ7TSF0 Hnf4aos-203ENSMUST00000141329 839 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Dsg1cQ7TSF0 Tmbim6-206ENSMUST00000161250 1148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Dsg1cQ7TSF0 Ino80dos-202ENSMUST00000186436 652 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Dsg1cQ7TSF0 Gm32999-201ENSMUST00000192693 562 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Dsg1cQ7TSF0 Gm18893-201ENSMUST00000198416 943 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Dsg1cQ7TSF0 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Dsg1cQ7TSF0 Gm40437-201ENSMUST00000222338 767 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Dsg1cQ7TSF0 AC123665.1-201ENSMUST00000228204 438 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Dsg1cQ7TSF0 Armc5-201ENSMUST00000044660 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Dsg1cQ7TSF0 Snf8-201ENSMUST00000006217 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Dsg1cQ7TSF0 Crry-ps-201ENSMUST00000079090 1309 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms