Protein–RNA interactions for Protein: Q7TMI3

Uhrf2, E3 ubiquitin-protein ligase UHRF2, mousemouse

Predictions only

Length 803 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uhrf2Q7TMI3 Gm28192-201ENSMUST00000189381 778 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Uhrf2Q7TMI3 Gm37489-201ENSMUST00000191883 159 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Uhrf2Q7TMI3 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Uhrf2Q7TMI3 Gm21769-201ENSMUST00000211922 111 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Uhrf2Q7TMI3 4930447K03Rik-201ENSMUST00000222745 1033 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Uhrf2Q7TMI3 AC113031.8-201ENSMUST00000227856 631 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Uhrf2Q7TMI3 Tm2d3-201ENSMUST00000032726 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Uhrf2Q7TMI3 1700028J19Rik-201ENSMUST00000037220 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Uhrf2Q7TMI3 Syngr4-201ENSMUST00000039049 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Uhrf2Q7TMI3 Jmjd4-202ENSMUST00000108777 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Uhrf2Q7TMI3 Slc25a45-206ENSMUST00000155697 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Uhrf2Q7TMI3 Acsl6-202ENSMUST00000064690 1988 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Uhrf2Q7TMI3 Grpel1-201ENSMUST00000031099 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Uhrf2Q7TMI3 Gm16083-201ENSMUST00000125681 2547 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Uhrf2Q7TMI3 Lama4-201ENSMUST00000019992 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Uhrf2Q7TMI3 Nr1h3-203ENSMUST00000111355 1672 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Uhrf2Q7TMI3 Gm43447-201ENSMUST00000198471 1535 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Uhrf2Q7TMI3 D030068K23Rik-201ENSMUST00000180382 2617 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Uhrf2Q7TMI3 C2-201ENSMUST00000025230 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Uhrf2Q7TMI3 Tgm2-201ENSMUST00000103122 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Uhrf2Q7TMI3 9330182L06Rik-204ENSMUST00000134991 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Uhrf2Q7TMI3 Gm26516-201ENSMUST00000180943 1397 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Uhrf2Q7TMI3 Ddx11-205ENSMUST00000224497 4141 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Uhrf2Q7TMI3 Gm45428-201ENSMUST00000209619 1789 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Uhrf2Q7TMI3 Pigc-201ENSMUST00000028021 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Uhrf2Q7TMI3 Spata18-203ENSMUST00000113548 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Uhrf2Q7TMI3 Zfp68-203ENSMUST00000110905 4749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Uhrf2Q7TMI3 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Uhrf2Q7TMI3 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Uhrf2Q7TMI3 Leprot-201ENSMUST00000030254 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Uhrf2Q7TMI3 Nf1-202ENSMUST00000108251 9217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Uhrf2Q7TMI3 Mbtps2-203ENSMUST00000112522 3891 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Uhrf2Q7TMI3 Mbtps2-208ENSMUST00000179062 3890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Uhrf2Q7TMI3 P2ry1-201ENSMUST00000029331 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Uhrf2Q7TMI3 Sp2-202ENSMUST00000107623 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Uhrf2Q7TMI3 Xrra1-202ENSMUST00000207855 1334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Uhrf2Q7TMI3 Tunar-201ENSMUST00000180458 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Uhrf2Q7TMI3 Kifc2-201ENSMUST00000004294 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Uhrf2Q7TMI3 Arfgap1-201ENSMUST00000029092 2714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Uhrf2Q7TMI3 Slc29a1-213ENSMUST00000167692 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Uhrf2Q7TMI3 5330417C22Rik-202ENSMUST00000106625 5836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Uhrf2Q7TMI3 Poc1a-201ENSMUST00000072206 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Uhrf2Q7TMI3 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Uhrf2Q7TMI3 Gnas-203ENSMUST00000087876 3719 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Uhrf2Q7TMI3 Ctsd-201ENSMUST00000066401 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Uhrf2Q7TMI3 Gm12036-201ENSMUST00000120008 530 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Uhrf2Q7TMI3 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Uhrf2Q7TMI3 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Uhrf2Q7TMI3 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Uhrf2Q7TMI3 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Uhrf2Q7TMI3 Gm13832-202ENSMUST00000151159 370 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Uhrf2Q7TMI3 Gm7008-202ENSMUST00000170019 402 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Uhrf2Q7TMI3 Gm17227-202ENSMUST00000170286 1016 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Uhrf2Q7TMI3 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Uhrf2Q7TMI3 Gm2310-201ENSMUST00000179217 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Uhrf2Q7TMI3 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Uhrf2Q7TMI3 Gm28638-201ENSMUST00000188152 288 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Uhrf2Q7TMI3 Gm28172-201ENSMUST00000189880 506 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Uhrf2Q7TMI3 Gm44172-201ENSMUST00000203903 1235 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Uhrf2Q7TMI3 Gm18935-201ENSMUST00000212692 664 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Uhrf2Q7TMI3 Tpd52l1-205ENSMUST00000215515 857 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Uhrf2Q7TMI3 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Uhrf2Q7TMI3 1700011B04Rik-203ENSMUST00000220654 1033 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Uhrf2Q7TMI3 Gm33115-201ENSMUST00000220913 743 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Uhrf2Q7TMI3 1700011B04Rik-209ENSMUST00000221760 779 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Uhrf2Q7TMI3 AC163667.3-201ENSMUST00000225774 222 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Uhrf2Q7TMI3 Dhrs4-202ENSMUST00000226168 828 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Uhrf2Q7TMI3 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Uhrf2Q7TMI3 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Uhrf2Q7TMI3 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Uhrf2Q7TMI3 Tef-202ENSMUST00000109553 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Uhrf2Q7TMI3 Fam227a-204ENSMUST00000187519 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Uhrf2Q7TMI3 Abca2-201ENSMUST00000102919 8033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Uhrf2Q7TMI3 Gm5580-201ENSMUST00000122096 1362 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Uhrf2Q7TMI3 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Uhrf2Q7TMI3 1700003D09Rik-201ENSMUST00000141929 1389 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Uhrf2Q7TMI3 G630016G05Rik-202ENSMUST00000156095 3398 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Uhrf2Q7TMI3 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Uhrf2Q7TMI3 Cep250-204ENSMUST00000109619 7977 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Uhrf2Q7TMI3 Cep250-201ENSMUST00000039994 7979 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Uhrf2Q7TMI3 Pknox1-206ENSMUST00000176701 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Uhrf2Q7TMI3 Tpra1-218ENSMUST00000203185 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Uhrf2Q7TMI3 Gpr179-201ENSMUST00000093942 9219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Uhrf2Q7TMI3 Gpc5-203ENSMUST00000176912 2837 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Uhrf2Q7TMI3 Ppnr-201ENSMUST00000190974 3525 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Uhrf2Q7TMI3 Herc4-201ENSMUST00000020258 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Uhrf2Q7TMI3 Fn3krp-201ENSMUST00000038096 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Uhrf2Q7TMI3 Nek5-202ENSMUST00000209656 2253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Uhrf2Q7TMI3 Natd1-201ENSMUST00000019075 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Uhrf2Q7TMI3 Myocd-203ENSMUST00000108695 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Uhrf2Q7TMI3 Csf1r-202ENSMUST00000115268 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Uhrf2Q7TMI3 Col20a1-201ENSMUST00000108856 4489 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Uhrf2Q7TMI3 Mob4-205ENSMUST00000162364 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Uhrf2Q7TMI3 Camkv-204ENSMUST00000194206 2827 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Uhrf2Q7TMI3 Ccdc32-201ENSMUST00000036470 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Uhrf2Q7TMI3 F11-201ENSMUST00000034064 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Uhrf2Q7TMI3 Rnf20-210ENSMUST00000167496 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Uhrf2Q7TMI3 Il2rb-201ENSMUST00000089398 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Uhrf2Q7TMI3 Gm43102-201ENSMUST00000201004 2324 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Uhrf2Q7TMI3 Mbnl2-208ENSMUST00000227594 2334 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms