Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRT3

Parpbp, PCNA-interacting partner, mousemouse

Predictions only

Length 573 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ParpbpQ6IRT3 Lnx2-201ENSMUST00000016664 4557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
ParpbpQ6IRT3 Hdc-201ENSMUST00000028838 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
ParpbpQ6IRT3 Pcdhga4-201ENSMUST00000194418 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
ParpbpQ6IRT3 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
ParpbpQ6IRT3 Qrich1-201ENSMUST00000006851 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
ParpbpQ6IRT3 Gm44806-201ENSMUST00000205574 2303 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
ParpbpQ6IRT3 Chl1-204ENSMUST00000203912 4628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
ParpbpQ6IRT3 Lig1-201ENSMUST00000098814 3091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
ParpbpQ6IRT3 Patl1-201ENSMUST00000061618 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
ParpbpQ6IRT3 Gm14698-201ENSMUST00000096420 4226 ntAPPRIS P1 BASIC11.15□□□□□ -0.62
ParpbpQ6IRT3 Gm42943-201ENSMUST00000199676 3242 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
ParpbpQ6IRT3 Pla2g6-206ENSMUST00000173163 3018 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
ParpbpQ6IRT3 Nfatc4-202ENSMUST00000172271 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
ParpbpQ6IRT3 Gm6189-201ENSMUST00000164487 2082 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
ParpbpQ6IRT3 Rbm8a-206ENSMUST00000200647 2620 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
ParpbpQ6IRT3 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
ParpbpQ6IRT3 Gm44831-201ENSMUST00000208469 2989 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
ParpbpQ6IRT3 Cacna1s-204ENSMUST00000160641 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
ParpbpQ6IRT3 Ntpcr-202ENSMUST00000065135 1497 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
ParpbpQ6IRT3 BC048403-201ENSMUST00000065600 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
ParpbpQ6IRT3 Hsd17b10-202ENSMUST00000112617 992 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
ParpbpQ6IRT3 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
ParpbpQ6IRT3 Gm13665-201ENSMUST00000120830 528 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
ParpbpQ6IRT3 Has2os-201ENSMUST00000125401 485 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
ParpbpQ6IRT3 E130006D01Rik-203ENSMUST00000137398 906 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
ParpbpQ6IRT3 Gm4819-201ENSMUST00000182170 1009 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
ParpbpQ6IRT3 Bloc1s2-ps-201ENSMUST00000183232 432 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
ParpbpQ6IRT3 Ino80dos-202ENSMUST00000186436 652 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
ParpbpQ6IRT3 Ccl4-201ENSMUST00000019074 660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
ParpbpQ6IRT3 Hax1-205ENSMUST00000197767 1092 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
ParpbpQ6IRT3 Gm36503-201ENSMUST00000204284 875 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
ParpbpQ6IRT3 Gm44262-201ENSMUST00000204969 372 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
ParpbpQ6IRT3 Gm45799-208ENSMUST00000211054 490 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
ParpbpQ6IRT3 4930578I06Rik-201ENSMUST00000022532 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
ParpbpQ6IRT3 Treml1-205ENSMUST00000225849 974 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
ParpbpQ6IRT3 Hsd17b10-201ENSMUST00000026289 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
ParpbpQ6IRT3 Txn2-201ENSMUST00000005487 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
ParpbpQ6IRT3 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
ParpbpQ6IRT3 Mirt1-202ENSMUST00000180667 1633 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
ParpbpQ6IRT3 Gpld1-201ENSMUST00000021773 5224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
ParpbpQ6IRT3 Clec10a-209ENSMUST00000178945 2332 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
ParpbpQ6IRT3 Uprt-201ENSMUST00000087867 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
ParpbpQ6IRT3 Satb1-208ENSMUST00000144331 6243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
ParpbpQ6IRT3 Parp14-201ENSMUST00000042665 7417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
ParpbpQ6IRT3 Kcnh6-202ENSMUST00000106903 2816 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
ParpbpQ6IRT3 Akap12-201ENSMUST00000045730 6195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
ParpbpQ6IRT3 Abcc10-202ENSMUST00000095261 5266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
ParpbpQ6IRT3 Gm26857-201ENSMUST00000181580 3347 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
ParpbpQ6IRT3 Srrt-212ENSMUST00000199243 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
ParpbpQ6IRT3 Prss42-201ENSMUST00000035715 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
ParpbpQ6IRT3 Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
ParpbpQ6IRT3 Fam210b-201ENSMUST00000028995 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
ParpbpQ6IRT3 Gm11494-201ENSMUST00000142279 1738 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
ParpbpQ6IRT3 Rpap1-202ENSMUST00000099529 4813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
ParpbpQ6IRT3 Mmel1-207ENSMUST00000163732 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
ParpbpQ6IRT3 Pnp2-201ENSMUST00000095925 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
ParpbpQ6IRT3 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
ParpbpQ6IRT3 Mecom-202ENSMUST00000108270 5692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
ParpbpQ6IRT3 Pros1-201ENSMUST00000023629 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
ParpbpQ6IRT3 Prkag3-206ENSMUST00000188073 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
ParpbpQ6IRT3 Gm17767-201ENSMUST00000189410 1470 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
ParpbpQ6IRT3 Ift22-205ENSMUST00000200157 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
ParpbpQ6IRT3 Tfdp2-205ENSMUST00000179416 2408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
ParpbpQ6IRT3 Setx-201ENSMUST00000061578 10970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
ParpbpQ6IRT3 Bmp1-201ENSMUST00000022693 3684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
ParpbpQ6IRT3 Gm26703-201ENSMUST00000181370 2864 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
ParpbpQ6IRT3 Limd2-203ENSMUST00000106875 936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
ParpbpQ6IRT3 Rap1a-ps2-201ENSMUST00000118467 559 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
ParpbpQ6IRT3 Gm13388-201ENSMUST00000126659 425 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
ParpbpQ6IRT3 Gm26361-201ENSMUST00000158868 186 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
ParpbpQ6IRT3 Atp10d-206ENSMUST00000169617 761 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
ParpbpQ6IRT3 Grp-203ENSMUST00000173985 952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
ParpbpQ6IRT3 Calca-204ENSMUST00000205714 416 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
ParpbpQ6IRT3 Gm17931-201ENSMUST00000208132 634 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
ParpbpQ6IRT3 AC153954.1-201ENSMUST00000216959 255 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
ParpbpQ6IRT3 CT571245.2-201ENSMUST00000218421 305 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
ParpbpQ6IRT3 AC025913.2-202ENSMUST00000219248 605 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
ParpbpQ6IRT3 Gm9176-201ENSMUST00000219955 1120 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
ParpbpQ6IRT3 Defb22-201ENSMUST00000028966 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
ParpbpQ6IRT3 Rassf8-202ENSMUST00000058538 1131 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
ParpbpQ6IRT3 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
ParpbpQ6IRT3 Irak2-201ENSMUST00000059286 3196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
ParpbpQ6IRT3 Cd72-204ENSMUST00000107925 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
ParpbpQ6IRT3 Rftn1-202ENSMUST00000113195 2385 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
ParpbpQ6IRT3 Sel1l-210ENSMUST00000178462 6150 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
ParpbpQ6IRT3 Tgfb2-206ENSMUST00000195201 3485 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
ParpbpQ6IRT3 4833422C13Rik-202ENSMUST00000160385 2828 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
ParpbpQ6IRT3 Mog-201ENSMUST00000102665 1704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
ParpbpQ6IRT3 Ccdc183-201ENSMUST00000028309 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
ParpbpQ6IRT3 Serpinf2-202ENSMUST00000108437 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
ParpbpQ6IRT3 Gm43102-201ENSMUST00000201004 2324 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
ParpbpQ6IRT3 Ctsc-201ENSMUST00000032779 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
ParpbpQ6IRT3 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
ParpbpQ6IRT3 Prc1-206ENSMUST00000173824 2912 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
ParpbpQ6IRT3 Specc1-212ENSMUST00000202178 2932 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
ParpbpQ6IRT3 Igfbp4-201ENSMUST00000017637 3831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
ParpbpQ6IRT3 Gm43720-201ENSMUST00000159067 6411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
ParpbpQ6IRT3 Tomt-202ENSMUST00000106970 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
ParpbpQ6IRT3 Rragd-202ENSMUST00000084747 4295 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
ParpbpQ6IRT3 Abo-202ENSMUST00000114045 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.8 ms