Protein–RNA interactions for Protein: Q6DFW4

Nop58, Nucleolar protein 58, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 536 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nop58Q6DFW4 Ip6k2-201ENSMUST00000085018 1846 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nop58Q6DFW4 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nop58Q6DFW4 Gm11700-201ENSMUST00000119409 403 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Nop58Q6DFW4 Gm13944-201ENSMUST00000126572 721 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nop58Q6DFW4 Gm12348-201ENSMUST00000138915 313 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nop58Q6DFW4 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nop58Q6DFW4 1700018A23Rik-201ENSMUST00000201350 398 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nop58Q6DFW4 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nop58Q6DFW4 Gm807-202ENSMUST00000224929 408 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Nop58Q6DFW4 Cish-204ENSMUST00000168260 2742 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nop58Q6DFW4 Tex10-206ENSMUST00000164866 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nop58Q6DFW4 Herc3-201ENSMUST00000031823 3596 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nop58Q6DFW4 Ifi47-202ENSMUST00000109202 1773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nop58Q6DFW4 Igsf3-202ENSMUST00000195164 3876 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nop58Q6DFW4 Rims3-202ENSMUST00000106283 6437 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nop58Q6DFW4 Gm38115-201ENSMUST00000194317 2413 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nop58Q6DFW4 Lingo1-201ENSMUST00000053568 3295 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nop58Q6DFW4 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nop58Q6DFW4 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nop58Q6DFW4 Gm5740-201ENSMUST00000211003 1857 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Nop58Q6DFW4 Samhd1-203ENSMUST00000109549 3245 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nop58Q6DFW4 Slc17a5-201ENSMUST00000052441 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nop58Q6DFW4 Mest-210ENSMUST00000157040 2383 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nop58Q6DFW4 Ets2-201ENSMUST00000023612 3890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nop58Q6DFW4 Rab27b-201ENSMUST00000069749 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nop58Q6DFW4 Pip5k1a-205ENSMUST00000107233 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nop58Q6DFW4 Dip2a-201ENSMUST00000036033 6322 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nop58Q6DFW4 Slc20a1-201ENSMUST00000028880 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nop58Q6DFW4 Trpm1-217ENSMUST00000206263 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nop58Q6DFW4 Ndel1-202ENSMUST00000101017 1646 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nop58Q6DFW4 Olfr177-202ENSMUST00000217377 2401 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nop58Q6DFW4 Gm24934-201ENSMUST00000103764 111 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Nop58Q6DFW4 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Nop58Q6DFW4 Gm13342-201ENSMUST00000121055 207 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Nop58Q6DFW4 Srrm3os-201ENSMUST00000131896 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nop58Q6DFW4 Gm13966-201ENSMUST00000148420 832 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nop58Q6DFW4 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nop58Q6DFW4 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nop58Q6DFW4 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nop58Q6DFW4 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Nop58Q6DFW4 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Nop58Q6DFW4 Lect2-202ENSMUST00000225183 823 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Nop58Q6DFW4 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Nop58Q6DFW4 Lect2-201ENSMUST00000062806 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nop58Q6DFW4 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nop58Q6DFW4 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nop58Q6DFW4 Gm28042-203ENSMUST00000156805 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nop58Q6DFW4 Cdc45-202ENSMUST00000096990 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nop58Q6DFW4 Prrxl1-204ENSMUST00000189022 2985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nop58Q6DFW4 Mfsd4b5-202ENSMUST00000073618 2978 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nop58Q6DFW4 Ehmt1-203ENSMUST00000102938 4680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nop58Q6DFW4 D930048N14Rik-202ENSMUST00000117859 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nop58Q6DFW4 Fut10-202ENSMUST00000110527 2327 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nop58Q6DFW4 Rap1gap-201ENSMUST00000047243 3247 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nop58Q6DFW4 Pnpla6-201ENSMUST00000004681 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nop58Q6DFW4 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nop58Q6DFW4 Tle6-210ENSMUST00000142948 1961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nop58Q6DFW4 Triobp-203ENSMUST00000109689 7187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nop58Q6DFW4 Prkd2-202ENSMUST00000168093 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nop58Q6DFW4 Tmem231-201ENSMUST00000034429 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nop58Q6DFW4 Myo15b-201ENSMUST00000040703 2825 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nop58Q6DFW4 Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 6961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nop58Q6DFW4 Slc7a3-201ENSMUST00000073927 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nop58Q6DFW4 Gm18806-201ENSMUST00000207607 1775 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Nop58Q6DFW4 Cdk15-201ENSMUST00000114248 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nop58Q6DFW4 Inpp4a-208ENSMUST00000137266 2934 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nop58Q6DFW4 Dusp10-201ENSMUST00000048655 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nop58Q6DFW4 Tuft1-201ENSMUST00000006123 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nop58Q6DFW4 Nfkbiz-202ENSMUST00000096026 4067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nop58Q6DFW4 Uprt-201ENSMUST00000087867 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nop58Q6DFW4 1700025G04Rik-201ENSMUST00000044581 9559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nop58Q6DFW4 Fndc8-201ENSMUST00000018988 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nop58Q6DFW4 Chd7-206ENSMUST00000170391 3462 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nop58Q6DFW4 Dok4-204ENSMUST00000212810 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nop58Q6DFW4 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nop58Q6DFW4 Fam166b-203ENSMUST00000107929 865 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nop58Q6DFW4 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Nop58Q6DFW4 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nop58Q6DFW4 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nop58Q6DFW4 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nop58Q6DFW4 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nop58Q6DFW4 AC099934.4-201ENSMUST00000220745 523 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nop58Q6DFW4 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nop58Q6DFW4 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Nop58Q6DFW4 Srrm2-201ENSMUST00000088621 8564 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nop58Q6DFW4 Snw1-201ENSMUST00000021428 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nop58Q6DFW4 Ece1-201ENSMUST00000102518 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nop58Q6DFW4 Als2-204ENSMUST00000163058 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nop58Q6DFW4 Kat7-205ENSMUST00000107734 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nop58Q6DFW4 Slc4a9-202ENSMUST00000115694 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nop58Q6DFW4 Gm19327-201ENSMUST00000220651 3271 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Nop58Q6DFW4 Mier1-204ENSMUST00000106857 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nop58Q6DFW4 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nop58Q6DFW4 Nrip3-201ENSMUST00000033331 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nop58Q6DFW4 Gm10829-201ENSMUST00000202084 2988 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Nop58Q6DFW4 Ddx54-201ENSMUST00000031598 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nop58Q6DFW4 Gem-202ENSMUST00000108304 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nop58Q6DFW4 Pde4c-201ENSMUST00000034307 3203 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nop58Q6DFW4 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nop58Q6DFW4 Fastkd5-201ENSMUST00000110262 3015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.6 ms