Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZL1

Fgd6, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,399 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fgd6Q69ZL1 Gm7168-201ENSMUST00000088809 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Fgd6Q69ZL1 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Fgd6Q69ZL1 Prf1-201ENSMUST00000035419 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Fgd6Q69ZL1 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Fgd6Q69ZL1 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Fgd6Q69ZL1 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Fgd6Q69ZL1 Gm9915-201ENSMUST00000066196 1383 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Fgd6Q69ZL1 Wnt3-201ENSMUST00000000127 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Fgd6Q69ZL1 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Fgd6Q69ZL1 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Fgd6Q69ZL1 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Fgd6Q69ZL1 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Fgd6Q69ZL1 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Fgd6Q69ZL1 Rasgrp4-205ENSMUST00000159975 2296 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Fgd6Q69ZL1 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Fgd6Q69ZL1 Gm12028-201ENSMUST00000118065 436 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Fgd6Q69ZL1 Gm24140-201ENSMUST00000122773 326 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Fgd6Q69ZL1 Gm5210-201ENSMUST00000182150 1010 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Fgd6Q69ZL1 Gm18014-201ENSMUST00000183369 817 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Fgd6Q69ZL1 Gm6370-202ENSMUST00000198912 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Fgd6Q69ZL1 Gm42689-201ENSMUST00000202403 404 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Fgd6Q69ZL1 Gm18065-201ENSMUST00000221395 526 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Fgd6Q69ZL1 AC129217.1-201ENSMUST00000225181 642 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Fgd6Q69ZL1 Pgk1-rs7-201ENSMUST00000085735 1255 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Fgd6Q69ZL1 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Fgd6Q69ZL1 Arntl2-202ENSMUST00000111636 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Fgd6Q69ZL1 Npy5r-202ENSMUST00000211920 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Fgd6Q69ZL1 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Fgd6Q69ZL1 Sirt5-201ENSMUST00000066804 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Fgd6Q69ZL1 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Fgd6Q69ZL1 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Fgd6Q69ZL1 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Fgd6Q69ZL1 Dcaf11-202ENSMUST00000117236 2538 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Fgd6Q69ZL1 Gm3764-205ENSMUST00000181134 2203 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Fgd6Q69ZL1 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Fgd6Q69ZL1 Ifi47-202ENSMUST00000109202 1773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Fgd6Q69ZL1 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Fgd6Q69ZL1 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Fgd6Q69ZL1 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Fgd6Q69ZL1 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Fgd6Q69ZL1 Aamdc-206ENSMUST00000136757 789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Fgd6Q69ZL1 Gm12056-201ENSMUST00000148364 1257 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Fgd6Q69ZL1 Gm17207-201ENSMUST00000168686 645 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Fgd6Q69ZL1 Gm18552-201ENSMUST00000187425 538 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Fgd6Q69ZL1 Gm5254-201ENSMUST00000188353 977 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Fgd6Q69ZL1 Mpzl1-203ENSMUST00000191818 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Fgd6Q69ZL1 Gm43106-201ENSMUST00000199485 637 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Fgd6Q69ZL1 Kcne3-206ENSMUST00000207995 439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Fgd6Q69ZL1 Gm45783-201ENSMUST00000210877 656 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Fgd6Q69ZL1 AC163703.1-201ENSMUST00000214133 339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Fgd6Q69ZL1 2310016G11Rik-201ENSMUST00000094460 992 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Fgd6Q69ZL1 H2-Q1-202ENSMUST00000105041 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Fgd6Q69ZL1 B230398E01Rik-201ENSMUST00000125186 1958 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Fgd6Q69ZL1 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Fgd6Q69ZL1 Hist1h2be-201ENSMUST00000051091 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Fgd6Q69ZL1 Aldoa-201ENSMUST00000032934 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Fgd6Q69ZL1 Kyat1-203ENSMUST00000113660 1388 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Fgd6Q69ZL1 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Fgd6Q69ZL1 Klk1b5-201ENSMUST00000074359 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Fgd6Q69ZL1 Calu-202ENSMUST00000090481 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Fgd6Q69ZL1 Gm8968-201ENSMUST00000199133 1303 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Fgd6Q69ZL1 Smarca1-205ENSMUST00000141084 1965 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Fgd6Q69ZL1 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Fgd6Q69ZL1 A230009B12Rik-202ENSMUST00000159602 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Fgd6Q69ZL1 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Fgd6Q69ZL1 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Fgd6Q69ZL1 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Fgd6Q69ZL1 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Fgd6Q69ZL1 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Fgd6Q69ZL1 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Fgd6Q69ZL1 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Fgd6Q69ZL1 Cd300ld5-201ENSMUST00000100239 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Fgd6Q69ZL1 Cd300ld4-201ENSMUST00000100240 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Fgd6Q69ZL1 Upp1-202ENSMUST00000101525 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Fgd6Q69ZL1 Mir1941-201ENSMUST00000157834 83 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Fgd6Q69ZL1 Gm27444-201ENSMUST00000184157 137 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Fgd6Q69ZL1 Kif4-ps-202ENSMUST00000185083 652 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Fgd6Q69ZL1 Vmn1r205-201ENSMUST00000185475 951 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Fgd6Q69ZL1 Gm19927-201ENSMUST00000185792 781 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Fgd6Q69ZL1 Gm28345-201ENSMUST00000188769 1139 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Fgd6Q69ZL1 Gm28970-201ENSMUST00000191098 1139 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Fgd6Q69ZL1 AC241616.1-201ENSMUST00000213741 166 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Fgd6Q69ZL1 AC140314.1-201ENSMUST00000219549 554 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Fgd6Q69ZL1 H2-Aa-201ENSMUST00000040655 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Fgd6Q69ZL1 Cd300ld3-201ENSMUST00000092459 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Fgd6Q69ZL1 Fthl17e-201ENSMUST00000096509 841 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Fgd6Q69ZL1 Wfdc8-202ENSMUST00000109338 1794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Fgd6Q69ZL1 Syk-202ENSMUST00000118756 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Fgd6Q69ZL1 Mgl2-205ENSMUST00000165951 1635 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Fgd6Q69ZL1 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Fgd6Q69ZL1 Adh5-201ENSMUST00000005964 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Fgd6Q69ZL1 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Fgd6Q69ZL1 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Fgd6Q69ZL1 6430571L13Rik-201ENSMUST00000042581 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Fgd6Q69ZL1 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Fgd6Q69ZL1 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Fgd6Q69ZL1 Acnat2-201ENSMUST00000081541 1664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Fgd6Q69ZL1 Efna1-203ENSMUST00000118860 1403 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Fgd6Q69ZL1 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Fgd6Q69ZL1 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.8 ms