Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZK6

Jmjd1c, Probable JmjC domain-containing histone demethylation protein 2C, mousemouse

Predictions only

Length 2,350 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Jmjd1cQ69ZK6 Grin1-207ENSMUST00000114317 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Jmjd1cQ69ZK6 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Jmjd1cQ69ZK6 Oprm1-205ENSMUST00000078634 1695 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Jmjd1cQ69ZK6 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Jmjd1cQ69ZK6 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Jmjd1cQ69ZK6 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Jmjd1cQ69ZK6 Gm15136-201ENSMUST00000120552 533 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Jmjd1cQ69ZK6 Gm13117-201ENSMUST00000120894 691 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Jmjd1cQ69ZK6 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Jmjd1cQ69ZK6 Tctex1d1-205ENSMUST00000140654 891 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Jmjd1cQ69ZK6 Gm11365-201ENSMUST00000144277 774 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Jmjd1cQ69ZK6 Chn2-209ENSMUST00000146114 1227 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Jmjd1cQ69ZK6 Pfdn5-203ENSMUST00000165671 830 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Jmjd1cQ69ZK6 Gm6548-201ENSMUST00000167498 1165 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Jmjd1cQ69ZK6 Gm6423-201ENSMUST00000204315 934 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Jmjd1cQ69ZK6 Gm45575-201ENSMUST00000210283 548 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Jmjd1cQ69ZK6 AC174797.2-201ENSMUST00000225835 165 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Jmjd1cQ69ZK6 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Jmjd1cQ69ZK6 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Jmjd1cQ69ZK6 Trappc8-202ENSMUST00000097658 2703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Jmjd1cQ69ZK6 Rabep1-203ENSMUST00000100928 3860 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Jmjd1cQ69ZK6 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Jmjd1cQ69ZK6 Drd3-201ENSMUST00000023390 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Jmjd1cQ69ZK6 Pex2-201ENSMUST00000059021 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Jmjd1cQ69ZK6 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Jmjd1cQ69ZK6 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Jmjd1cQ69ZK6 Gm17213-201ENSMUST00000165161 1360 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Jmjd1cQ69ZK6 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Jmjd1cQ69ZK6 Dnajb6-203ENSMUST00000114839 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Jmjd1cQ69ZK6 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Jmjd1cQ69ZK6 Rcor3-201ENSMUST00000073279 3748 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Jmjd1cQ69ZK6 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Jmjd1cQ69ZK6 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Jmjd1cQ69ZK6 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Jmjd1cQ69ZK6 Gm10479-201ENSMUST00000101568 318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Jmjd1cQ69ZK6 Gm23595-201ENSMUST00000104306 130 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Jmjd1cQ69ZK6 Gm22711-201ENSMUST00000116890 133 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Jmjd1cQ69ZK6 Gm22379-201ENSMUST00000157480 131 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Jmjd1cQ69ZK6 Gm18776-201ENSMUST00000188833 654 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Jmjd1cQ69ZK6 Gm42375-201ENSMUST00000206226 745 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Jmjd1cQ69ZK6 Gm33979-201ENSMUST00000219486 691 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Jmjd1cQ69ZK6 Gm36423-202ENSMUST00000222215 1298 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Jmjd1cQ69ZK6 Tspo2-201ENSMUST00000024794 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Jmjd1cQ69ZK6 Mir341-201ENSMUST00000093593 96 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Jmjd1cQ69ZK6 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Jmjd1cQ69ZK6 2610011E03Rik-201ENSMUST00000200128 2235 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Jmjd1cQ69ZK6 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Jmjd1cQ69ZK6 Gm18798-201ENSMUST00000187264 1700 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Jmjd1cQ69ZK6 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Jmjd1cQ69ZK6 Akap10-203ENSMUST00000108710 3394 ntTSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Jmjd1cQ69ZK6 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Jmjd1cQ69ZK6 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Jmjd1cQ69ZK6 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Jmjd1cQ69ZK6 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Jmjd1cQ69ZK6 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Jmjd1cQ69ZK6 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Jmjd1cQ69ZK6 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Jmjd1cQ69ZK6 Ppm1b-203ENSMUST00000112305 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Jmjd1cQ69ZK6 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Jmjd1cQ69ZK6 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Jmjd1cQ69ZK6 Hmox1-201ENSMUST00000005548 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Jmjd1cQ69ZK6 Rab11fip1-203ENSMUST00000209377 3769 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Jmjd1cQ69ZK6 Pigk-201ENSMUST00000045029 1761 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Jmjd1cQ69ZK6 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Jmjd1cQ69ZK6 Lins1-202ENSMUST00000077967 2647 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Jmjd1cQ69ZK6 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Jmjd1cQ69ZK6 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Jmjd1cQ69ZK6 Otx2-202ENSMUST00000119070 1708 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Jmjd1cQ69ZK6 Vsig10l-201ENSMUST00000107977 3836 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Jmjd1cQ69ZK6 Gm11663-201ENSMUST00000117888 290 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Jmjd1cQ69ZK6 n-R5s84-201ENSMUST00000122591 109 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Jmjd1cQ69ZK6 Gm11683-201ENSMUST00000147006 918 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Jmjd1cQ69ZK6 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Jmjd1cQ69ZK6 Gm17192-201ENSMUST00000169031 511 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Jmjd1cQ69ZK6 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Jmjd1cQ69ZK6 Mrpl23-ps1-201ENSMUST00000173086 580 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Jmjd1cQ69ZK6 Gm6606-201ENSMUST00000193613 947 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Jmjd1cQ69ZK6 Gm43547-201ENSMUST00000197729 328 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Jmjd1cQ69ZK6 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Jmjd1cQ69ZK6 Elp5-201ENSMUST00000108594 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Jmjd1cQ69ZK6 Cdc20b-201ENSMUST00000109244 1620 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Jmjd1cQ69ZK6 Tsga10-202ENSMUST00000088072 3837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Jmjd1cQ69ZK6 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Jmjd1cQ69ZK6 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Jmjd1cQ69ZK6 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Jmjd1cQ69ZK6 Olfr582-202ENSMUST00000210119 1787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Jmjd1cQ69ZK6 Pappa-201ENSMUST00000084501 11027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Jmjd1cQ69ZK6 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Jmjd1cQ69ZK6 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Jmjd1cQ69ZK6 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Jmjd1cQ69ZK6 AC158777.1-201ENSMUST00000226216 1724 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Jmjd1cQ69ZK6 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Jmjd1cQ69ZK6 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Jmjd1cQ69ZK6 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Jmjd1cQ69ZK6 Ccl1-202ENSMUST00000108189 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Jmjd1cQ69ZK6 Gm28826-201ENSMUST00000190006 488 ntTSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Jmjd1cQ69ZK6 A830092H15Rik-202ENSMUST00000195446 649 ntTSL 3 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Jmjd1cQ69ZK6 6720482G16Rik-201ENSMUST00000199552 1192 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Jmjd1cQ69ZK6 Fxyd7-202ENSMUST00000206341 620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Jmjd1cQ69ZK6 Gm8268-201ENSMUST00000209683 458 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms