Protein–RNA interactions for Protein: Q64705

Usf2, Upstream stimulatory factor 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 346 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usf2Q64705 Gm22058-201ENSMUST00000083393 310 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Usf2Q64705 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Usf2Q64705 Gm11559-201ENSMUST00000092694 1096 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Usf2Q64705 Epc1-201ENSMUST00000028100 3965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Usf2Q64705 Eif4a2-223ENSMUST00000168891 2203 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Usf2Q64705 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Usf2Q64705 Gm37613-201ENSMUST00000195677 3580 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Usf2Q64705 Mical2-202ENSMUST00000050149 6669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Usf2Q64705 Wdr78-203ENSMUST00000106868 4045 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Usf2Q64705 Pitpnm2os2-203ENSMUST00000198466 2467 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Usf2Q64705 Cenpj-203ENSMUST00000225951 4756 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Usf2Q64705 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Usf2Q64705 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Usf2Q64705 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Usf2Q64705 Son-204ENSMUST00000119368 7529 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Usf2Q64705 Myo18a-201ENSMUST00000000645 7307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Usf2Q64705 Pck2-201ENSMUST00000048781 3400 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Usf2Q64705 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Usf2Q64705 Col6a4-201ENSMUST00000121963 7371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Usf2Q64705 Asb6-201ENSMUST00000041726 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Usf2Q64705 Plekhg5-204ENSMUST00000118648 3818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Usf2Q64705 AC129336.2-201ENSMUST00000218053 3086 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Usf2Q64705 Cast-211ENSMUST00000223206 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Usf2Q64705 Slc9a8-201ENSMUST00000047815 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Usf2Q64705 Vwa5b2-202ENSMUST00000096197 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Usf2Q64705 Golga2-203ENSMUST00000113377 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Usf2Q64705 Ica1-204ENSMUST00000115520 1876 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Usf2Q64705 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Usf2Q64705 Lman1-201ENSMUST00000048260 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Usf2Q64705 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Usf2Q64705 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Usf2Q64705 Pnma5-202ENSMUST00000114540 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Usf2Q64705 Gtf2a1-202ENSMUST00000063314 2265 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Usf2Q64705 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Usf2Q64705 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Usf2Q64705 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Usf2Q64705 Gm14064-201ENSMUST00000134833 727 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Usf2Q64705 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Usf2Q64705 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Usf2Q64705 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Usf2Q64705 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Usf2Q64705 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Usf2Q64705 Prrxl1-204ENSMUST00000189022 2985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Usf2Q64705 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Usf2Q64705 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Usf2Q64705 Gm45484-201ENSMUST00000210310 1141 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Usf2Q64705 AC162938.2-203ENSMUST00000216604 1134 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Usf2Q64705 AC131743.2-201ENSMUST00000221031 968 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Usf2Q64705 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Usf2Q64705 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Usf2Q64705 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Usf2Q64705 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Usf2Q64705 Olfr54-201ENSMUST00000072152 942 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Usf2Q64705 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Usf2Q64705 Rnf214-208ENSMUST00000161187 2847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Usf2Q64705 Zcchc8-204ENSMUST00000196282 4350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Usf2Q64705 Mylip-202ENSMUST00000222178 1954 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Usf2Q64705 Stard4-201ENSMUST00000025236 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Usf2Q64705 Rasgrp4-208ENSMUST00000161522 3242 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Usf2Q64705 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Usf2Q64705 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Usf2Q64705 Fer1l5-202ENSMUST00000179162 6315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Usf2Q64705 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Usf2Q64705 Plekha7-207ENSMUST00000182511 4502 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Usf2Q64705 Gm43999-201ENSMUST00000204286 2889 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Usf2Q64705 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Usf2Q64705 Gm42141-201ENSMUST00000196534 2172 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Usf2Q64705 Fyb2-201ENSMUST00000106803 3136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Usf2Q64705 Gm37806-201ENSMUST00000194524 6387 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Usf2Q64705 Pnma2-201ENSMUST00000089236 5518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Usf2Q64705 Maob-201ENSMUST00000040820 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Usf2Q64705 Gfra1-209ENSMUST00000169850 3224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Usf2Q64705 Hoxa1-201ENSMUST00000000964 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Usf2Q64705 Hmbox1-202ENSMUST00000067843 2931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Usf2Q64705 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Usf2Q64705 Lsg1-201ENSMUST00000117363 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Usf2Q64705 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Usf2Q64705 Arhgap36-202ENSMUST00000114904 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Usf2Q64705 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Usf2Q64705 Rgs8-201ENSMUST00000041776 8474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Usf2Q64705 Kansl3-201ENSMUST00000010597 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Usf2Q64705 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Usf2Q64705 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Usf2Q64705 Zfp93-201ENSMUST00000032696 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Usf2Q64705 Abcg4-201ENSMUST00000034648 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Usf2Q64705 Btbd9-201ENSMUST00000079924 6657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Usf2Q64705 Enox1-203ENSMUST00000227662 3064 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Usf2Q64705 Hmgcll1-202ENSMUST00000117981 1189 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Usf2Q64705 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Usf2Q64705 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Usf2Q64705 Gm9630-201ENSMUST00000178304 885 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Usf2Q64705 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Usf2Q64705 Gm44702-201ENSMUST00000209194 592 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Usf2Q64705 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Usf2Q64705 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Usf2Q64705 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Usf2Q64705 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Usf2Q64705 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Usf2Q64705 Cd163-201ENSMUST00000032234 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Usf2Q64705 Ccdc189-201ENSMUST00000072155 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.4 ms