Protein–RNA interactions for Protein: Q64674

Srm, Spermidine synthase, mousemouse

Predictions only

Length 302 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrmQ64674 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
SrmQ64674 Tceal8-204ENSMUST00000163584 2358 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
SrmQ64674 Nnt-201ENSMUST00000069902 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
SrmQ64674 Tmem25-202ENSMUST00000114705 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
SrmQ64674 Dtx3l-202ENSMUST00000114885 2648 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
SrmQ64674 Slc25a48-201ENSMUST00000021971 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
SrmQ64674 Gaa-201ENSMUST00000026666 3363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
SrmQ64674 Hs6st2-201ENSMUST00000088172 4318 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
SrmQ64674 Gm9796-201ENSMUST00000062249 2250 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
SrmQ64674 Rsc1a1-201ENSMUST00000105782 1749 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.77
SrmQ64674 Acad8-202ENSMUST00000120367 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
SrmQ64674 Togaram1-207ENSMUST00000223166 6386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
SrmQ64674 Plekhg4-206ENSMUST00000214056 3654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
SrmQ64674 AC154671.1-201ENSMUST00000228617 1578 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
SrmQ64674 Dnmt3a-218ENSMUST00000174817 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
SrmQ64674 Slc45a2-201ENSMUST00000117100 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
SrmQ64674 Wt1os-203ENSMUST00000172701 2960 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
SrmQ64674 4930431P19Rik-202ENSMUST00000207761 2959 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
SrmQ64674 Kcnma1-205ENSMUST00000145596 12094 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
SrmQ64674 Pip5k1a-204ENSMUST00000107232 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
SrmQ64674 Camkk1-201ENSMUST00000092937 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
SrmQ64674 Tmod2-201ENSMUST00000064433 9884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
SrmQ64674 Nap1l3-201ENSMUST00000079490 2837 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
SrmQ64674 Ndel1-202ENSMUST00000101017 1646 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
SrmQ64674 Eef1d-205ENSMUST00000109972 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
SrmQ64674 Pcdhgb4-202ENSMUST00000195363 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
SrmQ64674 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
SrmQ64674 Zscan10-201ENSMUST00000095595 2698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
SrmQ64674 Pde1c-201ENSMUST00000044505 3907 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
SrmQ64674 Ift46-201ENSMUST00000002099 4169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
SrmQ64674 Hnrnpa2b1-202ENSMUST00000090002 1662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
SrmQ64674 Gm13990-201ENSMUST00000151391 2701 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
SrmQ64674 Gm13142-201ENSMUST00000117213 1453 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
SrmQ64674 Pif1-203ENSMUST00000134538 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
SrmQ64674 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
SrmQ64674 Gm9431-201ENSMUST00000119765 1051 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
SrmQ64674 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
SrmQ64674 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
SrmQ64674 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
SrmQ64674 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
SrmQ64674 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
SrmQ64674 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
SrmQ64674 Gm42937-201ENSMUST00000197360 752 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
SrmQ64674 Gm20425-201ENSMUST00000166836 3028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
SrmQ64674 Kcnk18-201ENSMUST00000065204 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
SrmQ64674 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
SrmQ64674 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
SrmQ64674 Trim23-203ENSMUST00000069187 3546 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
SrmQ64674 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
SrmQ64674 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
SrmQ64674 Pla2g4a-201ENSMUST00000070200 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
SrmQ64674 Plcd4-206ENSMUST00000113750 2692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
SrmQ64674 Gm7642-201ENSMUST00000216345 1809 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
SrmQ64674 Cklf-202ENSMUST00000098464 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
SrmQ64674 Tcof1-202ENSMUST00000175934 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
SrmQ64674 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
SrmQ64674 Lck-208ENSMUST00000167288 2074 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
SrmQ64674 Gm26846-201ENSMUST00000181865 4869 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
SrmQ64674 Gm8155-201ENSMUST00000216363 1612 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
SrmQ64674 Smc4-202ENSMUST00000107803 3983 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
SrmQ64674 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
SrmQ64674 Sfrp4-203ENSMUST00000222464 4049 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
SrmQ64674 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC10.25□□□□□ -0.77
SrmQ64674 Rimbp2-204ENSMUST00000198941 6446 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
SrmQ64674 Spg20-202ENSMUST00000107971 3567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
SrmQ64674 Ptpn11-201ENSMUST00000054547 5535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
SrmQ64674 Srp54a-207ENSMUST00000110708 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
SrmQ64674 Ces4a-201ENSMUST00000161289 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
SrmQ64674 Fbxo40-201ENSMUST00000075869 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
SrmQ64674 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
SrmQ64674 Umad1-201ENSMUST00000159168 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
SrmQ64674 Cacna1s-202ENSMUST00000112068 6018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
SrmQ64674 Dennd4a-201ENSMUST00000038890 8645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
SrmQ64674 Rpap1-202ENSMUST00000099529 4813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
SrmQ64674 Tex45-203ENSMUST00000161680 1526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
SrmQ64674 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC10.25□□□□□ -0.77
SrmQ64674 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
SrmQ64674 1700121N20Rik-201ENSMUST00000167922 1027 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
SrmQ64674 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
SrmQ64674 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC10.25□□□□□ -0.77
SrmQ64674 Gm27023-201ENSMUST00000182372 285 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
SrmQ64674 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
SrmQ64674 Olfr1415-203ENSMUST00000204766 403 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
SrmQ64674 Gm44711-201ENSMUST00000205414 1264 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
SrmQ64674 1700028J19Rik-201ENSMUST00000037220 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
SrmQ64674 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
SrmQ64674 Lgals1-201ENSMUST00000089377 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
SrmQ64674 4932443L11Rik-202ENSMUST00000177130 2827 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
SrmQ64674 Brd3-201ENSMUST00000028282 5419 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
SrmQ64674 Pcnt-201ENSMUST00000001179 9331 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
SrmQ64674 Gm20089-201ENSMUST00000192391 2084 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
SrmQ64674 Olfr1495-203ENSMUST00000216980 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
SrmQ64674 Rnf41-201ENSMUST00000096386 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
SrmQ64674 Gm8146-201ENSMUST00000192106 1847 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
SrmQ64674 4632404M16Rik-201ENSMUST00000197326 2882 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
SrmQ64674 Gm37131-201ENSMUST00000192502 1561 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
SrmQ64674 Prx-201ENSMUST00000065487 4497 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
SrmQ64674 Tapbpl-201ENSMUST00000043422 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
SrmQ64674 Maml2-202ENSMUST00000159294 6404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
SrmQ64674 Nol6-201ENSMUST00000030138 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
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