Protein–RNA interactions for Protein: Q64487

Ptprd, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, mousemouse

Predictions only

Length 1,912 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprdQ64487 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
PtprdQ64487 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
PtprdQ64487 Fyb2-201ENSMUST00000106803 3136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
PtprdQ64487 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
PtprdQ64487 Vmn1r38-201ENSMUST00000226457 3462 ntAPPRIS P1 BASIC11.73□□□□□ -0.53
PtprdQ64487 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
PtprdQ64487 Tapbpl-201ENSMUST00000043422 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
PtprdQ64487 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
PtprdQ64487 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
PtprdQ64487 Nuak2-202ENSMUST00000082125 3107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
PtprdQ64487 Pink1-202ENSMUST00000105816 1465 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
PtprdQ64487 Gm43102-201ENSMUST00000201004 2324 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
PtprdQ64487 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
PtprdQ64487 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
PtprdQ64487 Bub1-201ENSMUST00000028858 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
PtprdQ64487 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
PtprdQ64487 Gm11500-201ENSMUST00000118237 601 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
PtprdQ64487 Gm12030-201ENSMUST00000121917 223 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
PtprdQ64487 Gm20392-201ENSMUST00000173047 701 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
PtprdQ64487 Gm7137-201ENSMUST00000180161 711 ntAPPRIS P1 BASIC11.72□□□□□ -0.53
PtprdQ64487 Gm27910-201ENSMUST00000185004 107 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
PtprdQ64487 Gm29164-201ENSMUST00000185454 1024 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
PtprdQ64487 Gm29410-201ENSMUST00000188383 694 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
PtprdQ64487 Cabcoco1-201ENSMUST00000020103 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
PtprdQ64487 Gm43852-201ENSMUST00000202098 917 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
PtprdQ64487 Gm18561-201ENSMUST00000206027 804 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
PtprdQ64487 AC154257.1-202ENSMUST00000224729 843 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
PtprdQ64487 Higd2a-201ENSMUST00000026986 648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
PtprdQ64487 Gm10135-201ENSMUST00000043711 252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
PtprdQ64487 Gm29609-201ENSMUST00000101411 3223 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
PtprdQ64487 4930555B11Rik-201ENSMUST00000123210 1533 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
PtprdQ64487 AC130823.1-201ENSMUST00000228929 1549 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
PtprdQ64487 Rpl4-201ENSMUST00000034966 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
PtprdQ64487 Cdv3-203ENSMUST00000116517 3741 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
PtprdQ64487 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
PtprdQ64487 Tcn2-203ENSMUST00000109989 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
PtprdQ64487 Tmcc3os-201ENSMUST00000146744 2912 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
PtprdQ64487 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
PtprdQ64487 Esrp1-201ENSMUST00000043781 3743 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
PtprdQ64487 Eif4a2-223ENSMUST00000168891 2203 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
PtprdQ64487 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
PtprdQ64487 Trpv4-205ENSMUST00000112225 3226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
PtprdQ64487 Gpcpd1-204ENSMUST00000110136 3546 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
PtprdQ64487 Dclk1-215ENSMUST00000200352 1662 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
PtprdQ64487 Ighv10-1-201ENSMUST00000103492 359 ntAPPRIS P1 BASIC11.72□□□□□ -0.53
PtprdQ64487 Ifna2-201ENSMUST00000105147 1032 ntAPPRIS P1 BASIC11.72□□□□□ -0.53
PtprdQ64487 Gm14892-201ENSMUST00000117636 267 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
PtprdQ64487 Gm8111-201ENSMUST00000117659 987 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
PtprdQ64487 Gm14585-201ENSMUST00000120713 634 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
PtprdQ64487 Parvaos-201ENSMUST00000154848 1285 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
PtprdQ64487 Mir6998-201ENSMUST00000183343 64 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
PtprdQ64487 Gm42816-201ENSMUST00000198433 325 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
PtprdQ64487 Gm45717-201ENSMUST00000211129 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.72□□□□□ -0.53
PtprdQ64487 AC122891.1-201ENSMUST00000218671 268 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
PtprdQ64487 CT010506.1-201ENSMUST00000223673 349 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
PtprdQ64487 Prrxl1-205ENSMUST00000228878 723 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
PtprdQ64487 Sssca1-201ENSMUST00000025885 693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
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PtprdQ64487 Rps18-ps3-201ENSMUST00000080443 456 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
PtprdQ64487 Gm45416-201ENSMUST00000209713 2201 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
PtprdQ64487 Ceacam18-201ENSMUST00000032663 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
PtprdQ64487 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
PtprdQ64487 Otx2-202ENSMUST00000119070 1708 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
PtprdQ64487 Platr25-207ENSMUST00000222477 1705 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
PtprdQ64487 Slc26a6-201ENSMUST00000098376 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
PtprdQ64487 Oard1-202ENSMUST00000167180 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
PtprdQ64487 Ubxn10-201ENSMUST00000105809 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
PtprdQ64487 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
PtprdQ64487 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
PtprdQ64487 Lgr5-208ENSMUST00000173740 2508 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
PtprdQ64487 4833422C13Rik-202ENSMUST00000160385 2828 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
PtprdQ64487 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
PtprdQ64487 Mamld1-202ENSMUST00000114629 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
PtprdQ64487 E430018J23Rik-203ENSMUST00000165495 3324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
PtprdQ64487 Enpp7-202ENSMUST00000106273 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
PtprdQ64487 Gm15528-201ENSMUST00000117821 864 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
PtprdQ64487 Gm1848-201ENSMUST00000120711 789 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
PtprdQ64487 Spdye4a-202ENSMUST00000160502 1245 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
PtprdQ64487 1700003I16Rik-201ENSMUST00000205198 1058 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
PtprdQ64487 Folr2-203ENSMUST00000210598 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
PtprdQ64487 Gm30671-201ENSMUST00000214898 318 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
PtprdQ64487 Acy1-211ENSMUST00000216400 1030 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
PtprdQ64487 Tff2-201ENSMUST00000024826 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
PtprdQ64487 Sparcl1-201ENSMUST00000031249 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
PtprdQ64487 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC11.71□□□□□ -0.53
PtprdQ64487 Gm9873-201ENSMUST00000063891 1097 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
PtprdQ64487 Rnf183-201ENSMUST00000079420 573 ntAPPRIS P1 BASIC11.71□□□□□ -0.53
PtprdQ64487 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
PtprdQ64487 Olfr1047-201ENSMUST00000099901 960 ntAPPRIS P1 BASIC11.71□□□□□ -0.53
PtprdQ64487 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
PtprdQ64487 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
PtprdQ64487 Tbx4-203ENSMUST00000108047 3153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
PtprdQ64487 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
PtprdQ64487 Gm9415-201ENSMUST00000200462 1321 ntBASIC11.71□□□□□ -0.54
PtprdQ64487 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
PtprdQ64487 Ppp2r1b-202ENSMUST00000114437 3430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
PtprdQ64487 Sparc-201ENSMUST00000018737 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
PtprdQ64487 Gm10750-201ENSMUST00000099266 1506 ntAPPRIS P1 BASIC11.71□□□□□ -0.54
PtprdQ64487 Accs-202ENSMUST00000068513 1872 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
PtprdQ64487 Ikbkg-205ENSMUST00000114129 2222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
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