Protein–RNA interactions for Protein: Q61069

Usf1, Upstream stimulatory factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usf1Q61069 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Usf1Q61069 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Usf1Q61069 Myo18a-210ENSMUST00000130305 5450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Usf1Q61069 Gm12198-201ENSMUST00000154068 1809 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Usf1Q61069 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Usf1Q61069 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Usf1Q61069 Hist1h2bk-201ENSMUST00000110455 476 ntAPPRIS P1 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Usf1Q61069 Gm15036-201ENSMUST00000118880 400 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Usf1Q61069 Utp23-202ENSMUST00000136129 779 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Usf1Q61069 Gm13267-201ENSMUST00000142787 698 ntTSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Usf1Q61069 1700122E12Rik-202ENSMUST00000147538 479 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Usf1Q61069 Zfp667-204ENSMUST00000153840 596 ntTSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Usf1Q61069 Gm26047-201ENSMUST00000157308 113 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Usf1Q61069 Gm8451-201ENSMUST00000170338 447 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Usf1Q61069 Spdye4c-203ENSMUST00000178601 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Usf1Q61069 1700063K16Rik-201ENSMUST00000190306 369 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Usf1Q61069 A930036K24Rik-201ENSMUST00000194146 1200 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Usf1Q61069 Gm26047-202ENSMUST00000198840 115 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Usf1Q61069 Mpv17-206ENSMUST00000201353 846 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Usf1Q61069 Gm4924-205ENSMUST00000211099 490 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Usf1Q61069 Gm45338-206ENSMUST00000211460 1155 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Usf1Q61069 AC154572.1-201ENSMUST00000226098 1204 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Usf1Q61069 Lgi3-203ENSMUST00000226548 1001 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Usf1Q61069 Chmp3-202ENSMUST00000065364 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Usf1Q61069 Rps10-ps1-201ENSMUST00000074353 495 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Usf1Q61069 Gm7536-201ENSMUST00000077389 444 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Usf1Q61069 Gm5453-201ENSMUST00000080866 447 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Usf1Q61069 Ldb3-203ENSMUST00000022330 1586 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Usf1Q61069 Pcnt-202ENSMUST00000217838 9341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Usf1Q61069 Tfdp1-201ENSMUST00000170909 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Usf1Q61069 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Usf1Q61069 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Usf1Q61069 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Usf1Q61069 Mpp4-204ENSMUST00000186477 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Usf1Q61069 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Usf1Q61069 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Usf1Q61069 Psd2-201ENSMUST00000115716 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Usf1Q61069 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Usf1Q61069 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Usf1Q61069 Nr3c1-201ENSMUST00000025300 4989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Usf1Q61069 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Usf1Q61069 Ndufaf1-203ENSMUST00000110802 1308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Usf1Q61069 Gm11470-201ENSMUST00000118868 1475 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Usf1Q61069 Adcyap1r1-204ENSMUST00000165857 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Usf1Q61069 Cipc-208ENSMUST00000189246 1454 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Usf1Q61069 Anxa9-204ENSMUST00000164406 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Usf1Q61069 Olfm4-201ENSMUST00000088735 1640 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Usf1Q61069 Cyth3-201ENSMUST00000110727 2068 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Usf1Q61069 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Usf1Q61069 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Usf1Q61069 Abi2-205ENSMUST00000187709 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Usf1Q61069 Armc5-201ENSMUST00000044660 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Usf1Q61069 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Usf1Q61069 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Usf1Q61069 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Usf1Q61069 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
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Usf1Q61069 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
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Usf1Q61069 Cdc42se1-203ENSMUST00000107200 637 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
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Usf1Q61069 Pttg1-205ENSMUST00000118368 696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
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Usf1Q61069 Gzmc-201ENSMUST00000015585 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
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Usf1Q61069 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Usf1Q61069 N4bp2l1-201ENSMUST00000016279 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Usf1Q61069 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Usf1Q61069 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Usf1Q61069 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Usf1Q61069 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Usf1Q61069 Fyn-207ENSMUST00000146287 2135 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Usf1Q61069 H2-T10-201ENSMUST00000166442 1481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Usf1Q61069 Tle6-210ENSMUST00000142948 1961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Usf1Q61069 Gm12766-201ENSMUST00000140298 1823 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Usf1Q61069 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Usf1Q61069 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Usf1Q61069 Itgb4-204ENSMUST00000106460 5919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Usf1Q61069 AC160405.1-201ENSMUST00000218207 1545 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Usf1Q61069 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Usf1Q61069 Triobp-203ENSMUST00000109689 7187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Usf1Q61069 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Usf1Q61069 Mob1a-201ENSMUST00000038658 4119 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Usf1Q61069 AF529169-201ENSMUST00000044491 7202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Usf1Q61069 Ephx1-201ENSMUST00000036928 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Usf1Q61069 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Usf1Q61069 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Usf1Q61069 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Usf1Q61069 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.5 ms