Protein–RNA interactions for Protein: Q5DTT3

Fam208b, Protein FAM208B, mousemouse

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Length 2,382 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam208bQ5DTT3 Samd13-202ENSMUST00000125965 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Fam208bQ5DTT3 Pcsk7-209ENSMUST00000216672 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Fam208bQ5DTT3 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Fam208bQ5DTT3 Megf11-203ENSMUST00000118485 3944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Fam208bQ5DTT3 Gm23912-201ENSMUST00000104687 87 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Fam208bQ5DTT3 Gsg1-202ENSMUST00000111909 1087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Fam208bQ5DTT3 Gm15004-201ENSMUST00000119192 630 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Fam208bQ5DTT3 Gm13572-201ENSMUST00000153675 559 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Fam208bQ5DTT3 Gm20400-201ENSMUST00000173695 665 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Fam208bQ5DTT3 2700099C18Rik-202ENSMUST00000182402 1275 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Fam208bQ5DTT3 H2-Bl-203ENSMUST00000183999 358 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Fam208bQ5DTT3 Gm9916-201ENSMUST00000192943 1228 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Fam208bQ5DTT3 Pmvk-204ENSMUST00000198440 978 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Fam208bQ5DTT3 1700026F02Rik-203ENSMUST00000211950 1082 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Fam208bQ5DTT3 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Fam208bQ5DTT3 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Fam208bQ5DTT3 AC166574.4-201ENSMUST00000227165 1937 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Fam208bQ5DTT3 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Fam208bQ5DTT3 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Fam208bQ5DTT3 Zbtb42-201ENSMUST00000169593 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Fam208bQ5DTT3 Acnat1-202ENSMUST00000107697 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Fam208bQ5DTT3 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Fam208bQ5DTT3 Gm6655-201ENSMUST00000201932 1309 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Fam208bQ5DTT3 Bckdk-201ENSMUST00000071056 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Fam208bQ5DTT3 Esr1-201ENSMUST00000067086 4344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Fam208bQ5DTT3 Crybg2-201ENSMUST00000121391 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Fam208bQ5DTT3 Col6a6-202ENSMUST00000098441 8781 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Fam208bQ5DTT3 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Fam208bQ5DTT3 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Fam208bQ5DTT3 Rab11fip5-201ENSMUST00000060837 4035 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Fam208bQ5DTT3 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Fam208bQ5DTT3 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Fam208bQ5DTT3 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Fam208bQ5DTT3 Gm2238-201ENSMUST00000192074 3669 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Fam208bQ5DTT3 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Fam208bQ5DTT3 Adipor2-202ENSMUST00000169744 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Fam208bQ5DTT3 Cd55b-202ENSMUST00000119432 986 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Fam208bQ5DTT3 Gm13019-201ENSMUST00000120000 276 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Fam208bQ5DTT3 Gm14993-201ENSMUST00000121180 164 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Fam208bQ5DTT3 Mir1905-201ENSMUST00000122779 82 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Fam208bQ5DTT3 Txnrd2-205ENSMUST00000126778 491 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Fam208bQ5DTT3 Tsc22d1-207ENSMUST00000140251 670 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Fam208bQ5DTT3 Gm10100-201ENSMUST00000179726 363 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Fam208bQ5DTT3 Mir99ahg-209ENSMUST00000182820 835 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Fam208bQ5DTT3 Gm9135-201ENSMUST00000182963 990 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Fam208bQ5DTT3 Gm38117-201ENSMUST00000194653 939 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Fam208bQ5DTT3 Gm45527-201ENSMUST00000211052 774 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Fam208bQ5DTT3 Gm9661-201ENSMUST00000221611 1122 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Fam208bQ5DTT3 AC164618.2-201ENSMUST00000224770 573 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Fam208bQ5DTT3 Pcgf5-204ENSMUST00000224772 1266 ntAPPRIS ALT1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Fam208bQ5DTT3 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Fam208bQ5DTT3 Gm2174-201ENSMUST00000079663 402 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Fam208bQ5DTT3 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Fam208bQ5DTT3 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Fam208bQ5DTT3 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Fam208bQ5DTT3 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Fam208bQ5DTT3 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Fam208bQ5DTT3 Arhgap27-204ENSMUST00000107024 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Fam208bQ5DTT3 Tmbim1-202ENSMUST00000113796 11011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Fam208bQ5DTT3 Extl3-203ENSMUST00000225633 6013 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Fam208bQ5DTT3 E330011O21Rik-202ENSMUST00000209498 1403 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Fam208bQ5DTT3 Catsper3-201ENSMUST00000021961 1330 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Fam208bQ5DTT3 Ttc14-201ENSMUST00000099153 9661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Fam208bQ5DTT3 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Fam208bQ5DTT3 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Fam208bQ5DTT3 Spats2l-206ENSMUST00000167085 3929 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Fam208bQ5DTT3 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Fam208bQ5DTT3 Prx-202ENSMUST00000098644 4841 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Fam208bQ5DTT3 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Fam208bQ5DTT3 Sema6d-207ENSMUST00000103240 4372 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Fam208bQ5DTT3 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Fam208bQ5DTT3 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Fam208bQ5DTT3 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Fam208bQ5DTT3 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Fam208bQ5DTT3 Gas5-224ENSMUST00000162558 502 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Fam208bQ5DTT3 1700086D15Rik-201ENSMUST00000020855 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Fam208bQ5DTT3 Isoc2b-205ENSMUST00000208816 820 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Fam208bQ5DTT3 Cplx3-203ENSMUST00000217015 540 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Fam208bQ5DTT3 AC153962.2-201ENSMUST00000219417 550 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Fam208bQ5DTT3 Bloc1s1-201ENSMUST00000026405 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Fam208bQ5DTT3 Pla2g1b-201ENSMUST00000031495 557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Fam208bQ5DTT3 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Fam208bQ5DTT3 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Fam208bQ5DTT3 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Fam208bQ5DTT3 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Fam208bQ5DTT3 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Fam208bQ5DTT3 Chit1-203ENSMUST00000160060 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Fam208bQ5DTT3 Tfdp1-201ENSMUST00000170909 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Fam208bQ5DTT3 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Fam208bQ5DTT3 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Fam208bQ5DTT3 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Fam208bQ5DTT3 Slc1a4-202ENSMUST00000109594 3926 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Fam208bQ5DTT3 Spata18-203ENSMUST00000113548 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Fam208bQ5DTT3 Nxf2-202ENSMUST00000113187 2316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Fam208bQ5DTT3 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Fam208bQ5DTT3 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Fam208bQ5DTT3 Ypel4-201ENSMUST00000090729 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Fam208bQ5DTT3 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Fam208bQ5DTT3 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Fam208bQ5DTT3 Trav11-201ENSMUST00000103585 343 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
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